RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507407.1

SLC9A3-202, Transcript of solute carrier family 9 member A3, humanhuman

TSL 3

Gene SLC9A3, Length 587 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3-202ENST00000507407 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.64■■■□□ 2.01
SLC9A3-202ENST00000507407 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
SLC9A3-202ENST00000507407 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.62■■■□□ 2.01
SLC9A3-202ENST00000507407 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
SLC9A3-202ENST00000507407 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.48■■□□□ 1.99
SLC9A3-202ENST00000507407 IQGAP2Q13576 1575 aa27.39■■□□□ 1.97
SLC9A3-202ENST00000507407 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC9A3-202ENST00000507407 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
SLC9A3-202ENST00000507407 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.29■■□□□ 1.96
SLC9A3-202ENST00000507407 PTPRGP23470 1445 aa27.29■■□□□ 1.96
SLC9A3-202ENST00000507407 PRXQ9BXM0 1461 aa27.29■■□□□ 1.96
SLC9A3-202ENST00000507407 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.24■■□□□ 1.95
SLC9A3-202ENST00000507407 EEA1Q15075 1411 aa27.24■■□□□ 1.95
SLC9A3-202ENST00000507407 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.23■■□□□ 1.95
SLC9A3-202ENST00000507407 DISP1Q96F81 1524 aa27.2■■□□□ 1.94
SLC9A3-202ENST00000507407 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.19■■□□□ 1.94
SLC9A3-202ENST00000507407 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.17■■□□□ 1.94
SLC9A3-202ENST00000507407 MAPKBP1O60336 1514 aa27.16■■□□□ 1.94
SLC9A3-202ENST00000507407 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.93
SLC9A3-202ENST00000507407 GOLGA3Q08378 1498 aa27.13■■□□□ 1.93
SLC9A3-202ENST00000507407 KIAA0556O60303 1618 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC9A3-202ENST00000507407 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.1■■□□□ 1.93
SLC9A3-202ENST00000507407 UACAQ9BZF9 1416 aa27.09■■□□□ 1.93
SLC9A3-202ENST00000507407 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC9A3-202ENST00000507407 ABCC2Q92887 1545 aa27.07■■□□□ 1.92
SLC9A3-202ENST00000507407 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.05■■□□□ 1.92
SLC9A3-202ENST00000507407 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC9A3-202ENST00000507407 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.04■■□□□ 1.92
SLC9A3-202ENST00000507407 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
SLC9A3-202ENST00000507407 DIP2BQ9P265 1576 aa26.97■■□□□ 1.91
SLC9A3-202ENST00000507407 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.95■■□□□ 1.91
SLC9A3-202ENST00000507407 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.95■■□□□ 1.9
SLC9A3-202ENST00000507407 ASXL2Q76L83 1435 aa26.91■■□□□ 1.9
SLC9A3-202ENST00000507407 KIF21BO75037 1637 aa26.89■■□□□ 1.9
SLC9A3-202ENST00000507407 ABCA8O94911 1581 aa26.84■■□□□ 1.89
SLC9A3-202ENST00000507407 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SLC9A3-202ENST00000507407 GLI2P10070 1586 aa26.83■■□□□ 1.89
SLC9A3-202ENST00000507407 SAMD9Q5K651 1589 aa26.82■■□□□ 1.88
SLC9A3-202ENST00000507407 P3H3Q8IVL6 736 aa26.81■■□□□ 1.88
SLC9A3-202ENST00000507407 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
SLC9A3-202ENST00000507407 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.74■■□□□ 1.87
SLC9A3-202ENST00000507407 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SLC9A3-202ENST00000507407 TSPOAP1O95153 1857 aa26.71■■□□□ 1.87
SLC9A3-202ENST00000507407 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.7■■□□□ 1.87
SLC9A3-202ENST00000507407 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SLC9A3-202ENST00000507407 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC9A3-202ENST00000507407 ATP10BO94823 1461 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC9A3-202ENST00000507407 KDM6BO15054 1643 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC9A3-202ENST00000507407 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC9A3-202ENST00000507407 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC9A3-202ENST00000507407 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC9A3-202ENST00000507407 KCNH8Q96L42 1107 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC9A3-202ENST00000507407 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
SLC9A3-202ENST00000507407 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC9A3-202ENST00000507407 ARID3CA6NKF2 412 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC9A3-202ENST00000507407 CD109Q6YHK3 1445 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC9A3-202ENST00000507407 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC9A3-202ENST00000507407 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC9A3-202ENST00000507407 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC9A3-202ENST00000507407 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SLC9A3-202ENST00000507407 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC9A3-202ENST00000507407 FMN1Q68DA7 1419 aa26.49■■□□□ 1.83
SLC9A3-202ENST00000507407 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.47■■□□□ 1.83
SLC9A3-202ENST00000507407 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-202ENST00000507407 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.46■■□□□ 1.83
SLC9A3-202ENST00000507407 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.41■■□□□ 1.82
SLC9A3-202ENST00000507407 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SLC9A3-202ENST00000507407 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.39■■□□□ 1.82
SLC9A3-202ENST00000507407 HECW1Q76N89 1606 aa26.33■■□□□ 1.81
SLC9A3-202ENST00000507407 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SLC9A3-202ENST00000507407 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SLC9A3-202ENST00000507407 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.31■■□□□ 1.8
SLC9A3-202ENST00000507407 NEO1Q92859 1461 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC9A3-202ENST00000507407 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SLC9A3-202ENST00000507407 CLIP1P30622 1438 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC9A3-202ENST00000507407 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC9A3-202ENST00000507407 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
SLC9A3-202ENST00000507407 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC9A3-202ENST00000507407 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC9A3-202ENST00000507407 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC9A3-202ENST00000507407 FANCAO15360 1455 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC9A3-202ENST00000507407 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 PLCH2O75038 1416 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 AKNAQ7Z591 1439 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 RAPGEF3O95398 923 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 KIF14Q15058 1648 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC9A3-202ENST00000507407 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-202ENST00000507407 ADGRL1O94910 1474 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC9A3-202ENST00000507407 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.06■■□□□ 1.76
SLC9A3-202ENST00000507407 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC9A3-202ENST00000507407 CEP162Q5TB80 1403 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC9A3-202ENST00000507407 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26■■□□□ 1.75
SLC9A3-202ENST00000507407 RICTORQ6R327 1708 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC9A3-202ENST00000507407 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC9A3-202ENST00000507407 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC9A3-202ENST00000507407 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.93■■□□□ 1.74
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