RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PGGT1B-204ENST00000503638 CUL7Q14999 1698 aa22.25■■□□□ 1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 GRIN2AQ12879 1464 aa22.22■■□□□ 1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.21■■□□□ 1.15
PGGT1B-204ENST00000503638 EEA1Q15075 1411 aa22.19■■□□□ 1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.16■■□□□ 1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.15■■□□□ 1.14
PGGT1B-204ENST00000503638 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.11■■□□□ 1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 CEP170Q5SW79 1584 aa22.08■■□□□ 1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 ADRA2BP18089 450 aa22.08■■□□□ 1.13
PGGT1B-204ENST00000503638 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.06■■□□□ 1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.06■■□□□ 1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 NUP160Q12769 1436 aa22.06■■□□□ 1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 PRXQ9BXM0 1461 aa22.03■■□□□ 1.12
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.94■■□□□ 1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF21BO75037 1637 aa21.93■■□□□ 1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 JPH4Q96JJ6 628 aa21.9■■□□□ 1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 IQGAP2Q13576 1575 aa21.9■■□□□ 1.1
PGGT1B-204ENST00000503638 GOLGA3Q08378 1498 aa21.89■■□□□ 1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.88■■□□□ 1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 SHROOM2Q13796 1616 aa21.84■■□□□ 1.09
PGGT1B-204ENST00000503638 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.77■■□□□ 1.08
PGGT1B-204ENST00000503638 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.73■■□□□ 1.07
PGGT1B-204ENST00000503638 P3H3Q8IVL6 736 aa21.69■■□□□ 1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.69■■□□□ 1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 KIAA0556O60303 1618 aa21.67■■□□□ 1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 DISP1Q96F81 1524 aa21.67■■□□□ 1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.67■■□□□ 1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.65■■□□□ 1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.64■■□□□ 1.06
PGGT1B-204ENST00000503638 PTPRGP23470 1445 aa21.63■■□□□ 1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 MSH5O43196 834 aa21.62■■□□□ 1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.61■■□□□ 1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
PGGT1B-204ENST00000503638 SAMD9Q5K651 1589 aa21.57■■□□□ 1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.57■■□□□ 1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.55■■□□□ 1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.55■■□□□ 1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 MAPKBP1O60336 1514 aa21.53■■□□□ 1.04
PGGT1B-204ENST00000503638 CLIP1P30622 1438 aa21.51■■□□□ 1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 DIP2BQ9P265 1576 aa21.49■■□□□ 1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.49■■□□□ 1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 CEP162Q5TB80 1403 aa21.47■■□□□ 1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 UACAQ9BZF9 1416 aa21.47■■□□□ 1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.46■■□□□ 1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.45■■□□□ 1.03
PGGT1B-204ENST00000503638 ARID3CA6NKF2 412 aa21.43■■□□□ 1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCC2Q92887 1545 aa21.41■■□□□ 1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 FMN1Q68DA7 1419 aa21.39■■□□□ 1.02
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCA8O94911 1581 aa21.38■■□□□ 1.01
PGGT1B-204ENST00000503638 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.38■■□□□ 1.01
PGGT1B-204ENST00000503638 TSPOAP1O95153 1857 aa21.37■■□□□ 1.01
PGGT1B-204ENST00000503638 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.37■■□□□ 1.01
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PGGT1B-204ENST00000503638 KDM6BO15054 1643 aa21.36■■□□□ 1.01
PGGT1B-204ENST00000503638 ASXL2Q76L83 1435 aa21.29■■□□□ 1
PGGT1B-204ENST00000503638 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
PGGT1B-204ENST00000503638 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.28■■□□□ 1
PGGT1B-204ENST00000503638 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
PGGT1B-204ENST00000503638 HECW1Q76N89 1606 aa21.27■■□□□ 1
PGGT1B-204ENST00000503638 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.22■□□□□ 0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP10BO94823 1461 aa21.22■□□□□ 0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PGGT1B-204ENST00000503638 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.2■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 GLI2P10070 1586 aa21.2■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNH8Q96L42 1107 aa21.18■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.17■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.16■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.15■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.14■□□□□ 0.98
PGGT1B-204ENST00000503638 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
PGGT1B-204ENST00000503638 ADGRL1O94910 1474 aa21.1■□□□□ 0.97
PGGT1B-204ENST00000503638 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.09■□□□□ 0.97
PGGT1B-204ENST00000503638 APLP2Q06481 763 aa21.08■□□□□ 0.97
PGGT1B-204ENST00000503638 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.07■□□□□ 0.96
PGGT1B-204ENST00000503638 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.01■□□□□ 0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 TEX14Q8IWB6 1497 aa21■□□□□ 0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF14Q15058 1648 aa20.98■□□□□ 0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 CFAP43Q8NDM7 1665 aa20.97■□□□□ 0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 TIAM1Q13009 1591 aa20.97■□□□□ 0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 CD109Q6YHK3 1445 aa20.96■□□□□ 0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa20.95■□□□□ 0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.93■□□□□ 0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.92■□□□□ 0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.91■□□□□ 0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 MAP3K1Q13233 1512 aa20.88■□□□□ 0.93
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