RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 JPH4Q96JJ6 628 aa42.27■■■■■ 4.36
CXCL3-202ENST00000502974 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.23■■■■■ 4.35
CXCL3-202ENST00000502974 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.09■■■■■ 4.33
CXCL3-202ENST00000502974 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
CXCL3-202ENST00000502974 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.99■■■■■ 4.31
CXCL3-202ENST00000502974 IQGAP2Q13576 1575 aa41.97■■■■■ 4.31
CXCL3-202ENST00000502974 PRXQ9BXM0 1461 aa41.85■■■■■ 4.29
CXCL3-202ENST00000502974 EEA1Q15075 1411 aa41.83■■■■■ 4.29
CXCL3-202ENST00000502974 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.83■■■■■ 4.29
CXCL3-202ENST00000502974 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.79■■■■■ 4.28
CXCL3-202ENST00000502974 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.76■■■■■ 4.28
CXCL3-202ENST00000502974 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
CXCL3-202ENST00000502974 PTPRGP23470 1445 aa41.7■■■■■ 4.27
CXCL3-202ENST00000502974 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.7■■■■■ 4.27
CXCL3-202ENST00000502974 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.7■■■■■ 4.27
CXCL3-202ENST00000502974 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.68■■■■■ 4.26
CXCL3-202ENST00000502974 DISP1Q96F81 1524 aa41.66■■■■■ 4.26
CXCL3-202ENST00000502974 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.66■■■■■ 4.26
CXCL3-202ENST00000502974 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.63■■■■■ 4.25
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0556O60303 1618 aa41.58■■■■■ 4.25
CXCL3-202ENST00000502974 MAPKBP1O60336 1514 aa41.48■■■■■ 4.23
CXCL3-202ENST00000502974 GOLGA3Q08378 1498 aa41.47■■■■■ 4.23
CXCL3-202ENST00000502974 KIF21BO75037 1637 aa41.44■■■■■ 4.22
CXCL3-202ENST00000502974 UACAQ9BZF9 1416 aa41.41■■■■■ 4.22
CXCL3-202ENST00000502974 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.41■■■■■ 4.22
CXCL3-202ENST00000502974 ABCC2Q92887 1545 aa41.39■■■■■ 4.22
CXCL3-202ENST00000502974 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.38■■■■■ 4.21
CXCL3-202ENST00000502974 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.33■■■■■ 4.21
CXCL3-202ENST00000502974 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.27■■■■■ 4.2
CXCL3-202ENST00000502974 DIP2BQ9P265 1576 aa41.27■■■■■ 4.2
CXCL3-202ENST00000502974 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.23■■■■■ 4.19
CXCL3-202ENST00000502974 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.18■■■■■ 4.18
CXCL3-202ENST00000502974 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.18■■■■■ 4.18
CXCL3-202ENST00000502974 ASXL2Q76L83 1435 aa41.16■■■■■ 4.18
CXCL3-202ENST00000502974 SAMD9Q5K651 1589 aa41.16■■■■■ 4.18
CXCL3-202ENST00000502974 P3H3Q8IVL6 736 aa41.14■■■■■ 4.18
CXCL3-202ENST00000502974 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.14■■■■■ 4.18
CXCL3-202ENST00000502974 ABCA8O94911 1581 aa41.12■■■■■ 4.17
CXCL3-202ENST00000502974 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.11■■■■■ 4.17
CXCL3-202ENST00000502974 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
CXCL3-202ENST00000502974 TSPOAP1O95153 1857 aa41■■■■■ 4.15
CXCL3-202ENST00000502974 GLI2P10070 1586 aa40.95■■■■■ 4.15
CXCL3-202ENST00000502974 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.93■■■■■ 4.14
CXCL3-202ENST00000502974 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP40.91■■■■■ 4.14
CXCL3-202ENST00000502974 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.91■■■■■ 4.14
CXCL3-202ENST00000502974 WDR7Q9Y4E6 1490 aa40.9■■■■■ 4.14
CXCL3-202ENST00000502974 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.87■■■■■ 4.13
CXCL3-202ENST00000502974 ARID3CA6NKF2 412 aa40.81■■■■■ 4.12
CXCL3-202ENST00000502974 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.77■■■■■ 4.12
CXCL3-202ENST00000502974 ATP10BO94823 1461 aa40.76■■■■■ 4.12
CXCL3-202ENST00000502974 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
CXCL3-202ENST00000502974 KDM6BO15054 1643 aa40.75■■■■■ 4.11
CXCL3-202ENST00000502974 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.7■■■■■ 4.11
CXCL3-202ENST00000502974 KCNH8Q96L42 1107 aa40.69■■■■■ 4.1
CXCL3-202ENST00000502974 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
CXCL3-202ENST00000502974 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
CXCL3-202ENST00000502974 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.64■■■■■ 4.1
CXCL3-202ENST00000502974 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.64■■■■■ 4.1
CXCL3-202ENST00000502974 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.62■■■■■ 4.09
CXCL3-202ENST00000502974 CD109Q6YHK3 1445 aa40.56■■■■■ 4.08
CXCL3-202ENST00000502974 FMN1Q68DA7 1419 aa40.55■■■■■ 4.08
CXCL3-202ENST00000502974 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.48■■■■■ 4.07
CXCL3-202ENST00000502974 CLIP1P30622 1438 aa40.44■■■■■ 4.06
CXCL3-202ENST00000502974 HECW1Q76N89 1606 aa40.43■■■■■ 4.06
CXCL3-202ENST00000502974 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.43■■■■■ 4.06
CXCL3-202ENST00000502974 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.41■■■■■ 4.06
CXCL3-202ENST00000502974 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
CXCL3-202ENST00000502974 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.37■■■■■ 4.05
CXCL3-202ENST00000502974 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
CXCL3-202ENST00000502974 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.3■■■■■ 4.04
CXCL3-202ENST00000502974 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CXCL3-202ENST00000502974 CEP162Q5TB80 1403 aa40.25■■■■■ 4.03
CXCL3-202ENST00000502974 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
CXCL3-202ENST00000502974 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.2■■■■■ 4.03
CXCL3-202ENST00000502974 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.19■■■■■ 4.02
CXCL3-202ENST00000502974 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.18■■■■■ 4.02
CXCL3-202ENST00000502974 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.17■■■■■ 4.02
CXCL3-202ENST00000502974 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.16■■■■■ 4.02
CXCL3-202ENST00000502974 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.14■■■■■ 4.02
CXCL3-202ENST00000502974 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.14■■■■■ 4.02
CXCL3-202ENST00000502974 NEO1Q92859 1461 aa40.13■■■■■ 4.02
CXCL3-202ENST00000502974 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.12■■■■■ 4.01
CXCL3-202ENST00000502974 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.08■■■■■ 4.01
CXCL3-202ENST00000502974 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.04■■■■■ 4
CXCL3-202ENST00000502974 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
CXCL3-202ENST00000502974 KIF14Q15058 1648 aa40.02■■■■■ 4
CXCL3-202ENST00000502974 FANCAO15360 1455 aa40■■■■□ 3.99
CXCL3-202ENST00000502974 MYO5CQ9NQX4 1742 aa39.94■■■■□ 3.98
CXCL3-202ENST00000502974 AKNAQ7Z591 1439 aa39.93■■■■□ 3.98
CXCL3-202ENST00000502974 PLCH2O75038 1416 aa39.91■■■■□ 3.98
CXCL3-202ENST00000502974 RAPGEF3O95398 923 aa39.91■■■■□ 3.98
CXCL3-202ENST00000502974 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.9■■■■□ 3.98
CXCL3-202ENST00000502974 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.87■■■■□ 3.97
CXCL3-202ENST00000502974 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
CXCL3-202ENST00000502974 ADGRL1O94910 1474 aa39.85■■■■□ 3.97
CXCL3-202ENST00000502974 RICTORQ6R327 1708 aa39.81■■■■□ 3.96
CXCL3-202ENST00000502974 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.78■■■■□ 3.96
CXCL3-202ENST00000502974 ARHGAP5Q13017 1502 aa39.77■■■■□ 3.96
CXCL3-202ENST00000502974 VPS8Q8N3P4 1428 aa39.76■■■■□ 3.96
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