RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502816.1

TRIO-204, Transcript of trio Rho guanine nucleotide exchange factor, humanhuman

TSL 2

Gene TRIO, Length 736 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIO-204ENST00000502816 JPH4Q96JJ6 628 aa42.5■■■■■ 4.39
TRIO-204ENST00000502816 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.46■■■■■ 4.39
TRIO-204ENST00000502816 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.42■■■■■ 4.38
TRIO-204ENST00000502816 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.23■■■■■ 4.35
TRIO-204ENST00000502816 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.13■■■■■ 4.33
TRIO-204ENST00000502816 IQGAP2Q13576 1575 aa42.11■■■■■ 4.33
TRIO-204ENST00000502816 PRXQ9BXM0 1461 aa42.02■■■■■ 4.32
TRIO-204ENST00000502816 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.95■■■■■ 4.31
TRIO-204ENST00000502816 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.93■■■■■ 4.3
TRIO-204ENST00000502816 DISP1Q96F81 1524 aa41.89■■■■■ 4.3
TRIO-204ENST00000502816 ADCY10Q96PN6 1610 aa41.88■■■■■ 4.3
TRIO-204ENST00000502816 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.88■■■■■ 4.29
TRIO-204ENST00000502816 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.87■■■■■ 4.29
TRIO-204ENST00000502816 PTPRGP23470 1445 aa41.86■■■■■ 4.29
TRIO-204ENST00000502816 EEA1Q15075 1411 aa41.82■■■■■ 4.29
TRIO-204ENST00000502816 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.81■■■■■ 4.28
TRIO-204ENST00000502816 MAPKBP1O60336 1514 aa41.75■■■■■ 4.27
TRIO-204ENST00000502816 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP41.73■■■■■ 4.27
TRIO-204ENST00000502816 KIAA0556O60303 1618 aa41.72■■■■■ 4.27
TRIO-204ENST00000502816 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.68■■■■■ 4.26
TRIO-204ENST00000502816 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.66■■■■■ 4.26
TRIO-204ENST00000502816 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.64■■■■■ 4.26
TRIO-204ENST00000502816 GOLGA3Q08378 1498 aa41.6■■■■■ 4.25
TRIO-204ENST00000502816 UACAQ9BZF9 1416 aa41.6■■■■■ 4.25
TRIO-204ENST00000502816 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.6■■■■■ 4.25
TRIO-204ENST00000502816 ABCC2Q92887 1545 aa41.59■■■■■ 4.25
TRIO-204ENST00000502816 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
TRIO-204ENST00000502816 DIP2BQ9P265 1576 aa41.5■■■■■ 4.23
TRIO-204ENST00000502816 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.44■■■■■ 4.23
TRIO-204ENST00000502816 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.43■■■■■ 4.22
TRIO-204ENST00000502816 KIF21BO75037 1637 aa41.42■■■■■ 4.22
TRIO-204ENST00000502816 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
TRIO-204ENST00000502816 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.35■■■■■ 4.21
TRIO-204ENST00000502816 SAMD9Q5K651 1589 aa41.34■■■■■ 4.21
TRIO-204ENST00000502816 ASXL2Q76L83 1435 aa41.34■■■■■ 4.21
TRIO-204ENST00000502816 ABCA8O94911 1581 aa41.33■■■■■ 4.21
TRIO-204ENST00000502816 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
TRIO-204ENST00000502816 GLI2P10070 1586 aa41.25■■■■■ 4.19
TRIO-204ENST00000502816 P3H3Q8IVL6 736 aa41.14■■■■■ 4.18
TRIO-204ENST00000502816 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.13■■■■■ 4.17
TRIO-204ENST00000502816 TSPOAP1O95153 1857 aa41.09■■■■■ 4.17
TRIO-204ENST00000502816 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.07■■■■■ 4.16
TRIO-204ENST00000502816 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.04■■■■■ 4.16
TRIO-204ENST00000502816 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
TRIO-204ENST00000502816 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.01■■■■■ 4.16
TRIO-204ENST00000502816 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.99■■■■■ 4.15
TRIO-204ENST00000502816 ATP10BO94823 1461 aa40.97■■■■■ 4.15
TRIO-204ENST00000502816 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.95■■■■■ 4.15
TRIO-204ENST00000502816 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
TRIO-204ENST00000502816 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
TRIO-204ENST00000502816 KDM6BO15054 1643 aa40.9■■■■■ 4.14
TRIO-204ENST00000502816 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
TRIO-204ENST00000502816 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.82■■■■■ 4.13
TRIO-204ENST00000502816 TEX14Q8IWB6 1497 aa40.8■■■■■ 4.12
TRIO-204ENST00000502816 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.78■■■■■ 4.12
TRIO-204ENST00000502816 KCNH8Q96L42 1107 aa40.76■■■■■ 4.12
TRIO-204ENST00000502816 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.76■■■■■ 4.12
TRIO-204ENST00000502816 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.75■■■■■ 4.11
TRIO-204ENST00000502816 ARID3CA6NKF2 412 aa40.73■■■■■ 4.11
TRIO-204ENST00000502816 CD109Q6YHK3 1445 aa40.73■■■■■ 4.11
TRIO-204ENST00000502816 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP40.65■■■■■ 4.1
TRIO-204ENST00000502816 FMN1Q68DA7 1419 aa40.65■■■■■ 4.1
TRIO-204ENST00000502816 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.64■■■■■ 4.1
TRIO-204ENST00000502816 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
TRIO-204ENST00000502816 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.58■■■■■ 4.09
TRIO-204ENST00000502816 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.52■■■■■ 4.08
TRIO-204ENST00000502816 HECW1Q76N89 1606 aa40.49■■■■■ 4.07
TRIO-204ENST00000502816 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
TRIO-204ENST00000502816 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.44■■■■■ 4.06
TRIO-204ENST00000502816 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.42■■■■■ 4.06
TRIO-204ENST00000502816 NEO1Q92859 1461 aa40.36■■■■■ 4.05
TRIO-204ENST00000502816 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.05
TRIO-204ENST00000502816 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
TRIO-204ENST00000502816 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.31■■■■■ 4.04
TRIO-204ENST00000502816 CLIP1P30622 1438 aa40.31■■■■■ 4.04
TRIO-204ENST00000502816 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.3■■■■■ 4.04
TRIO-204ENST00000502816 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
TRIO-204ENST00000502816 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
TRIO-204ENST00000502816 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.25■■■■■ 4.03
TRIO-204ENST00000502816 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
TRIO-204ENST00000502816 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.21■■■■■ 4.03
TRIO-204ENST00000502816 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.17■■■■■ 4.02
TRIO-204ENST00000502816 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.17■■■■■ 4.02
TRIO-204ENST00000502816 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.17■■■■■ 4.02
TRIO-204ENST00000502816 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.17■■■■■ 4.02
TRIO-204ENST00000502816 PLCH2O75038 1416 aa40.13■■■■■ 4.01
TRIO-204ENST00000502816 FANCAO15360 1455 aa40.13■■■■■ 4.01
TRIO-204ENST00000502816 AKNAQ7Z591 1439 aa40.11■■■■■ 4.01
TRIO-204ENST00000502816 KIF14Q15058 1648 aa40.09■■■■■ 4.01
TRIO-204ENST00000502816 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.08■■■■■ 4.01
TRIO-204ENST00000502816 RAPGEF3O95398 923 aa40.06■■■■■ 4
TRIO-204ENST00000502816 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.05■■■■■ 4
TRIO-204ENST00000502816 RICTORQ6R327 1708 aa40.02■■■■■ 4
TRIO-204ENST00000502816 ADGRL1O94910 1474 aa40.02■■■■■ 4
TRIO-204ENST00000502816 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.01■■■■■ 4
TRIO-204ENST00000502816 CEP162Q5TB80 1403 aa40.01■■■■■ 4
TRIO-204ENST00000502816 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa39.92■■■■□ 3.98
TRIO-204ENST00000502816 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.89■■■■□ 3.98
TRIO-204ENST00000502816 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.87■■■■□ 3.97
TRIO-204ENST00000502816 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa39.86■■■■□ 3.97
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