RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498535.1

MKRN1-216, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKRN1, Length 607 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-216ENST00000498535 IGF1RP08069 1367 aa44.27■■■■■ 4.68
MKRN1-216ENST00000498535 CUL7Q14999 1698 aa44.17■■■■■ 4.66
MKRN1-216ENST00000498535 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa44.14■■■■■ 4.66
MKRN1-216ENST00000498535 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP44.09■■■■■ 4.65
MKRN1-216ENST00000498535 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa44■■■■■ 4.63
MKRN1-216ENST00000498535 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP43.99■■■■■ 4.63
MKRN1-216ENST00000498535 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.99■■■■■ 4.63
MKRN1-216ENST00000498535 ADCY10Q96PN6 1610 aa43.89■■■■■ 4.62
MKRN1-216ENST00000498535 FAM69CQ0P6D2 419 aa43.89■■■■■ 4.62
MKRN1-216ENST00000498535 MAPKBP1O60336 1514 aa43.86■■■■■ 4.61
MKRN1-216ENST00000498535 ABCC10Q5T3U5 1492 aa43.86■■■■■ 4.61
MKRN1-216ENST00000498535 PTPRGP23470 1445 aa43.78■■■■■ 4.6
MKRN1-216ENST00000498535 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.76■■■■■ 4.6
MKRN1-216ENST00000498535 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
MKRN1-216ENST00000498535 IQGAP2Q13576 1575 aa43.7■■■■■ 4.59
MKRN1-216ENST00000498535 DIP2BQ9P265 1576 aa43.7■■■■■ 4.59
MKRN1-216ENST00000498535 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.69■■■■■ 4.59
MKRN1-216ENST00000498535 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.58■■■■■ 4.57
MKRN1-216ENST00000498535 ABCC2Q92887 1545 aa43.52■■■■■ 4.56
MKRN1-216ENST00000498535 DISP1Q96F81 1524 aa43.47■■■■■ 4.55
MKRN1-216ENST00000498535 TSPOAP1O95153 1857 aa43.43■■■■■ 4.54
MKRN1-216ENST00000498535 UACAQ9BZF9 1416 aa43.42■■■■■ 4.54
MKRN1-216ENST00000498535 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa43.42■■■■■ 4.54
MKRN1-216ENST00000498535 UGGT2Q9NYU1 1516 aa43.4■■■■■ 4.54
MKRN1-216ENST00000498535 KDM6BO15054 1643 aa43.38■■■■■ 4.54
MKRN1-216ENST00000498535 ASXL2Q76L83 1435 aa43.38■■■■■ 4.53
MKRN1-216ENST00000498535 PLB1Q6P1J6 1458 aa43.38■■■■■ 4.53
MKRN1-216ENST00000498535 KIAA0556O60303 1618 aa43.27■■■■■ 4.52
MKRN1-216ENST00000498535 GLI2P10070 1586 aa43.23■■■■■ 4.51
MKRN1-216ENST00000498535 KDM5BQ9UGL1 1544 aa43.22■■■■■ 4.51
MKRN1-216ENST00000498535 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa43.18■■■■■ 4.5
MKRN1-216ENST00000498535 GOLGA3Q08378 1498 aa43.13■■■■■ 4.49
MKRN1-216ENST00000498535 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP43.11■■■■■ 4.49
MKRN1-216ENST00000498535 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
MKRN1-216ENST00000498535 PRXQ9BXM0 1461 aa43.08■■■■■ 4.49
MKRN1-216ENST00000498535 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
MKRN1-216ENST00000498535 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa42.97■■■■■ 4.47
MKRN1-216ENST00000498535 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa42.96■■■■■ 4.47
MKRN1-216ENST00000498535 TEX14Q8IWB6 1497 aa42.94■■■■■ 4.47
MKRN1-216ENST00000498535 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.94■■■■■ 4.47
MKRN1-216ENST00000498535 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.9■■■■■ 4.46
MKRN1-216ENST00000498535 ABCA8O94911 1581 aa42.88■■■■■ 4.45
MKRN1-216ENST00000498535 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.82■■■■■ 4.45
MKRN1-216ENST00000498535 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
MKRN1-216ENST00000498535 KCNH8Q96L42 1107 aa42.8■■■■■ 4.44
MKRN1-216ENST00000498535 P3H3Q8IVL6 736 aa42.75■■■■■ 4.43
MKRN1-216ENST00000498535 CD109Q6YHK3 1445 aa42.72■■■■■ 4.43
MKRN1-216ENST00000498535 CFAP43Q8NDM7 1665 aa42.67■■■■■ 4.42
MKRN1-216ENST00000498535 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa42.65■■■■■ 4.42
MKRN1-216ENST00000498535 ARID3CA6NKF2 412 aa42.63■■■■■ 4.41
MKRN1-216ENST00000498535 ADGRL1O94910 1474 aa42.62■■■■■ 4.41
MKRN1-216ENST00000498535 EEA1Q15075 1411 aa42.61■■■■■ 4.41
MKRN1-216ENST00000498535 ATP10BO94823 1461 aa42.56■■■■■ 4.4
MKRN1-216ENST00000498535 SAMD9Q5K651 1589 aa42.55■■■■■ 4.4
MKRN1-216ENST00000498535 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.46■■■■■ 4.39
MKRN1-216ENST00000498535 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.43■■■■■ 4.38
MKRN1-216ENST00000498535 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP42.43■■■■■ 4.38
MKRN1-216ENST00000498535 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.43■■■■■ 4.38
MKRN1-216ENST00000498535 ABCA9Q8IUA7 1624 aa42.33■■■■■ 4.37
MKRN1-216ENST00000498535 ARAP3Q8WWN8 1544 aa42.32■■■■■ 4.37
MKRN1-216ENST00000498535 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.31■■■■■ 4.36
MKRN1-216ENST00000498535 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.29■■■■■ 4.36
MKRN1-216ENST00000498535 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
MKRN1-216ENST00000498535 KIF21BO75037 1637 aa42.22■■■■■ 4.35
MKRN1-216ENST00000498535 PLEKHD1A6NEE1 506 aa42.17■■■■■ 4.34
MKRN1-216ENST00000498535 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.16■■■■■ 4.34
MKRN1-216ENST00000498535 NEO1Q92859 1461 aa42.16■■■■■ 4.34
MKRN1-216ENST00000498535 RAPGEF3O95398 923 aa42.11■■■■■ 4.33
MKRN1-216ENST00000498535 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.04■■■■■ 4.32
MKRN1-216ENST00000498535 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.03■■■■■ 4.32
MKRN1-216ENST00000498535 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.02■■■■■ 4.32
MKRN1-216ENST00000498535 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.94■■■■■ 4.3
MKRN1-216ENST00000498535 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.9■■■■■ 4.3
MKRN1-216ENST00000498535 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.9■■■■■ 4.34e-6■■■■□ 19.8
MKRN1-216ENST00000498535 AKNAQ7Z591 1439 aa41.88■■■■■ 4.3
MKRN1-216ENST00000498535 FANCAO15360 1455 aa41.88■■■■■ 4.29
MKRN1-216ENST00000498535 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
MKRN1-216ENST00000498535 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
MKRN1-216ENST00000498535 CFAP74Q9C0B2 1584 aa41.86■■■■■ 4.29
MKRN1-216ENST00000498535 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
MKRN1-216ENST00000498535 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
MKRN1-216ENST00000498535 FMN1Q68DA7 1419 aa41.84■■■■■ 4.29
MKRN1-216ENST00000498535 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.82■■■■■ 4.29
MKRN1-216ENST00000498535 ADAMTSL3P82987 1691 aa41.8■■■■■ 4.28
MKRN1-216ENST00000498535 RICTORQ6R327 1708 aa41.76■■■■■ 4.28
MKRN1-216ENST00000498535 PTPRMP28827 1452 aa41.76■■■■■ 4.28
MKRN1-216ENST00000498535 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.76■■■■■ 4.28
MKRN1-216ENST00000498535 HECW1Q76N89 1606 aa41.74■■■■■ 4.27
MKRN1-216ENST00000498535 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
MKRN1-216ENST00000498535 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
MKRN1-216ENST00000498535 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.73■■■■■ 4.27
MKRN1-216ENST00000498535 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.72■■■■■ 4.27
MKRN1-216ENST00000498535 PLCH2O75038 1416 aa41.68■■■■■ 4.26
MKRN1-216ENST00000498535 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.63■■■■■ 4.25
MKRN1-216ENST00000498535 MADDQ8WXG6 1647 aa41.62■■■■■ 4.25
MKRN1-216ENST00000498535 SCAPERQ9BY12 1400 aa41.6■■■■■ 4.25
MKRN1-216ENST00000498535 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.59■■■■■ 4.25
MKRN1-216ENST00000498535 MAGI2Q86UL8 1455 aa41.59■■■■■ 4.25
MKRN1-216ENST00000498535 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa41.58■■■■■ 4.25
MKRN1-216ENST00000498535 POGZQ7Z3K3 1410 aa41.57■■■■■ 4.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms