RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497552.5

PRRT1-211, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PRRT1, Length 543 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-211ENST00000497552 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.06■■■□□ 2.24
PRRT1-211ENST00000497552 JPH4Q96JJ6 628 aa29.06■■■□□ 2.24
PRRT1-211ENST00000497552 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.89■■■□□ 2.22
PRRT1-211ENST00000497552 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.86■■■□□ 2.21
PRRT1-211ENST00000497552 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.84■■■□□ 2.21
PRRT1-211ENST00000497552 IGF1RP08069 1367 aa28.84■■■□□ 2.21
PRRT1-211ENST00000497552 MAPKBP1O60336 1514 aa28.84■■■□□ 2.21
PRRT1-211ENST00000497552 DIP2BQ9P265 1576 aa28.82■■■□□ 2.2
PRRT1-211ENST00000497552 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.81■■■□□ 2.2
PRRT1-211ENST00000497552 KIF27Q86VH2 1401 aa28.77■■■□□ 2.2
PRRT1-211ENST00000497552 CUL7Q14999 1698 aa28.77■■■□□ 2.2
PRRT1-211ENST00000497552 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
PRRT1-211ENST00000497552 TSPOAP1O95153 1857 aa28.63■■■□□ 2.17
PRRT1-211ENST00000497552 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.63■■■□□ 2.17
PRRT1-211ENST00000497552 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PRRT1-211ENST00000497552 KDM6BO15054 1643 aa28.61■■■□□ 2.17
PRRT1-211ENST00000497552 PTPRGP23470 1445 aa28.6■■■□□ 2.17
PRRT1-211ENST00000497552 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.53■■■□□ 2.16
PRRT1-211ENST00000497552 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.52■■■□□ 2.16
PRRT1-211ENST00000497552 IQGAP2Q13576 1575 aa28.52■■■□□ 2.16
PRRT1-211ENST00000497552 ABCC2Q92887 1545 aa28.51■■■□□ 2.15
PRRT1-211ENST00000497552 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.48■■■□□ 2.15
PRRT1-211ENST00000497552 ASXL2Q76L83 1435 aa28.46■■■□□ 2.15
PRRT1-211ENST00000497552 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
PRRT1-211ENST00000497552 DISP1Q96F81 1524 aa28.45■■■□□ 2.15
PRRT1-211ENST00000497552 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.41■■■□□ 2.14
PRRT1-211ENST00000497552 GLI2P10070 1586 aa28.39■■■□□ 2.14
PRRT1-211ENST00000497552 UACAQ9BZF9 1416 aa28.39■■■□□ 2.14
PRRT1-211ENST00000497552 PLB1Q6P1J6 1458 aa28.39■■■□□ 2.13
PRRT1-211ENST00000497552 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.33■■■□□ 2.13
PRRT1-211ENST00000497552 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.33■■■□□ 2.13
PRRT1-211ENST00000497552 KDM5BQ9UGL1 1544 aa28.31■■■□□ 2.12
PRRT1-211ENST00000497552 KIAA0556O60303 1618 aa28.3■■■□□ 2.12
PRRT1-211ENST00000497552 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
PRRT1-211ENST00000497552 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
PRRT1-211ENST00000497552 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
PRRT1-211ENST00000497552 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.26■■■□□ 2.11
PRRT1-211ENST00000497552 ADGRL1O94910 1474 aa28.2■■■□□ 2.1
PRRT1-211ENST00000497552 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.13■■■□□ 2.09
PRRT1-211ENST00000497552 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.12■■■□□ 2.09
PRRT1-211ENST00000497552 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.11■■■□□ 2.09
PRRT1-211ENST00000497552 ABCA8O94911 1581 aa28.06■■■□□ 2.08
PRRT1-211ENST00000497552 GOLGA3Q08378 1498 aa27.99■■■□□ 2.07
PRRT1-211ENST00000497552 PRXQ9BXM0 1461 aa27.99■■■□□ 2.07
PRRT1-211ENST00000497552 CD109Q6YHK3 1445 aa27.97■■■□□ 2.07
PRRT1-211ENST00000497552 KCNH8Q96L42 1107 aa27.96■■■□□ 2.07
PRRT1-211ENST00000497552 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.96■■■□□ 2.07
PRRT1-211ENST00000497552 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.96■■■□□ 2.07
PRRT1-211ENST00000497552 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
PRRT1-211ENST00000497552 HECW2Q9P2P5 1572 aa27.92■■■□□ 2.06
PRRT1-211ENST00000497552 ARID3CA6NKF2 412 aa27.88■■■□□ 2.05
PRRT1-211ENST00000497552 P3H3Q8IVL6 736 aa27.86■■■□□ 2.05
PRRT1-211ENST00000497552 ATP10BO94823 1461 aa27.82■■■□□ 2.04
PRRT1-211ENST00000497552 KIF21BO75037 1637 aa27.81■■■□□ 2.04
PRRT1-211ENST00000497552 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.74■■■□□ 2.03
PRRT1-211ENST00000497552 SAMD9Q5K651 1589 aa27.73■■■□□ 2.03
PRRT1-211ENST00000497552 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.71■■■□□ 2.03
PRRT1-211ENST00000497552 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.68■■■□□ 2.02
PRRT1-211ENST00000497552 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PRRT1-211ENST00000497552 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.64■■■□□ 2.02
PRRT1-211ENST00000497552 RAPGEF3O95398 923 aa27.62■■■□□ 2.01
PRRT1-211ENST00000497552 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.6■■■□□ 2.01
PRRT1-211ENST00000497552 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
PRRT1-211ENST00000497552 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
PRRT1-211ENST00000497552 ADAMTSL3P82987 1691 aa27.59■■■□□ 2.01
PRRT1-211ENST00000497552 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.58■■■□□ 2
PRRT1-211ENST00000497552 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PRRT1-211ENST00000497552 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
PRRT1-211ENST00000497552 NEO1Q92859 1461 aa27.57■■■□□ 2
PRRT1-211ENST00000497552 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
PRRT1-211ENST00000497552 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
PRRT1-211ENST00000497552 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.55■■■□□ 2
PRRT1-211ENST00000497552 PTPRMP28827 1452 aa27.54■■■□□ 2
PRRT1-211ENST00000497552 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.49■■□□□ 1.99
PRRT1-211ENST00000497552 MADDQ8WXG6 1647 aa27.47■■□□□ 1.99
PRRT1-211ENST00000497552 EEA1Q15075 1411 aa27.42■■□□□ 1.98
PRRT1-211ENST00000497552 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.42■■□□□ 1.98
PRRT1-211ENST00000497552 RICTORQ6R327 1708 aa27.42■■□□□ 1.98
PRRT1-211ENST00000497552 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.41■■□□□ 1.98
PRRT1-211ENST00000497552 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
PRRT1-211ENST00000497552 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.39■■□□□ 1.98
PRRT1-211ENST00000497552 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 AKNAQ7Z591 1439 aa27.38■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.37■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 FANCAO15360 1455 aa27.36■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.35■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 LMTK3Q96Q04 1460 aa27.33■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.33■■□□□ 1.97
PRRT1-211ENST00000497552 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.31■■□□□ 1.96
PRRT1-211ENST00000497552 YEATS2Q9ULM3 1422 aa27.31■■□□□ 1.96
PRRT1-211ENST00000497552 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.29■■□□□ 1.96
PRRT1-211ENST00000497552 FBXO41Q8TF61 875 aa27.28■■□□□ 1.96
PRRT1-211ENST00000497552 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa27.26■■□□□ 1.95
PRRT1-211ENST00000497552 HECW1Q76N89 1606 aa27.23■■□□□ 1.95
PRRT1-211ENST00000497552 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.23■■□□□ 1.95
PRRT1-211ENST00000497552 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.23■■□□□ 1.95
PRRT1-211ENST00000497552 HSPA2P54652 639 aa27.19■■□□□ 1.94
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