RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497453.1

UBE2Q1-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 830 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.03■■■□□ 2.4
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UBE2Q1-207ENST00000497453 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.99■■■□□ 2.39
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UBE2Q1-207ENST00000497453 EEA1Q15075 1411 aa29.91■■■□□ 2.38
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UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCC2Q92887 1545 aa29.32■■■□□ 2.28
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UBE2Q1-207ENST00000497453 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
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UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF13AQ9H1H9 1805 aa29.1■■■□□ 2.25
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UBE2Q1-207ENST00000497453 ARID3CA6NKF2 412 aa29.03■■■□□ 2.24
UBE2Q1-207ENST00000497453 ATP10BO94823 1461 aa29.01■■■□□ 2.23
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UBE2Q1-207ENST00000497453 GLI2P10070 1586 aa28.95■■■□□ 2.22
UBE2Q1-207ENST00000497453 CLIP1P30622 1438 aa28.91■■■□□ 2.22
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UBE2Q1-207ENST00000497453 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.8■■■□□ 2.2
UBE2Q1-207ENST00000497453 CEP162Q5TB80 1403 aa28.78■■■□□ 2.2
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UBE2Q1-207ENST00000497453 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.74■■■□□ 2.19
UBE2Q1-207ENST00000497453 CD109Q6YHK3 1445 aa28.73■■■□□ 2.19
UBE2Q1-207ENST00000497453 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFAP43Q8NDM7 1665 aa28.7■■■□□ 2.18
UBE2Q1-207ENST00000497453 TEX14Q8IWB6 1497 aa28.68■■■□□ 2.18
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UBE2Q1-207ENST00000497453 FYCO1Q9BQS8 1478 aa28.66■■■□□ 2.18
UBE2Q1-207ENST00000497453 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.65■■■□□ 2.18
UBE2Q1-207ENST00000497453 KDM6BO15054 1643 aa28.63■■■□□ 2.17
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UBE2Q1-207ENST00000497453 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa28.61■■■□□ 2.17
UBE2Q1-207ENST00000497453 CCDC18Q5T9S5 1454 aa28.6■■■□□ 2.17
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UBE2Q1-207ENST00000497453 KIF14Q15058 1648 aa28.45■■■□□ 2.14
UBE2Q1-207ENST00000497453 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.44■■■□□ 2.14
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UBE2Q1-207ENST00000497453 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.33■■■□□ 2.13
UBE2Q1-207ENST00000497453 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.33■■■□□ 2.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 RAPGEF3O95398 923 aa28.29■■■□□ 2.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.29■■■□□ 2.12
UBE2Q1-207ENST00000497453 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q1-207ENST00000497453 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q1-207ENST00000497453 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q1-207ENST00000497453 TIAM1Q13009 1591 aa28.24■■■□□ 2.11
UBE2Q1-207ENST00000497453 ADGRL1O94910 1474 aa28.24■■■□□ 2.11
UBE2Q1-207ENST00000497453 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa28.22■■■□□ 2.11
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