RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495606.5

IMP4-217, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene IMP4, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-217ENST00000495606 CEP170Q5SW79 1584 aa24.23■■□□□ 1.47
IMP4-217ENST00000495606 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.22■■□□□ 1.47
IMP4-217ENST00000495606 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.21■■□□□ 1.47
IMP4-217ENST00000495606 NUP160Q12769 1436 aa24.2■■□□□ 1.46
IMP4-217ENST00000495606 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.14■■□□□ 1.46
IMP4-217ENST00000495606 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-217ENST00000495606 PRXQ9BXM0 1461 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-217ENST00000495606 EEA1Q15075 1411 aa24.1■■□□□ 1.45
IMP4-217ENST00000495606 JPH4Q96JJ6 628 aa24.06■■□□□ 1.44
IMP4-217ENST00000495606 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.05■■□□□ 1.44
IMP4-217ENST00000495606 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.03■■□□□ 1.44
IMP4-217ENST00000495606 SHROOM2Q13796 1616 aa24.01■■□□□ 1.43
IMP4-217ENST00000495606 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
IMP4-217ENST00000495606 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.94■■□□□ 1.42
IMP4-217ENST00000495606 IQGAP2Q13576 1575 aa23.9■■□□□ 1.42
IMP4-217ENST00000495606 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.89■■□□□ 1.41
IMP4-217ENST00000495606 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.88■■□□□ 1.41
IMP4-217ENST00000495606 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
IMP4-217ENST00000495606 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
IMP4-217ENST00000495606 KIF21BO75037 1637 aa23.86■■□□□ 1.41
IMP4-217ENST00000495606 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.85■■□□□ 1.41
IMP4-217ENST00000495606 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
IMP4-217ENST00000495606 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
IMP4-217ENST00000495606 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.83■■□□□ 1.4
IMP4-217ENST00000495606 P3H3Q8IVL6 736 aa23.78■■□□□ 1.4
IMP4-217ENST00000495606 GOLGA3Q08378 1498 aa23.78■■□□□ 1.4
IMP4-217ENST00000495606 DISP1Q96F81 1524 aa23.78■■□□□ 1.4
IMP4-217ENST00000495606 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.78■■□□□ 1.4
IMP4-217ENST00000495606 MAPKBP1O60336 1514 aa23.77■■□□□ 1.4
IMP4-217ENST00000495606 DIP2BQ9P265 1576 aa23.76■■□□□ 1.39
IMP4-217ENST00000495606 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.76■■□□□ 1.39
IMP4-217ENST00000495606 KDM6BO15054 1643 aa23.73■■□□□ 1.39
IMP4-217ENST00000495606 PTPRGP23470 1445 aa23.71■■□□□ 1.39
IMP4-217ENST00000495606 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.7■■□□□ 1.38
IMP4-217ENST00000495606 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.69■■□□□ 1.38
IMP4-217ENST00000495606 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-217ENST00000495606 KIAA0556O60303 1618 aa23.68■■□□□ 1.38
IMP4-217ENST00000495606 TSPOAP1O95153 1857 aa23.66■■□□□ 1.38
IMP4-217ENST00000495606 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-217ENST00000495606 SAMD9Q5K651 1589 aa23.57■■□□□ 1.36
IMP4-217ENST00000495606 UACAQ9BZF9 1416 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-217ENST00000495606 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.52■■□□□ 1.36
IMP4-217ENST00000495606 ARID3CA6NKF2 412 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-217ENST00000495606 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.49■■□□□ 1.35
IMP4-217ENST00000495606 ADGRL1O94910 1474 aa23.46■■□□□ 1.35
IMP4-217ENST00000495606 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.45■■□□□ 1.34
IMP4-217ENST00000495606 ABCC2Q92887 1545 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-217ENST00000495606 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-217ENST00000495606 ABCA8O94911 1581 aa23.43■■□□□ 1.34
IMP4-217ENST00000495606 CLIP1P30622 1438 aa23.42■■□□□ 1.34
IMP4-217ENST00000495606 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
IMP4-217ENST00000495606 ASXL2Q76L83 1435 aa23.4■■□□□ 1.34
IMP4-217ENST00000495606 GLI2P10070 1586 aa23.38■■□□□ 1.33
IMP4-217ENST00000495606 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
IMP4-217ENST00000495606 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
IMP4-217ENST00000495606 CEP162Q5TB80 1403 aa23.34■■□□□ 1.33
IMP4-217ENST00000495606 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.34■■□□□ 1.33
IMP4-217ENST00000495606 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.33■■□□□ 1.33
IMP4-217ENST00000495606 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.32■■□□□ 1.32
IMP4-217ENST00000495606 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
IMP4-217ENST00000495606 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-217ENST00000495606 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
IMP4-217ENST00000495606 ATP10BO94823 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
IMP4-217ENST00000495606 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
IMP4-217ENST00000495606 FMN1Q68DA7 1419 aa23.27■■□□□ 1.32
IMP4-217ENST00000495606 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
IMP4-217ENST00000495606 KCNH8Q96L42 1107 aa23.24■■□□□ 1.31
IMP4-217ENST00000495606 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.22■■□□□ 1.31
IMP4-217ENST00000495606 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.2■■□□□ 1.3
IMP4-217ENST00000495606 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
IMP4-217ENST00000495606 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
IMP4-217ENST00000495606 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.16■■□□□ 1.3
IMP4-217ENST00000495606 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.16■■□□□ 1.3
IMP4-217ENST00000495606 HECW1Q76N89 1606 aa23.13■■□□□ 1.29
IMP4-217ENST00000495606 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-217ENST00000495606 FBXO41Q8TF61 875 aa23.12■■□□□ 1.29
IMP4-217ENST00000495606 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.1■■□□□ 1.29
IMP4-217ENST00000495606 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.06■■□□□ 1.28
IMP4-217ENST00000495606 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.02■■□□□ 1.28
IMP4-217ENST00000495606 CD109Q6YHK3 1445 aa23■■□□□ 1.27
IMP4-217ENST00000495606 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
IMP4-217ENST00000495606 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-217ENST00000495606 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
IMP4-217ENST00000495606 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
IMP4-217ENST00000495606 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.93■■□□□ 1.26
IMP4-217ENST00000495606 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
IMP4-217ENST00000495606 KIF14Q15058 1648 aa22.9■■□□□ 1.26
IMP4-217ENST00000495606 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.9■■□□□ 1.26
IMP4-217ENST00000495606 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.88■■□□□ 1.25
IMP4-217ENST00000495606 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
IMP4-217ENST00000495606 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.86■■□□□ 1.25
IMP4-217ENST00000495606 PTPRMP28827 1452 aa22.84■■□□□ 1.25
IMP4-217ENST00000495606 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.83■■□□□ 1.25
IMP4-217ENST00000495606 TIAM1Q13009 1591 aa22.82■■□□□ 1.24
IMP4-217ENST00000495606 APLP2Q06481 763 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-217ENST00000495606 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.8■■□□□ 1.24
IMP4-217ENST00000495606 PLCH2O75038 1416 aa22.77■■□□□ 1.24
IMP4-217ENST00000495606 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 RAPGEF3O95398 923 aa22.75■■□□□ 1.23
IMP4-217ENST00000495606 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.74■■□□□ 1.23
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