RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495305.5

MKRN1-214, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene MKRN1, Length 1,390 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-214ENST00000495305 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.15■■■■■ 5.3
MKRN1-214ENST00000495305 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP48.12■■■■■ 5.29
MKRN1-214ENST00000495305 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.04■■■■■ 5.28
MKRN1-214ENST00000495305 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa48.04■■■■■ 5.28
MKRN1-214ENST00000495305 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.79■■■■■ 5.24
MKRN1-214ENST00000495305 IQGAP2Q13576 1575 aa47.64■■■■■ 5.22
MKRN1-214ENST00000495305 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa47.54■■■■■ 5.2
MKRN1-214ENST00000495305 PRXQ9BXM0 1461 aa47.48■■■■■ 5.19
MKRN1-214ENST00000495305 PTPRGP23470 1445 aa47.47■■■■■ 5.19
MKRN1-214ENST00000495305 TNIKQ9UKE5 1360 aa47.45■■■■■ 5.19
MKRN1-214ENST00000495305 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.19
MKRN1-214ENST00000495305 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP47.42■■■■■ 5.18
MKRN1-214ENST00000495305 ADCY10Q96PN6 1610 aa47.41■■■■■ 5.18
MKRN1-214ENST00000495305 DISP1Q96F81 1524 aa47.39■■■■■ 5.18
MKRN1-214ENST00000495305 UGGT2Q9NYU1 1516 aa47.38■■■■■ 5.18
MKRN1-214ENST00000495305 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.35■■■■■ 5.17
MKRN1-214ENST00000495305 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa47.26■■■■■ 5.16
MKRN1-214ENST00000495305 EEA1Q15075 1411 aa47.22■■■■■ 5.15
MKRN1-214ENST00000495305 MAPKBP1O60336 1514 aa47.22■■■■■ 5.15
MKRN1-214ENST00000495305 KIAA0556O60303 1618 aa47.2■■■■■ 5.15
MKRN1-214ENST00000495305 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.13■■■■■ 5.14
MKRN1-214ENST00000495305 UACAQ9BZF9 1416 aa47.13■■■■■ 5.13
MKRN1-214ENST00000495305 ABCC10Q5T3U5 1492 aa47.11■■■■■ 5.13
MKRN1-214ENST00000495305 FAM69CQ0P6D2 419 aa47.11■■■■■ 5.13
MKRN1-214ENST00000495305 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.11■■■■■ 5.13
MKRN1-214ENST00000495305 ABCC2Q92887 1545 aa47.1■■■■■ 5.13
MKRN1-214ENST00000495305 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.09■■■■■ 5.13
MKRN1-214ENST00000495305 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa47.08■■■■■ 5.13
MKRN1-214ENST00000495305 GOLGA3Q08378 1498 aa47.07■■■■■ 5.13
MKRN1-214ENST00000495305 DIP2BQ9P265 1576 aa46.98■■■■■ 5.11
MKRN1-214ENST00000495305 ASXL2Q76L83 1435 aa46.88■■■■■ 5.09
MKRN1-214ENST00000495305 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.86■■■■■ 5.09
MKRN1-214ENST00000495305 PLB1Q6P1J6 1458 aa46.85■■■■■ 5.09
MKRN1-214ENST00000495305 P3H3Q8IVL6 736 aa46.81■■■■■ 5.08
MKRN1-214ENST00000495305 KIF21BO75037 1637 aa46.75■■■■■ 5.07
MKRN1-214ENST00000495305 ABCA8O94911 1581 aa46.74■■■■■ 5.07
MKRN1-214ENST00000495305 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
MKRN1-214ENST00000495305 SAMD9Q5K651 1589 aa46.68■■■■■ 5.06
MKRN1-214ENST00000495305 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP46.67■■■■■ 5.06
MKRN1-214ENST00000495305 GLI2P10070 1586 aa46.61■■■■■ 5.05
MKRN1-214ENST00000495305 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP46.59■■■■■ 5.05
MKRN1-214ENST00000495305 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.58■■■■■ 5.05
MKRN1-214ENST00000495305 TSPOAP1O95153 1857 aa46.57■■■■■ 5.04
MKRN1-214ENST00000495305 WDR7Q9Y4E6 1490 aa46.53■■■■■ 5.04
MKRN1-214ENST00000495305 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.49■■■■■ 5.03
MKRN1-214ENST00000495305 ARID3CA6NKF2 412 aa46.46■■■■■ 5.03
MKRN1-214ENST00000495305 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.45■■■■■ 5.03
MKRN1-214ENST00000495305 ATP10BO94823 1461 aa46.39■■■■■ 5.02
MKRN1-214ENST00000495305 KDM6BO15054 1643 aa46.38■■■■■ 5.02
MKRN1-214ENST00000495305 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.37■■■■■ 5.01
MKRN1-214ENST00000495305 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP46.37■■■■■ 5.01
MKRN1-214ENST00000495305 KCNH8Q96L42 1107 aa46.36■■■■■ 5.01
MKRN1-214ENST00000495305 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa46.35■■■■■ 5.01
MKRN1-214ENST00000495305 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa46.35■■■■■ 5.01
MKRN1-214ENST00000495305 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP46.23■■■■■ 4.99
MKRN1-214ENST00000495305 TEX14Q8IWB6 1497 aa46.22■■■■■ 4.99
MKRN1-214ENST00000495305 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP46.21■■■■■ 4.99
MKRN1-214ENST00000495305 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP46.21■■■■■ 4.99
MKRN1-214ENST00000495305 CD109Q6YHK3 1445 aa46.19■■■■■ 4.98
MKRN1-214ENST00000495305 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.11■■■■■ 4.97
MKRN1-214ENST00000495305 CFAP43Q8NDM7 1665 aa46.11■■■■■ 4.97
MKRN1-214ENST00000495305 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa46.09■■■■■ 4.97
MKRN1-214ENST00000495305 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP46.09■■■■■ 4.97
MKRN1-214ENST00000495305 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP46.04■■■■■ 4.96
MKRN1-214ENST00000495305 FMN1Q68DA7 1419 aa45.99■■■■■ 4.95
MKRN1-214ENST00000495305 PLEKHD1A6NEE1 506 aa45.96■■■■■ 4.95
MKRN1-214ENST00000495305 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.93■■■■■ 4.94
MKRN1-214ENST00000495305 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.89■■■■■ 4.94
MKRN1-214ENST00000495305 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP45.86■■■■■ 4.93
MKRN1-214ENST00000495305 HECW1Q76N89 1606 aa45.8■■■■■ 4.92
MKRN1-214ENST00000495305 PHLDB1Q86UU1 1377 aa45.71■■■■■ 4.91
MKRN1-214ENST00000495305 ARAP3Q8WWN8 1544 aa45.7■■■■■ 4.91
MKRN1-214ENST00000495305 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa45.68■■■■■ 4.9
MKRN1-214ENST00000495305 CLIP1P30622 1438 aa45.66■■■■■ 4.9
MKRN1-214ENST00000495305 NEO1Q92859 1461 aa45.66■■■■■ 4.9
MKRN1-214ENST00000495305 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP45.66■■■■■ 4.94e-6■■■■□ 19.8
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MKRN1-214ENST00000495305 TTC37Q6PGP7 1564 aa45.57■■■■■ 4.89
MKRN1-214ENST00000495305 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.53■■■■■ 4.88
MKRN1-214ENST00000495305 RAPGEF3O95398 923 aa45.53■■■■■ 4.88
MKRN1-214ENST00000495305 FANCAO15360 1455 aa45.49■■■■■ 4.87
MKRN1-214ENST00000495305 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.48■■■■■ 4.87
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MKRN1-214ENST00000495305 ADGRL1O94910 1474 aa45.46■■■■■ 4.87
MKRN1-214ENST00000495305 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.42■■■■■ 4.86
MKRN1-214ENST00000495305 PLCH2O75038 1416 aa45.41■■■■■ 4.86
MKRN1-214ENST00000495305 FYCO1Q9BQS8 1478 aa45.41■■■■■ 4.86
MKRN1-214ENST00000495305 CFAP74Q9C0B2 1584 aa45.39■■■■■ 4.86
MKRN1-214ENST00000495305 KIF14Q15058 1648 aa45.37■■■■■ 4.85
MKRN1-214ENST00000495305 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
MKRN1-214ENST00000495305 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa45.35■■■■■ 4.85
MKRN1-214ENST00000495305 CEP162Q5TB80 1403 aa45.31■■■■■ 4.84
MKRN1-214ENST00000495305 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa45.26■■■■■ 4.84
MKRN1-214ENST00000495305 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.25■■■■■ 4.83
MKRN1-214ENST00000495305 MYO5CQ9NQX4 1742 aa45.24■■■■■ 4.83
MKRN1-214ENST00000495305 RICTORQ6R327 1708 aa45.21■■■■■ 4.83
MKRN1-214ENST00000495305 SCAPERQ9BY12 1400 aa45.2■■■■■ 4.83
MKRN1-214ENST00000495305 ARHGAP5Q13017 1502 aa45.14■■■■■ 4.82
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