RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.65■■■□□ 2.18
SH3BP4-211ENST00000493436 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SH3BP4-211ENST00000493436 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.59■■■□□ 2.17
SH3BP4-211ENST00000493436 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.44■■■□□ 2.14
SH3BP4-211ENST00000493436 IQGAP2Q13576 1575 aa28.38■■■□□ 2.13
SH3BP4-211ENST00000493436 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP4-211ENST00000493436 ADCY10Q96PN6 1610 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 PTPRGP23470 1445 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 PRXQ9BXM0 1461 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.24■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.23■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 UGGT2Q9NYU1 1516 aa28.21■■■□□ 2.11
SH3BP4-211ENST00000493436 DISP1Q96F81 1524 aa28.2■■■□□ 2.1
SH3BP4-211ENST00000493436 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP4-211ENST00000493436 MAPKBP1O60336 1514 aa28.13■■■□□ 2.09
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA0556O60303 1618 aa28.12■■■□□ 2.09
SH3BP4-211ENST00000493436 EEA1Q15075 1411 aa28.09■■■□□ 2.09
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.05■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 UACAQ9BZF9 1416 aa28.04■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCC2Q92887 1545 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.03■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 GOLGA3Q08378 1498 aa28.02■■■□□ 2.08
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SH3BP4-211ENST00000493436 DIP2BQ9P265 1576 aa28■■■□□ 2.07
SH3BP4-211ENST00000493436 CHIC1Q5VXU3 224 aa28■■■□□ 2.07
SH3BP4-211ENST00000493436 ASXL2Q76L83 1435 aa27.91■■■□□ 2.06
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.9■■■□□ 2.06
SH3BP4-211ENST00000493436 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.89■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPOAP1O95153 1857 aa27.87■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF21BO75037 1637 aa27.85■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 P3H3Q8IVL6 736 aa27.84■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA8O94911 1581 aa27.83■■■□□ 2.05
SH3BP4-211ENST00000493436 SAMD9Q5K651 1589 aa27.81■■■□□ 2.04
SH3BP4-211ENST00000493436 GLI2P10070 1586 aa27.77■■■□□ 2.04
SH3BP4-211ENST00000493436 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
SH3BP4-211ENST00000493436 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
SH3BP4-211ENST00000493436 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.7■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM6BO15054 1643 aa27.67■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.65■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.64■■■□□ 2.02
SH3BP4-211ENST00000493436 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 ARID3CA6NKF2 412 aa27.63■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 EFCAB5A4FU69 1503 aa27.61■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP10BO94823 1461 aa27.6■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNH8Q96L42 1107 aa27.59■■■□□ 2.01
SH3BP4-211ENST00000493436 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.53■■■□□ 2
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.52■■■□□ 2
SH3BP4-211ENST00000493436 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 CD109Q6YHK3 1445 aa27.49■■□□□ 1.99
SH3BP4-211ENST00000493436 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.44■■□□□ 1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.43■■□□□ 1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
SH3BP4-211ENST00000493436 ABCA9Q8IUA7 1624 aa27.38■■□□□ 1.97
SH3BP4-211ENST00000493436 FMN1Q68DA7 1419 aa27.36■■□□□ 1.97
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.35■■□□□ 1.97
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
SH3BP4-211ENST00000493436 HECW1Q76N89 1606 aa27.29■■□□□ 1.96
SH3BP4-211ENST00000493436 ARAP3Q8WWN8 1544 aa27.21■■□□□ 1.95
SH3BP4-211ENST00000493436 PHLDB1Q86UU1 1377 aa27.2■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP27.19■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 NEO1Q92859 1461 aa27.18■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa27.16■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 CLIP1P30622 1438 aa27.15■■□□□ 1.94
SH3BP4-211ENST00000493436 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
SH3BP4-211ENST00000493436 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.11■■□□□ 1.93
SH3BP4-211ENST00000493436 RAPGEF3O95398 923 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP74Q9C0B2 1584 aa27.08■■□□□ 1.93
SH3BP4-211ENST00000493436 FANCAO15360 1455 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 ADGRL1O94910 1474 aa27.07■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 AKNAQ7Z591 1439 aa27.05■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 KIF14Q15058 1648 aa27.04■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 MYO5CQ9NQX4 1742 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 FYCO1Q9BQS8 1478 aa27.02■■□□□ 1.92
SH3BP4-211ENST00000493436 PLCH2O75038 1416 aa27.01■■□□□ 1.91
SH3BP4-211ENST00000493436 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
SH3BP4-211ENST00000493436 RICTORQ6R327 1708 aa26.99■■□□□ 1.91
SH3BP4-211ENST00000493436 CEP162Q5TB80 1403 aa26.94■■□□□ 1.9
SH3BP4-211ENST00000493436 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.93■■□□□ 1.9
SH3BP4-211ENST00000493436 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.9■■□□□ 1.9
SH3BP4-211ENST00000493436 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.89■■□□□ 1.89
SH3BP4-211ENST00000493436 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.88■■□□□ 1.89
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