RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493230.5

HRAS-211, Transcript of HRas proto-oncogene, GTPase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HRAS, Length 1,114 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRAS-211ENST00000493230 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.32■■■□□ 2.6
HRAS-211ENST00000493230 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
HRAS-211ENST00000493230 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.25■■■□□ 2.59
HRAS-211ENST00000493230 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.22■■■□□ 2.59
HRAS-211ENST00000493230 EEA1Q15075 1411 aa31.11■■■□□ 2.57
HRAS-211ENST00000493230 PRXQ9BXM0 1461 aa31.08■■■□□ 2.57
HRAS-211ENST00000493230 IQGAP2Q13576 1575 aa31.08■■■□□ 2.57
HRAS-211ENST00000493230 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.06■■■□□ 2.56
HRAS-211ENST00000493230 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.04■■■□□ 2.56
HRAS-211ENST00000493230 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.03■■■□□ 2.56
HRAS-211ENST00000493230 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
HRAS-211ENST00000493230 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.93■■■□□ 2.54
HRAS-211ENST00000493230 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.92■■■□□ 2.54
HRAS-211ENST00000493230 PTPRGP23470 1445 aa30.9■■■□□ 2.54
HRAS-211ENST00000493230 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.9■■■□□ 2.54
HRAS-211ENST00000493230 DISP1Q96F81 1524 aa30.85■■■□□ 2.53
HRAS-211ENST00000493230 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
HRAS-211ENST00000493230 GOLGA3Q08378 1498 aa30.81■■■□□ 2.52
HRAS-211ENST00000493230 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
HRAS-211ENST00000493230 KIAA0556O60303 1618 aa30.76■■■□□ 2.52
HRAS-211ENST00000493230 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.75■■■□□ 2.51
HRAS-211ENST00000493230 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
HRAS-211ENST00000493230 KIF21BO75037 1637 aa30.7■■■□□ 2.51
HRAS-211ENST00000493230 UACAQ9BZF9 1416 aa30.68■■■□□ 2.5
HRAS-211ENST00000493230 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.68■■■□□ 2.5
HRAS-211ENST00000493230 MAPKBP1O60336 1514 aa30.67■■■□□ 2.5
HRAS-211ENST00000493230 ABCC2Q92887 1545 aa30.63■■■□□ 2.49
HRAS-211ENST00000493230 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.55■■■□□ 2.48
HRAS-211ENST00000493230 SAMD9Q5K651 1589 aa30.51■■■□□ 2.47
HRAS-211ENST00000493230 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.5■■■□□ 2.47
HRAS-211ENST00000493230 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
HRAS-211ENST00000493230 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.49■■■□□ 2.47
HRAS-211ENST00000493230 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.48■■■□□ 2.47
HRAS-211ENST00000493230 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.47■■■□□ 2.47
HRAS-211ENST00000493230 P3H3Q8IVL6 736 aa30.46■■■□□ 2.47
HRAS-211ENST00000493230 ABCA8O94911 1581 aa30.45■■■□□ 2.46
HRAS-211ENST00000493230 DIP2BQ9P265 1576 aa30.44■■■□□ 2.46
HRAS-211ENST00000493230 ASXL2Q76L83 1435 aa30.43■■■□□ 2.46
HRAS-211ENST00000493230 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.41■■■□□ 2.46
HRAS-211ENST00000493230 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
HRAS-211ENST00000493230 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
HRAS-211ENST00000493230 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.35■■■□□ 2.45
HRAS-211ENST00000493230 GLI2P10070 1586 aa30.3■■■□□ 2.44
HRAS-211ENST00000493230 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.3■■■□□ 2.44
HRAS-211ENST00000493230 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.26■■■□□ 2.44
HRAS-211ENST00000493230 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
HRAS-211ENST00000493230 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.25■■■□□ 2.43
HRAS-211ENST00000493230 ATP10BO94823 1461 aa30.21■■■□□ 2.43
HRAS-211ENST00000493230 FMN1Q68DA7 1419 aa30.16■■■□□ 2.42
HRAS-211ENST00000493230 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.16■■■□□ 2.42
HRAS-211ENST00000493230 TSPOAP1O95153 1857 aa30.14■■■□□ 2.42
HRAS-211ENST00000493230 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
HRAS-211ENST00000493230 ARID3CA6NKF2 412 aa30.12■■■□□ 2.41
HRAS-211ENST00000493230 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
HRAS-211ENST00000493230 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
HRAS-211ENST00000493230 KCNH8Q96L42 1107 aa30.11■■■□□ 2.41
HRAS-211ENST00000493230 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.11■■■□□ 2.41
HRAS-211ENST00000493230 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.07■■■□□ 2.4
HRAS-211ENST00000493230 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.03■■■□□ 2.4
HRAS-211ENST00000493230 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.03■■■□□ 2.4
HRAS-211ENST00000493230 CD109Q6YHK3 1445 aa30.03■■■□□ 2.4
HRAS-211ENST00000493230 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
HRAS-211ENST00000493230 KDM6BO15054 1643 aa30.01■■■□□ 2.39
HRAS-211ENST00000493230 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.98■■■□□ 2.39
HRAS-211ENST00000493230 HECW1Q76N89 1606 aa29.97■■■□□ 2.39
HRAS-211ENST00000493230 CLIP1P30622 1438 aa29.96■■■□□ 2.39
HRAS-211ENST00000493230 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
HRAS-211ENST00000493230 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
HRAS-211ENST00000493230 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.92■■■□□ 2.38
HRAS-211ENST00000493230 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.87■■■□□ 2.37
HRAS-211ENST00000493230 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
HRAS-211ENST00000493230 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.85■■■□□ 2.37
HRAS-211ENST00000493230 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.79■■■□□ 2.36
HRAS-211ENST00000493230 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.78■■■□□ 2.36
HRAS-211ENST00000493230 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
HRAS-211ENST00000493230 CEP162Q5TB80 1403 aa29.77■■■□□ 2.36
HRAS-211ENST00000493230 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
HRAS-211ENST00000493230 NEO1Q92859 1461 aa29.75■■■□□ 2.35
HRAS-211ENST00000493230 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.353e-6■■■■□ 24.3
HRAS-211ENST00000493230 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.73■■■□□ 2.35
HRAS-211ENST00000493230 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
HRAS-211ENST00000493230 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.71■■■□□ 2.35
HRAS-211ENST00000493230 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.68■■■□□ 2.34
HRAS-211ENST00000493230 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.64■■■□□ 2.34
HRAS-211ENST00000493230 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.64■■■□□ 2.34
HRAS-211ENST00000493230 KIF14Q15058 1648 aa29.63■■■□□ 2.33
HRAS-211ENST00000493230 PLCH2O75038 1416 aa29.62■■■□□ 2.33
HRAS-211ENST00000493230 FANCAO15360 1455 aa29.62■■■□□ 2.33
HRAS-211ENST00000493230 AKNAQ7Z591 1439 aa29.58■■■□□ 2.33
HRAS-211ENST00000493230 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HRAS-211ENST00000493230 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.55■■■□□ 2.32
HRAS-211ENST00000493230 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.54■■■□□ 2.32
HRAS-211ENST00000493230 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
HRAS-211ENST00000493230 RAPGEF3O95398 923 aa29.51■■■□□ 2.31
HRAS-211ENST00000493230 ADGRL1O94910 1474 aa29.46■■■□□ 2.31
HRAS-211ENST00000493230 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.45■■■□□ 2.31
HRAS-211ENST00000493230 MTUS2Q5JR59 1369 aa29.45■■■□□ 2.31
HRAS-211ENST00000493230 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.44■■■□□ 2.3
HRAS-211ENST00000493230 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.42■■■□□ 2.3
HRAS-211ENST00000493230 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.41■■■□□ 2.3
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