RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491269.1

C3orf18-211, Transcript of chromosome 3 open reading frame 18, humanhuman

TSL 4

Gene C3orf18, Length 531 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18-211ENST00000491269 JPH4Q96JJ6 628 aa35.95■■■■□ 3.35
C3orf18-211ENST00000491269 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
C3orf18-211ENST00000491269 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.83■■■■□ 3.33
C3orf18-211ENST00000491269 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
C3orf18-211ENST00000491269 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.73■■■■□ 3.31
C3orf18-211ENST00000491269 IQGAP2Q13576 1575 aa35.59■■■■□ 3.29
C3orf18-211ENST00000491269 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
C3orf18-211ENST00000491269 PRXQ9BXM0 1461 aa35.52■■■■□ 3.28
C3orf18-211ENST00000491269 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.47■■■■□ 3.27
C3orf18-211ENST00000491269 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.46■■■■□ 3.27
C3orf18-211ENST00000491269 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.45■■■■□ 3.27
C3orf18-211ENST00000491269 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
C3orf18-211ENST00000491269 PTPRGP23470 1445 aa35.42■■■■□ 3.26
C3orf18-211ENST00000491269 DISP1Q96F81 1524 aa35.41■■■■□ 3.26
C3orf18-211ENST00000491269 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.39■■■■□ 3.26
C3orf18-211ENST00000491269 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.39■■■■□ 3.26
C3orf18-211ENST00000491269 UGGT2Q9NYU1 1516 aa35.37■■■■□ 3.25
C3orf18-211ENST00000491269 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.37■■■■□ 3.25
C3orf18-211ENST00000491269 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.33■■■■□ 3.25
C3orf18-211ENST00000491269 EEA1Q15075 1411 aa35.32■■■■□ 3.25
C3orf18-211ENST00000491269 KIAA0556O60303 1618 aa35.28■■■■□ 3.24
C3orf18-211ENST00000491269 UACAQ9BZF9 1416 aa35.16■■■■□ 3.22
C3orf18-211ENST00000491269 MAPKBP1O60336 1514 aa35.15■■■■□ 3.22
C3orf18-211ENST00000491269 GOLGA3Q08378 1498 aa35.14■■■■□ 3.22
C3orf18-211ENST00000491269 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.12■■■■□ 3.21
C3orf18-211ENST00000491269 EHMT2Q96KQ7 1210 aa35.11■■■■□ 3.21
C3orf18-211ENST00000491269 ABCC2Q92887 1545 aa35.11■■■■□ 3.21
C3orf18-211ENST00000491269 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.1■■■■□ 3.21
C3orf18-211ENST00000491269 P3H3Q8IVL6 736 aa35.1■■■■□ 3.21
C3orf18-211ENST00000491269 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.09■■■■□ 3.21
C3orf18-211ENST00000491269 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
C3orf18-211ENST00000491269 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.08■■■■□ 3.21
C3orf18-211ENST00000491269 KIF21BO75037 1637 aa35.03■■■■□ 3.2
C3orf18-211ENST00000491269 PLB1Q6P1J6 1458 aa35.02■■■■□ 3.2
C3orf18-211ENST00000491269 DIP2BQ9P265 1576 aa35.01■■■■□ 3.2
C3orf18-211ENST00000491269 ASXL2Q76L83 1435 aa34.97■■■■□ 3.19
C3orf18-211ENST00000491269 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.95■■■■□ 3.19
C3orf18-211ENST00000491269 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.92■■■■□ 3.18
C3orf18-211ENST00000491269 SAMD9Q5K651 1589 aa34.91■■■■□ 3.18
C3orf18-211ENST00000491269 ABCA8O94911 1581 aa34.91■■■■□ 3.18
C3orf18-211ENST00000491269 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
C3orf18-211ENST00000491269 ARID3CA6NKF2 412 aa34.84■■■■□ 3.17
C3orf18-211ENST00000491269 TSPOAP1O95153 1857 aa34.81■■■■□ 3.16
C3orf18-211ENST00000491269 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.81■■■■□ 3.16
C3orf18-211ENST00000491269 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
C3orf18-211ENST00000491269 GLI2P10070 1586 aa34.71■■■■□ 3.15
C3orf18-211ENST00000491269 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.7■■■■□ 3.15
C3orf18-211ENST00000491269 KCNH8Q96L42 1107 aa34.67■■■■□ 3.14
C3orf18-211ENST00000491269 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.66■■■■□ 3.14
C3orf18-211ENST00000491269 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.66■■■■□ 3.14
C3orf18-211ENST00000491269 ATP10BO94823 1461 aa34.65■■■■□ 3.14
C3orf18-211ENST00000491269 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.6■■■■□ 3.13
C3orf18-211ENST00000491269 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.58■■■■□ 3.13
C3orf18-211ENST00000491269 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
C3orf18-211ENST00000491269 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.57■■■■□ 3.12
C3orf18-211ENST00000491269 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP34.57■■■■□ 3.12
C3orf18-211ENST00000491269 KDM6BO15054 1643 aa34.55■■■■□ 3.12
C3orf18-211ENST00000491269 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa34.54■■■■□ 3.12
C3orf18-211ENST00000491269 CD109Q6YHK3 1445 aa34.45■■■■□ 3.11
C3orf18-211ENST00000491269 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
C3orf18-211ENST00000491269 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.41■■■■□ 3.1
C3orf18-211ENST00000491269 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.4■■■■□ 3.1
C3orf18-211ENST00000491269 FMN1Q68DA7 1419 aa34.38■■■■□ 3.09
C3orf18-211ENST00000491269 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
C3orf18-211ENST00000491269 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
C3orf18-211ENST00000491269 PLEKHD1A6NEE1 506 aa34.33■■■■□ 3.09
C3orf18-211ENST00000491269 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.33■■■■□ 3.09
C3orf18-211ENST00000491269 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.27■■■■□ 3.08
C3orf18-211ENST00000491269 HECW1Q76N89 1606 aa34.26■■■■□ 3.07
C3orf18-211ENST00000491269 CLIP1P30622 1438 aa34.23■■■■□ 3.07
C3orf18-211ENST00000491269 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
C3orf18-211ENST00000491269 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP34.13■■■■□ 3.05
C3orf18-211ENST00000491269 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.12■■■■□ 3.05
C3orf18-211ENST00000491269 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.12■■■■□ 3.05
C3orf18-211ENST00000491269 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.1■■■■□ 3.05
C3orf18-211ENST00000491269 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa34.1■■■■□ 3.05
C3orf18-211ENST00000491269 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.09■■■■□ 3.05
C3orf18-211ENST00000491269 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP34.07■■■■□ 3.04
C3orf18-211ENST00000491269 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.04■■■■□ 3.04
C3orf18-211ENST00000491269 NEO1Q92859 1461 aa34.02■■■■□ 3.04
C3orf18-211ENST00000491269 CEP162Q5TB80 1403 aa34.01■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 RAPGEF3O95398 923 aa34■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.99■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 KIF14Q15058 1648 aa33.98■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa33.98■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 FYCO1Q9BQS8 1478 aa33.97■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 FANCAO15360 1455 aa33.95■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.95■■■■□ 3.03
C3orf18-211ENST00000491269 AKNAQ7Z591 1439 aa33.93■■■■□ 3.02
C3orf18-211ENST00000491269 PLCH2O75038 1416 aa33.89■■■■□ 3.02
C3orf18-211ENST00000491269 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.86■■■■□ 3.01
C3orf18-211ENST00000491269 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.85■■■■□ 3.01
C3orf18-211ENST00000491269 ADGRL1O94910 1474 aa33.84■■■■□ 3.01
C3orf18-211ENST00000491269 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
C3orf18-211ENST00000491269 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.83■■■■□ 3.01
C3orf18-211ENST00000491269 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.79■■■■□ 3
C3orf18-211ENST00000491269 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.76■■■□□ 2.99
C3orf18-211ENST00000491269 RICTORQ6R327 1708 aa33.76■■■□□ 2.99
C3orf18-211ENST00000491269 ARHGAP5Q13017 1502 aa33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms