RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491264.5

HOXB-AS3-213, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3

Gene HOXB-AS3, Length 478 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.33■■■□□ 2.93
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.32■■■□□ 2.92
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.28■■■□□ 2.92
HOXB-AS3-213ENST00000491264 IQGAP2Q13576 1575 aa33.12■■■□□ 2.89
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.07■■■□□ 2.88
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EEA1Q15075 1411 aa33.07■■■□□ 2.88
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PRXQ9BXM0 1461 aa33.06■■■□□ 2.88
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.06■■■□□ 2.88
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.05■■■□□ 2.88
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP32.94■■■□□ 2.86
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PTPRGP23470 1445 aa32.94■■■□□ 2.86
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.93■■■□□ 2.86
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.91■■■□□ 2.86
HOXB-AS3-213ENST00000491264 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.91■■■□□ 2.86
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.9■■■□□ 2.86
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DISP1Q96F81 1524 aa32.86■■■□□ 2.85
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GOLGA3Q08378 1498 aa32.8■■■□□ 2.84
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ADCY10Q96PN6 1610 aa32.78■■■□□ 2.84
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIAA0556O60303 1618 aa32.77■■■□□ 2.84
HOXB-AS3-213ENST00000491264 UACAQ9BZF9 1416 aa32.68■■■□□ 2.82
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIF21BO75037 1637 aa32.67■■■□□ 2.82
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MAPKBP1O60336 1514 aa32.64■■■□□ 2.82
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ABCC2Q92887 1545 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXB-AS3-213ENST00000491264 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.63■■■□□ 2.81
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.57■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.57■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-213ENST00000491264 P3H3Q8IVL6 736 aa32.56■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-213ENST00000491264 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.54■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.53■■■□□ 2.8
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.49■■■□□ 2.79
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SAMD9Q5K651 1589 aa32.47■■■□□ 2.79
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.46■■■□□ 2.79
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ASXL2Q76L83 1435 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.45■■■□□ 2.79
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DIP2BQ9P265 1576 aa32.43■■■□□ 2.78
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ABCA8O94911 1581 aa32.41■■■□□ 2.78
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EFCAB5A4FU69 1503 aa32.36■■■□□ 2.77
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.34■■■□□ 2.77
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARID3CA6NKF2 412 aa32.27■■■□□ 2.76
HOXB-AS3-213ENST00000491264 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.26■■■□□ 2.75
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.24■■■□□ 2.75
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GLI2P10070 1586 aa32.23■■■□□ 2.75
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ATP10BO94823 1461 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TSPOAP1O95153 1857 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KCNH8Q96L42 1107 aa32.17■■■□□ 2.74
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.13■■■□□ 2.73
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FMN1Q68DA7 1419 aa32.11■■■□□ 2.73
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.05■■■□□ 2.72
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.03■■■□□ 2.72
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KDM6BO15054 1643 aa32.02■■■□□ 2.72
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CD109Q6YHK3 1445 aa32■■■□□ 2.71
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.99■■■□□ 2.71
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CFAP43Q8NDM7 1665 aa31.95■■■□□ 2.71
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CLIP1P30622 1438 aa31.94■■■□□ 2.7
HOXB-AS3-213ENST00000491264 HECW1Q76N89 1606 aa31.93■■■□□ 2.7
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa31.9■■■□□ 2.7
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.86■■■□□ 2.69
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ABCA9Q8IUA7 1624 aa31.84■■■□□ 2.69
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa31.79■■■□□ 2.68
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CEP162Q5TB80 1403 aa31.75■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-213ENST00000491264 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.72■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.71■■■□□ 2.67
HOXB-AS3-213ENST00000491264 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.68■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-213ENST00000491264 NEO1Q92859 1461 aa31.66■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARAP3Q8WWN8 1544 aa31.63■■■□□ 2.65
HOXB-AS3-213ENST00000491264 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.62■■■□□ 2.65
HOXB-AS3-213ENST00000491264 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KIF14Q15058 1648 aa31.6■■■□□ 2.65
HOXB-AS3-213ENST00000491264 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa31.6■■■□□ 2.65
HOXB-AS3-213ENST00000491264 FANCAO15360 1455 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXB-AS3-213ENST00000491264 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.56■■■□□ 2.64
HOXB-AS3-213ENST00000491264 PLCH2O75038 1416 aa31.53■■■□□ 2.64
HOXB-AS3-213ENST00000491264 AKNAQ7Z591 1439 aa31.52■■■□□ 2.64
HOXB-AS3-213ENST00000491264 RAPGEF3O95398 923 aa31.51■■■□□ 2.63
HOXB-AS3-213ENST00000491264 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.48■■■□□ 2.63
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MYO5CQ9NQX4 1742 aa31.46■■■□□ 2.63
HOXB-AS3-213ENST00000491264 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB-AS3-213ENST00000491264 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXB-AS3-213ENST00000491264 ADGRL1O94910 1474 aa31.41■■■□□ 2.62
HOXB-AS3-213ENST00000491264 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.37■■■□□ 2.61
HOXB-AS3-213ENST00000491264 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.36■■■□□ 2.61
HOXB-AS3-213ENST00000491264 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa31.35■■■□□ 2.61
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