RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490633.1

LAMTOR4-211, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-211ENST00000490633 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
LAMTOR4-211ENST00000490633 IGF1RP08069 1367 aa24.64■■□□□ 1.53
LAMTOR4-211ENST00000490633 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.63■■□□□ 1.53
LAMTOR4-211ENST00000490633 CUL7Q14999 1698 aa24.61■■□□□ 1.53
LAMTOR4-211ENST00000490633 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.61■■□□□ 1.53
LAMTOR4-211ENST00000490633 KIF27Q86VH2 1401 aa24.61■■□□□ 1.53
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.58■■□□□ 1.53
LAMTOR4-211ENST00000490633 MAPKBP1O60336 1514 aa24.58■■□□□ 1.53
LAMTOR4-211ENST00000490633 DIP2BQ9P265 1576 aa24.56■■□□□ 1.52
LAMTOR4-211ENST00000490633 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.56■■□□□ 1.52
LAMTOR4-211ENST00000490633 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.53■■□□□ 1.52
LAMTOR4-211ENST00000490633 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.46■■□□□ 1.51
LAMTOR4-211ENST00000490633 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LAMTOR4-211ENST00000490633 PTPRGP23470 1445 aa24.41■■□□□ 1.5
LAMTOR4-211ENST00000490633 TSPOAP1O95153 1857 aa24.41■■□□□ 1.5
LAMTOR4-211ENST00000490633 KDM6BO15054 1643 aa24.39■■□□□ 1.49
LAMTOR4-211ENST00000490633 IQGAP2Q13576 1575 aa24.38■■□□□ 1.49
LAMTOR4-211ENST00000490633 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR4-211ENST00000490633 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.35■■□□□ 1.49
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCC2Q92887 1545 aa24.33■■□□□ 1.49
LAMTOR4-211ENST00000490633 DISP1Q96F81 1524 aa24.3■■□□□ 1.48
LAMTOR4-211ENST00000490633 ASXL2Q76L83 1435 aa24.27■■□□□ 1.48
LAMTOR4-211ENST00000490633 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR4-211ENST00000490633 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.24■■□□□ 1.47
LAMTOR4-211ENST00000490633 UACAQ9BZF9 1416 aa24.23■■□□□ 1.47
LAMTOR4-211ENST00000490633 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.23■■□□□ 1.47
LAMTOR4-211ENST00000490633 PLB1Q6P1J6 1458 aa24.21■■□□□ 1.47
LAMTOR4-211ENST00000490633 GLI2P10070 1586 aa24.2■■□□□ 1.47
LAMTOR4-211ENST00000490633 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.2■■□□□ 1.47
LAMTOR4-211ENST00000490633 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.2■■□□□ 1.46
LAMTOR4-211ENST00000490633 KIAA0556O60303 1618 aa24.18■■□□□ 1.46
LAMTOR4-211ENST00000490633 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.15■■□□□ 1.46
LAMTOR4-211ENST00000490633 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
LAMTOR4-211ENST00000490633 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
LAMTOR4-211ENST00000490633 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.1■■□□□ 1.45
LAMTOR4-211ENST00000490633 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.09■■□□□ 1.45
LAMTOR4-211ENST00000490633 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
LAMTOR4-211ENST00000490633 ADGRL1O94910 1474 aa24■■□□□ 1.43
LAMTOR4-211ENST00000490633 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24■■□□□ 1.43
LAMTOR4-211ENST00000490633 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.99■■□□□ 1.43
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCA8O94911 1581 aa23.97■■□□□ 1.43
LAMTOR4-211ENST00000490633 GOLGA3Q08378 1498 aa23.95■■□□□ 1.42
LAMTOR4-211ENST00000490633 PRXQ9BXM0 1461 aa23.95■■□□□ 1.42
LAMTOR4-211ENST00000490633 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.87■■□□□ 1.41
LAMTOR4-211ENST00000490633 CD109Q6YHK3 1445 aa23.86■■□□□ 1.41
LAMTOR4-211ENST00000490633 KCNH8Q96L42 1107 aa23.86■■□□□ 1.41
LAMTOR4-211ENST00000490633 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.84■■□□□ 1.41
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARID3CA6NKF2 412 aa23.82■■□□□ 1.4
LAMTOR4-211ENST00000490633 P3H3Q8IVL6 736 aa23.8■■□□□ 1.4
LAMTOR4-211ENST00000490633 ATP10BO94823 1461 aa23.75■■□□□ 1.39
LAMTOR4-211ENST00000490633 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.74■■□□□ 1.39
LAMTOR4-211ENST00000490633 SAMD9Q5K651 1589 aa23.73■■□□□ 1.39
LAMTOR4-211ENST00000490633 KIF21BO75037 1637 aa23.72■■□□□ 1.39
LAMTOR4-211ENST00000490633 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.68■■□□□ 1.38
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR4-211ENST00000490633 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.67■■□□□ 1.38
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.66■■□□□ 1.38
LAMTOR4-211ENST00000490633 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
LAMTOR4-211ENST00000490633 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
LAMTOR4-211ENST00000490633 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
LAMTOR4-211ENST00000490633 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
LAMTOR4-211ENST00000490633 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.59■■□□□ 1.37
LAMTOR4-211ENST00000490633 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
LAMTOR4-211ENST00000490633 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
LAMTOR4-211ENST00000490633 RAPGEF3O95398 923 aa23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR4-211ENST00000490633 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.55■■□□□ 1.36
LAMTOR4-211ENST00000490633 NEO1Q92859 1461 aa23.53■■□□□ 1.36
LAMTOR4-211ENST00000490633 EEA1Q15075 1411 aa23.52■■□□□ 1.36
LAMTOR4-211ENST00000490633 PHLDB1Q86UU1 1377 aa23.52■■□□□ 1.36
LAMTOR4-211ENST00000490633 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.49■■□□□ 1.35
LAMTOR4-211ENST00000490633 PTPRMP28827 1452 aa23.44■■□□□ 1.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.43■■□□□ 1.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.42■■□□□ 1.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 MADDQ8WXG6 1647 aa23.41■■□□□ 1.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 RICTORQ6R327 1708 aa23.4■■□□□ 1.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.39■■□□□ 1.33
LAMTOR4-211ENST00000490633 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
LAMTOR4-211ENST00000490633 FANCAO15360 1455 aa23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR4-211ENST00000490633 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR4-211ENST00000490633 AKNAQ7Z591 1439 aa23.37■■□□□ 1.33
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LAMTOR4-211ENST00000490633 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.35■■□□□ 1.33
LAMTOR4-211ENST00000490633 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.34■■□□□ 1.33
LAMTOR4-211ENST00000490633 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
LAMTOR4-211ENST00000490633 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.31■■□□□ 1.32
LAMTOR4-211ENST00000490633 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.29■■□□□ 1.32
LAMTOR4-211ENST00000490633 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.28■■□□□ 1.32
LAMTOR4-211ENST00000490633 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR4-211ENST00000490633 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.27■■□□□ 1.32
LAMTOR4-211ENST00000490633 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.26■■□□□ 1.31
LAMTOR4-211ENST00000490633 HECW1Q76N89 1606 aa23.24■■□□□ 1.31
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa23.23■■□□□ 1.31
LAMTOR4-211ENST00000490633 PLCH2O75038 1416 aa23.22■■□□□ 1.31
LAMTOR4-211ENST00000490633 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR4-211ENST00000490633 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
LAMTOR4-211ENST00000490633 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.2■■□□□ 1.3
LAMTOR4-211ENST00000490633 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms