RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490447.6

YIPF3-208, Transcript of Yip1 domain family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene YIPF3, Length 1,321 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3-208ENST00000490447 IGF1RP08069 1367 aa31.03■■■□□ 2.56
YIPF3-208ENST00000490447 CUL7Q14999 1698 aa31.01■■■□□ 2.55
YIPF3-208ENST00000490447 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa30.97■■■□□ 2.55
YIPF3-208ENST00000490447 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP30.94■■■□□ 2.54
YIPF3-208ENST00000490447 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
YIPF3-208ENST00000490447 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.86■■■□□ 2.53
YIPF3-208ENST00000490447 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.84■■■□□ 2.53
YIPF3-208ENST00000490447 MAPKBP1O60336 1514 aa30.8■■■□□ 2.52
YIPF3-208ENST00000490447 ADCY10Q96PN6 1610 aa30.8■■■□□ 2.52
YIPF3-208ENST00000490447 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.79■■■□□ 2.52
YIPF3-208ENST00000490447 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.78■■■□□ 2.52
YIPF3-208ENST00000490447 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa30.72■■■□□ 2.51
YIPF3-208ENST00000490447 PTPRGP23470 1445 aa30.71■■■□□ 2.51
YIPF3-208ENST00000490447 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.7■■■□□ 2.5
YIPF3-208ENST00000490447 DIP2BQ9P265 1576 aa30.69■■■□□ 2.5
YIPF3-208ENST00000490447 IQGAP2Q13576 1575 aa30.68■■■□□ 2.5
YIPF3-208ENST00000490447 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.66■■■□□ 2.5
YIPF3-208ENST00000490447 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.58■■■□□ 2.49
YIPF3-208ENST00000490447 ABCC2Q92887 1545 aa30.55■■■□□ 2.48
YIPF3-208ENST00000490447 DISP1Q96F81 1524 aa30.5■■■□□ 2.47
YIPF3-208ENST00000490447 UACAQ9BZF9 1416 aa30.47■■■□□ 2.47
YIPF3-208ENST00000490447 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.47■■■□□ 2.47
YIPF3-208ENST00000490447 KDM6BO15054 1643 aa30.46■■■□□ 2.47
YIPF3-208ENST00000490447 UGGT2Q9NYU1 1516 aa30.46■■■□□ 2.47
YIPF3-208ENST00000490447 TSPOAP1O95153 1857 aa30.45■■■□□ 2.46
YIPF3-208ENST00000490447 ASXL2Q76L83 1435 aa30.44■■■□□ 2.46
YIPF3-208ENST00000490447 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.44■■■□□ 2.46
YIPF3-208ENST00000490447 KIAA0556O60303 1618 aa30.39■■■□□ 2.46
YIPF3-208ENST00000490447 GLI2P10070 1586 aa30.33■■■□□ 2.45
YIPF3-208ENST00000490447 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.32■■■□□ 2.44
YIPF3-208ENST00000490447 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.29■■■□□ 2.44
YIPF3-208ENST00000490447 GOLGA3Q08378 1498 aa30.26■■■□□ 2.43
YIPF3-208ENST00000490447 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
YIPF3-208ENST00000490447 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
YIPF3-208ENST00000490447 PRXQ9BXM0 1461 aa30.22■■■□□ 2.43
YIPF3-208ENST00000490447 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
YIPF3-208ENST00000490447 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.16■■■□□ 2.42
YIPF3-208ENST00000490447 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.16■■■□□ 2.42
YIPF3-208ENST00000490447 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.15■■■□□ 2.42
YIPF3-208ENST00000490447 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.14■■■□□ 2.42
YIPF3-208ENST00000490447 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
YIPF3-208ENST00000490447 ABCA8O94911 1581 aa30.08■■■□□ 2.41
YIPF3-208ENST00000490447 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
YIPF3-208ENST00000490447 KCNH8Q96L42 1107 aa30.01■■■□□ 2.4
YIPF3-208ENST00000490447 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30■■■□□ 2.39
YIPF3-208ENST00000490447 CD109Q6YHK3 1445 aa29.98■■■□□ 2.39
YIPF3-208ENST00000490447 P3H3Q8IVL6 736 aa29.97■■■□□ 2.39
YIPF3-208ENST00000490447 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.95■■■□□ 2.39
YIPF3-208ENST00000490447 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.93■■■□□ 2.38
YIPF3-208ENST00000490447 ADGRL1O94910 1474 aa29.93■■■□□ 2.38
YIPF3-208ENST00000490447 ARID3CA6NKF2 412 aa29.91■■■□□ 2.38
YIPF3-208ENST00000490447 EEA1Q15075 1411 aa29.89■■■□□ 2.38
YIPF3-208ENST00000490447 SAMD9Q5K651 1589 aa29.87■■■□□ 2.37
YIPF3-208ENST00000490447 ATP10BO94823 1461 aa29.84■■■□□ 2.37
YIPF3-208ENST00000490447 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
YIPF3-208ENST00000490447 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
YIPF3-208ENST00000490447 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
YIPF3-208ENST00000490447 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29.78■■■□□ 2.36
YIPF3-208ENST00000490447 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.7■■■□□ 2.35
YIPF3-208ENST00000490447 FHOD3Q2V2M9 1422 aa29.7■■■□□ 2.34
YIPF3-208ENST00000490447 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.69■■■□□ 2.34
YIPF3-208ENST00000490447 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.67■■■□□ 2.34
YIPF3-208ENST00000490447 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
YIPF3-208ENST00000490447 KIF21BO75037 1637 aa29.62■■■□□ 2.33
YIPF3-208ENST00000490447 EFCAB5A4FU69 1503 aa29.61■■■□□ 2.33
YIPF3-208ENST00000490447 NEO1Q92859 1461 aa29.6■■■□□ 2.33
YIPF3-208ENST00000490447 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.57■■■□□ 2.32
YIPF3-208ENST00000490447 RAPGEF3O95398 923 aa29.53■■■□□ 2.32
YIPF3-208ENST00000490447 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.52■■■□□ 2.32
YIPF3-208ENST00000490447 UBTFP17480 764 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
YIPF3-208ENST00000490447 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.47■■■□□ 2.31
YIPF3-208ENST00000490447 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.41■■■□□ 2.3
YIPF3-208ENST00000490447 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
YIPF3-208ENST00000490447 FANCAO15360 1455 aa29.4■■■□□ 2.3
YIPF3-208ENST00000490447 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.4■■■□□ 2.3
YIPF3-208ENST00000490447 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
YIPF3-208ENST00000490447 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.29
YIPF3-208ENST00000490447 AKNAQ7Z591 1439 aa29.39■■■□□ 2.29
YIPF3-208ENST00000490447 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
YIPF3-208ENST00000490447 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.38■■■□□ 2.29
YIPF3-208ENST00000490447 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
YIPF3-208ENST00000490447 FMN1Q68DA7 1419 aa29.37■■■□□ 2.29
YIPF3-208ENST00000490447 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.35■■■□□ 2.29
YIPF3-208ENST00000490447 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.32■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 PTPRMP28827 1452 aa29.32■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 HECW1Q76N89 1606 aa29.32■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.31■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 RICTORQ6R327 1708 aa29.3■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.3■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.28■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
YIPF3-208ENST00000490447 PLCH2O75038 1416 aa29.24■■■□□ 2.27
YIPF3-208ENST00000490447 MADDQ8WXG6 1647 aa29.23■■■□□ 2.27
YIPF3-208ENST00000490447 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.22■■■□□ 2.27
YIPF3-208ENST00000490447 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.2■■■□□ 2.27
YIPF3-208ENST00000490447 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.19■■■□□ 2.26
YIPF3-208ENST00000490447 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.19■■■□□ 2.26
YIPF3-208ENST00000490447 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.19■■■□□ 2.26
YIPF3-208ENST00000490447 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.7 ms