RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.9■■□□□ 1.9
PRRT4-205ENST00000489835 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.87■■□□□ 1.89
PRRT4-205ENST00000489835 P3H3Q8IVL6 736 aa26.86■■□□□ 1.89
PRRT4-205ENST00000489835 ADAMTS12P58397 1594 aa26.83■■□□□ 1.89
PRRT4-205ENST00000489835 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.83■■□□□ 1.88
PRRT4-205ENST00000489835 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa26.81■■□□□ 1.88
PRRT4-205ENST00000489835 APLP2Q06481 763 aa26.74■■□□□ 1.87
PRRT4-205ENST00000489835 FBLN2P98095 1184 aa26.73■■□□□ 1.87
PRRT4-205ENST00000489835 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
PRRT4-205ENST00000489835 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.68■■□□□ 1.86
PRRT4-205ENST00000489835 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PRRT4-205ENST00000489835 GRIN2AQ12879 1464 aa26.64■■□□□ 1.85
PRRT4-205ENST00000489835 SYNJ2O15056 1496 aa26.6■■□□□ 1.85
PRRT4-205ENST00000489835 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.59■■□□□ 1.85
PRRT4-205ENST00000489835 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PRRT4-205ENST00000489835 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
PRRT4-205ENST00000489835 IQGAP2Q13576 1575 aa26.57■■□□□ 1.84
PRRT4-205ENST00000489835 SAMD9Q5K651 1589 aa26.53■■□□□ 1.84
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.51■■□□□ 1.83
PRRT4-205ENST00000489835 CEP170Q5SW79 1584 aa26.49■■□□□ 1.83
PRRT4-205ENST00000489835 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PRRT4-205ENST00000489835 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 FMN1Q68DA7 1419 aa26.43■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.4■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 NUP160Q12769 1436 aa26.4■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.39■■□□□ 1.82
PRRT4-205ENST00000489835 TIAM1Q13009 1591 aa26.37■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 JPH4Q96JJ6 628 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.36■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 DISP1Q96F81 1524 aa26.34■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 CHD1O14646 1710 aa26.34■■□□□ 1.81
PRRT4-205ENST00000489835 MAP3K1Q13233 1512 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT4-205ENST00000489835 KIAA0556O60303 1618 aa26.3■■□□□ 1.8
PRRT4-205ENST00000489835 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.28■■□□□ 1.8
PRRT4-205ENST00000489835 ARID3CA6NKF2 412 aa26.26■■□□□ 1.79
PRRT4-205ENST00000489835 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.25■■□□□ 1.79
PRRT4-205ENST00000489835 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.24■■□□□ 1.79
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PRRT4-205ENST00000489835 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.18■■□□□ 1.78
PRRT4-205ENST00000489835 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.14■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.13■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 HECW1Q76N89 1606 aa26.12■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.09■■□□□ 1.77
PRRT4-205ENST00000489835 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.07■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa26.06■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa26.05■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 ITGAEP38570 1179 aa26.04■■□□□ 1.76
PRRT4-205ENST00000489835 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.99■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 SHROOM2Q13796 1616 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 PTPRGP23470 1445 aa25.98■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 NCOA2Q15596 1464 aa25.96■■□□□ 1.75
PRRT4-205ENST00000489835 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PRRT4-205ENST00000489835 ABCA8O94911 1581 aa25.9■■□□□ 1.74
PRRT4-205ENST00000489835 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PRRT4-205ENST00000489835 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.86■■□□□ 1.73
PRRT4-205ENST00000489835 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.84■■□□□ 1.73
PRRT4-205ENST00000489835 OSCARQ8IYS5 282 aa25.83■■□□□ 1.73
PRRT4-205ENST00000489835 ATP10BO94823 1461 aa25.83■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGEF11O15085 1522 aa25.82■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 UACAQ9BZF9 1416 aa25.79■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.72
PRRT4-205ENST00000489835 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.76■■□□□ 1.71
PRRT4-205ENST00000489835 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
PRRT4-205ENST00000489835 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PRRT4-205ENST00000489835 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.71■■□□□ 1.71
PRRT4-205ENST00000489835 KIF14Q15058 1648 aa25.69■■□□□ 1.7
PRRT4-205ENST00000489835 ABCC2Q92887 1545 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT4-205ENST00000489835 PTPRKQ15262 1439 aa25.66■■□□□ 1.7
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PRRT4-205ENST00000489835 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.63■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 MIA2Q96PC5 1412 aa25.63■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.61■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.6■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PRRT4-205ENST00000489835 KCNH8Q96L42 1107 aa25.56■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.54■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.52■■□□□ 1.68
PRRT4-205ENST00000489835 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.5■■□□□ 1.67
PRRT4-205ENST00000489835 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.49■■□□□ 1.67
PRRT4-205ENST00000489835 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.48■■□□□ 1.67
PRRT4-205ENST00000489835 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms