RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489824.1

RPS6KB1-208, Transcript of ribosomal protein S6 kinase B1, human

TSL 3

Gene RPS6KB1, Length 909 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KB1-208	ENST00000489824	IGF1R	P08069	1367 aa		33.87	■■■■□ 3.01
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CUL7	Q14999	1698 aa		33.8	■■■■□ 3
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.77	■■■■□ 3
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	33.73	■■■□□ 2.99
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		33.7	■■■□□ 2.98
RPS6KB1-208	ENST00000489824	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		33.55	■■■□□ 2.96
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.54	■■■□□ 2.96
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		33.53	■■■□□ 2.96
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MAPKBP1	O60336	1514 aa		33.52	■■■□□ 2.96
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		33.51	■■■□□ 2.96
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.51	■■■□□ 2.95
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PTPRG	P23470	1445 aa		33.5	■■■□□ 2.95
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
RPS6KB1-208	ENST00000489824	IQGAP2	Q13576	1575 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		33.44	■■■□□ 2.94
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DIP2B	Q9P265	1576 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		33.38	■■■□□ 2.93
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ABCC2	Q92887	1545 aa		33.28	■■■□□ 2.92
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.25	■■■□□ 2.91
RPS6KB1-208	ENST00000489824	UACA	Q9BZF9	1416 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RPS6KB1-208	ENST00000489824	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.22	■■■□□ 2.91
RPS6KB1-208	ENST00000489824	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		33.21	■■■□□ 2.91
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ASXL2	Q76L83	1435 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.18	■■■□□ 2.9
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KDM6B	O15054	1643 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TSPOAP1	O95153	1857 aa		33.13	■■■□□ 2.89
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.12	■■■□□ 2.89
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		33.04	■■■□□ 2.88
RPS6KB1-208	ENST00000489824	GOLGA3	Q08378	1498 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RPS6KB1-208	ENST00000489824	GLI2	P10070	1586 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		33.03	■■■□□ 2.88
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PRX	Q9BXM0	1461 aa		33	■■■□□ 2.87
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	32.95	■■■□□ 2.87
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
RPS6KB1-208	ENST00000489824	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		32.86	■■■□□ 2.85
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		32.85	■■■□□ 2.85
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		32.83	■■■□□ 2.85
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		32.82	■■■□□ 2.84
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ABCA8	O94911	1581 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RPS6KB1-208	ENST00000489824	P3H3	Q8IVL6	736 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KCNH8	Q96L42	1107 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RPS6KB1-208	ENST00000489824	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EEA1	Q15075	1411 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CD109	Q6YHK3	1445 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARID3C	A6NKF2	412 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SAMD9	Q5K651	1589 aa		32.57	■■■□□ 2.8
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ATP10B	O94823	1461 aa		32.56	■■■□□ 2.8
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ADGRL1	O94910	1474 aa		32.55	■■■□□ 2.8
RPS6KB1-208	ENST00000489824	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RPS6KB1-208	ENST00000489824	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		32.48	■■■□□ 2.79
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		32.42	■■■□□ 2.78
RPS6KB1-208	ENST00000489824	KIF21B	O75037	1637 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		32.36	■■■□□ 2.77
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		32.35	■■■□□ 2.77
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		32.34	■■■□□ 2.77
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		32.31	■■■□□ 2.76
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.29	■■■□□ 2.76
RPS6KB1-208	ENST00000489824	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		32.26	■■■□□ 2.75
RPS6KB1-208	ENST00000489824	NEO1	Q92859	1461 aa		32.25	■■■□□ 2.75
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.2	■■■□□ 2.75
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		32.18	■■■□□ 2.74
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	32.11	■■■□□ 2.73
RPS6KB1-208	ENST00000489824	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FMN1	Q68DA7	1419 aa		32.07	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	32.05	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	32.05	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FANCA	O15360	1455 aa		32.05	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.04	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.04	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		32.03	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.02	■■■□□ 2.72
RPS6KB1-208	ENST00000489824	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		31.99	■■■□□ 2.71
RPS6KB1-208	ENST00000489824	HECW1	Q76N89	1606 aa		31.98	■■■□□ 2.71
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PTPRM	P28827	1452 aa		31.91	■■■□□ 2.7
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPS6KB1-208	ENST00000489824	RICTOR	Q6R327	1708 aa		31.9	■■■□□ 2.7
RPS6KB1-208	ENST00000489824	PLCH2	O75038	1416 aa		31.89	■■■□□ 2.7
RPS6KB1-208	ENST00000489824	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		31.86	■■■□□ 2.69
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RPS6KB1-208	ENST00000489824	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RPS6KB1-208	ENST00000489824	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RPS6KB1-208	ENST00000489824	CLIP1	P30622	1438 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RPS6KB1-208	ENST00000489824	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RPS6KB1-208	ENST00000489824	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RPS6KB1-208	ENST00000489824	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.8	■■■□□ 2.68

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