RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489072.5

HMGN1-217, Transcript of high mobility group nucleosome binding domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene HMGN1, Length 1,014 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1-217ENST00000489072 JPH4Q96JJ6 628 aa42.84■■■■■ 4.45
HMGN1-217ENST00000489072 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.83■■■■■ 4.45
HMGN1-217ENST00000489072 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.77■■■■■ 4.44
HMGN1-217ENST00000489072 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.66■■■■■ 4.42
HMGN1-217ENST00000489072 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.55■■■■■ 4.4
HMGN1-217ENST00000489072 IQGAP2Q13576 1575 aa42.48■■■■■ 4.39
HMGN1-217ENST00000489072 PRXQ9BXM0 1461 aa42.31■■■■■ 4.36
HMGN1-217ENST00000489072 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.3■■■■■ 4.36
HMGN1-217ENST00000489072 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.29■■■■■ 4.36
HMGN1-217ENST00000489072 DISP1Q96F81 1524 aa42.24■■■■■ 4.35
HMGN1-217ENST00000489072 PTPRGP23470 1445 aa42.23■■■■■ 4.35
HMGN1-217ENST00000489072 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.23■■■■■ 4.35
HMGN1-217ENST00000489072 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.23■■■■■ 4.35
HMGN1-217ENST00000489072 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.22■■■■■ 4.35
HMGN1-217ENST00000489072 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.16■■■■■ 4.34
HMGN1-217ENST00000489072 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.11■■■■■ 4.33
HMGN1-217ENST00000489072 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.1■■■■■ 4.33
HMGN1-217ENST00000489072 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.1■■■■■ 4.33
HMGN1-217ENST00000489072 KIAA0556O60303 1618 aa42.09■■■■■ 4.33
HMGN1-217ENST00000489072 MAPKBP1O60336 1514 aa42.08■■■■■ 4.33
HMGN1-217ENST00000489072 EEA1Q15075 1411 aa42.03■■■■■ 4.32
HMGN1-217ENST00000489072 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.96■■■■■ 4.31
HMGN1-217ENST00000489072 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.96■■■■■ 4.31
HMGN1-217ENST00000489072 ABCC2Q92887 1545 aa41.95■■■■■ 4.31
HMGN1-217ENST00000489072 UACAQ9BZF9 1416 aa41.95■■■■■ 4.31
HMGN1-217ENST00000489072 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.94■■■■■ 4.3
HMGN1-217ENST00000489072 DIP2BQ9P265 1576 aa41.9■■■■■ 4.3
HMGN1-217ENST00000489072 GOLGA3Q08378 1498 aa41.9■■■■■ 4.3
HMGN1-217ENST00000489072 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
HMGN1-217ENST00000489072 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.86■■■■■ 4.29
HMGN1-217ENST00000489072 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.76■■■■■ 4.28
HMGN1-217ENST00000489072 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.73■■■■■ 4.27
HMGN1-217ENST00000489072 ASXL2Q76L83 1435 aa41.73■■■■■ 4.27
HMGN1-217ENST00000489072 KIF21BO75037 1637 aa41.72■■■■■ 4.27
HMGN1-217ENST00000489072 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
HMGN1-217ENST00000489072 ABCA8O94911 1581 aa41.67■■■■■ 4.26
HMGN1-217ENST00000489072 SAMD9Q5K651 1589 aa41.66■■■■■ 4.26
HMGN1-217ENST00000489072 P3H3Q8IVL6 736 aa41.62■■■■■ 4.25
HMGN1-217ENST00000489072 TSPOAP1O95153 1857 aa41.6■■■■■ 4.25
HMGN1-217ENST00000489072 GLI2P10070 1586 aa41.55■■■■■ 4.24
HMGN1-217ENST00000489072 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
HMGN1-217ENST00000489072 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
HMGN1-217ENST00000489072 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.43■■■■■ 4.22
HMGN1-217ENST00000489072 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
HMGN1-217ENST00000489072 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.41■■■■■ 4.22
HMGN1-217ENST00000489072 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.38■■■■■ 4.22
HMGN1-217ENST00000489072 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.36■■■■■ 4.21
HMGN1-217ENST00000489072 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.35■■■■■ 4.21
HMGN1-217ENST00000489072 KDM6BO15054 1643 aa41.34■■■■■ 4.21
HMGN1-217ENST00000489072 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.33■■■■■ 4.21
HMGN1-217ENST00000489072 ATP10BO94823 1461 aa41.32■■■■■ 4.2
HMGN1-217ENST00000489072 ARID3CA6NKF2 412 aa41.31■■■■■ 4.2
HMGN1-217ENST00000489072 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
HMGN1-217ENST00000489072 KCNH8Q96L42 1107 aa41.21■■■■■ 4.19
HMGN1-217ENST00000489072 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
HMGN1-217ENST00000489072 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.16■■■■■ 4.18
HMGN1-217ENST00000489072 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.14■■■■■ 4.18
HMGN1-217ENST00000489072 CD109Q6YHK3 1445 aa41.1■■■■■ 4.17
HMGN1-217ENST00000489072 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.09■■■■■ 4.17
HMGN1-217ENST00000489072 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.06■■■■■ 4.16
HMGN1-217ENST00000489072 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.05■■■■■ 4.16
HMGN1-217ENST00000489072 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
HMGN1-217ENST00000489072 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
HMGN1-217ENST00000489072 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.97■■■■■ 4.15
HMGN1-217ENST00000489072 FMN1Q68DA7 1419 aa40.93■■■■■ 4.14
HMGN1-217ENST00000489072 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
HMGN1-217ENST00000489072 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.85■■■■■ 4.13
HMGN1-217ENST00000489072 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.84■■■■■ 4.13
HMGN1-217ENST00000489072 HECW1Q76N89 1606 aa40.83■■■■■ 4.13
HMGN1-217ENST00000489072 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
HMGN1-217ENST00000489072 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.72■■■■■ 4.11
HMGN1-217ENST00000489072 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.7■■■■■ 4.11
HMGN1-217ENST00000489072 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.7■■■■■ 4.11
HMGN1-217ENST00000489072 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.66■■■■■ 4.1
HMGN1-217ENST00000489072 NEO1Q92859 1461 aa40.65■■■■■ 4.1
HMGN1-217ENST00000489072 CLIP1P30622 1438 aa40.65■■■■■ 4.1
HMGN1-217ENST00000489072 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.64■■■■■ 4.1
HMGN1-217ENST00000489072 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa40.64■■■■■ 4.1
HMGN1-217ENST00000489072 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
HMGN1-217ENST00000489072 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.59■■■■■ 4.09
HMGN1-217ENST00000489072 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
HMGN1-217ENST00000489072 FANCAO15360 1455 aa40.5■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 KIF14Q15058 1648 aa40.49■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 RAPGEF3O95398 923 aa40.49■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.49■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.48■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 ADGRL1O94910 1474 aa40.48■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.48■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.46■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 AKNAQ7Z591 1439 aa40.46■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 CCDC18Q5T9S5 1454 aa40.45■■■■■ 4.07
HMGN1-217ENST00000489072 PLCH2O75038 1416 aa40.42■■■■■ 4.06
HMGN1-217ENST00000489072 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.4■■■■■ 4.06
HMGN1-217ENST00000489072 RICTORQ6R327 1708 aa40.38■■■■■ 4.05
HMGN1-217ENST00000489072 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.37■■■■■ 4.05
HMGN1-217ENST00000489072 CEP162Q5TB80 1403 aa40.35■■■■■ 4.05
HMGN1-217ENST00000489072 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.26■■■■■ 4.04
HMGN1-217ENST00000489072 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.23■■■■■ 4.03
HMGN1-217ENST00000489072 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.22■■■■■ 4.03
HMGN1-217ENST00000489072 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.21■■■■■ 4.03
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