RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488488.1

TMOD4-205, Transcript of tropomodulin 4, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD4, Length 613 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4-205ENST00000488488 APLP2Q06481 763 aa10.49□□□□□ -0.73
TMOD4-205ENST00000488488 PBRM1Q86U86 1689 aa10.49□□□□□ -0.73
TMOD4-205ENST00000488488 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.48□□□□□ -0.73
TMOD4-205ENST00000488488 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.48□□□□□ -0.73
TMOD4-205ENST00000488488 MAP3K1Q13233 1512 aa10.46□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 SAMD9Q5K651 1589 aa10.43□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.42□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.41□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 TIAM1Q13009 1591 aa10.4□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
TMOD4-205ENST00000488488 FMN1Q68DA7 1419 aa10.4□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.4□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 IQGAP2Q13576 1575 aa10.38□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.38□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 GRIN2AQ12879 1464 aa10.37□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 SYNJ2O15056 1496 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.36□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 P3H3Q8IVL6 736 aa10.35□□□□□ -0.75
TMOD4-205ENST00000488488 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
TMOD4-205ENST00000488488 NUP160Q12769 1436 aa10.31□□□□□ -0.76
TMOD4-205ENST00000488488 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.3□□□□□ -0.76
TMOD4-205ENST00000488488 KIAA0556O60303 1618 aa10.29□□□□□ -0.76
TMOD4-205ENST00000488488 DISP1Q96F81 1524 aa10.28□□□□□ -0.76
TMOD4-205ENST00000488488 CEP170Q5SW79 1584 aa10.28□□□□□ -0.76
TMOD4-205ENST00000488488 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
TMOD4-205ENST00000488488 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.28□□□□□ -0.76
TMOD4-205ENST00000488488 HECW1Q76N89 1606 aa10.27□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.26□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.25□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.23□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.23□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.21□□□□□ -0.77
TMOD4-205ENST00000488488 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.21□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 ARHGEF11O15085 1522 aa10.21□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 FBLN2P98095 1184 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 NCOA2Q15596 1464 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 FGD6Q6ZV73 1430 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 JPH4Q96JJ6 628 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 CLSPNQ9HAW4 1339 aa10.15□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TMOD4-205ENST00000488488 CHD1O14646 1710 aa10.14□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.13□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 ABCA8O94911 1581 aa10.13□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 SHROOM2Q13796 1616 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 MIA2Q96PC5 1412 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 SETD5Q9C0A6 1442 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 PTPN23Q9H3S7 1636 aa10.11□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 ITGAEP38570 1179 aa10.1□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD4-205ENST00000488488 HFM1A2PYH4 1435 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 PTPRGP23470 1445 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 ARID3CA6NKF2 412 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 PTPRKQ15262 1439 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 AKNAQ7Z591 1439 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 ATP10BO94823 1461 aa10.05□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 UACAQ9BZF9 1416 aa10.04□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 MAPKBP1O60336 1514 aa10.03□□□□□ -0.8
TMOD4-205ENST00000488488 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10.02□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 NAIPQ13075 1403 aa10.01□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 KIF14Q15058 1648 aa10.01□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 ABCC10Q5T3U5 1492 aa10.01□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 ABCC2Q92887 1545 aa10.01□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.01□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 ROCK1Q13464 1354 aa10□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 DAPK1P53355 1430 aa9.99□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 GCC2Q8IWJ2 1684 aa9.99□□□□□ -0.81
TMOD4-205ENST00000488488 ABCC5O15440 1437 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms