RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488452.5

NELFA-215, Transcript of negative elongation factor complex member A, humanhuman

TSL 4

Gene NELFA, Length 560 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFA-215ENST00000488452 IGF1RP08069 1367 aa26.64■■□□□ 1.86
NELFA-215ENST00000488452 KIF27Q86VH2 1401 aa26.61■■□□□ 1.85
NELFA-215ENST00000488452 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
NELFA-215ENST00000488452 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.57■■□□□ 1.84
NELFA-215ENST00000488452 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.55■■□□□ 1.84
NELFA-215ENST00000488452 CUL7Q14999 1698 aa26.53■■□□□ 1.84
NELFA-215ENST00000488452 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.5■■□□□ 1.83
NELFA-215ENST00000488452 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.48■■□□□ 1.83
NELFA-215ENST00000488452 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.46■■□□□ 1.83
NELFA-215ENST00000488452 MAPKBP1O60336 1514 aa26.45■■□□□ 1.83
NELFA-215ENST00000488452 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFA-215ENST00000488452 PTPRGP23470 1445 aa26.37■■□□□ 1.81
NELFA-215ENST00000488452 DIP2BQ9P265 1576 aa26.36■■□□□ 1.81
NELFA-215ENST00000488452 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFA-215ENST00000488452 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
NELFA-215ENST00000488452 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFA-215ENST00000488452 IQGAP2Q13576 1575 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFA-215ENST00000488452 ABCC2Q92887 1545 aa26.21■■□□□ 1.79
NELFA-215ENST00000488452 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.18■■□□□ 1.78
NELFA-215ENST00000488452 KDM6BO15054 1643 aa26.17■■□□□ 1.78
NELFA-215ENST00000488452 TSPOAP1O95153 1857 aa26.17■■□□□ 1.78
NELFA-215ENST00000488452 DISP1Q96F81 1524 aa26.16■■□□□ 1.78
NELFA-215ENST00000488452 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa26.16■■□□□ 1.78
NELFA-215ENST00000488452 UACAQ9BZF9 1416 aa26.15■■□□□ 1.78
NELFA-215ENST00000488452 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.15■■□□□ 1.78
NELFA-215ENST00000488452 ASXL2Q76L83 1435 aa26.14■■□□□ 1.78
NELFA-215ENST00000488452 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.1■■□□□ 1.77
NELFA-215ENST00000488452 GLI2P10070 1586 aa26.07■■□□□ 1.76
NELFA-215ENST00000488452 KDM5BQ9UGL1 1544 aa26.04■■□□□ 1.76
NELFA-215ENST00000488452 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.03■■□□□ 1.76
NELFA-215ENST00000488452 KIAA0556O60303 1618 aa26.01■■□□□ 1.75
NELFA-215ENST00000488452 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
NELFA-215ENST00000488452 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
NELFA-215ENST00000488452 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
NELFA-215ENST00000488452 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.91■■□□□ 1.74
NELFA-215ENST00000488452 GOLGA3Q08378 1498 aa25.91■■□□□ 1.74
NELFA-215ENST00000488452 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.9■■□□□ 1.74
NELFA-215ENST00000488452 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.87■■□□□ 1.73
NELFA-215ENST00000488452 PRXQ9BXM0 1461 aa25.87■■□□□ 1.73
NELFA-215ENST00000488452 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NELFA-215ENST00000488452 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.85■■□□□ 1.73
NELFA-215ENST00000488452 ABCA8O94911 1581 aa25.81■■□□□ 1.72
NELFA-215ENST00000488452 KCNH8Q96L42 1107 aa25.79■■□□□ 1.72
NELFA-215ENST00000488452 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
NELFA-215ENST00000488452 CD109Q6YHK3 1445 aa25.75■■□□□ 1.71
NELFA-215ENST00000488452 ADGRL1O94910 1474 aa25.74■■□□□ 1.71
NELFA-215ENST00000488452 P3H3Q8IVL6 736 aa25.71■■□□□ 1.71
NELFA-215ENST00000488452 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.71■■□□□ 1.71
NELFA-215ENST00000488452 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.7■■□□□ 1.7
NELFA-215ENST00000488452 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.69■■□□□ 1.7
NELFA-215ENST00000488452 ARID3CA6NKF2 412 aa25.64■■□□□ 1.7
NELFA-215ENST00000488452 ATP10BO94823 1461 aa25.62■■□□□ 1.69
NELFA-215ENST00000488452 SAMD9Q5K651 1589 aa25.56■■□□□ 1.68
NELFA-215ENST00000488452 EEA1Q15075 1411 aa25.52■■□□□ 1.68
NELFA-215ENST00000488452 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.52■■□□□ 1.68
NELFA-215ENST00000488452 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
NELFA-215ENST00000488452 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
NELFA-215ENST00000488452 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.49■■□□□ 1.67
NELFA-215ENST00000488452 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.49■■□□□ 1.67
NELFA-215ENST00000488452 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
NELFA-215ENST00000488452 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.48■■□□□ 1.67
NELFA-215ENST00000488452 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
NELFA-215ENST00000488452 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.41■■□□□ 1.66
NELFA-215ENST00000488452 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.4■■□□□ 1.66
NELFA-215ENST00000488452 RAPGEF3O95398 923 aa25.4■■□□□ 1.66
NELFA-215ENST00000488452 KIF21BO75037 1637 aa25.4■■□□□ 1.66
NELFA-215ENST00000488452 NEO1Q92859 1461 aa25.4■■□□□ 1.66
NELFA-215ENST00000488452 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.37■■□□□ 1.65
NELFA-215ENST00000488452 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NELFA-215ENST00000488452 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFA-215ENST00000488452 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFA-215ENST00000488452 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFA-215ENST00000488452 AKNAQ7Z591 1439 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFA-215ENST00000488452 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NELFA-215ENST00000488452 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
NELFA-215ENST00000488452 PTPRMP28827 1452 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFA-215ENST00000488452 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
NELFA-215ENST00000488452 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NELFA-215ENST00000488452 FANCAO15360 1455 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFA-215ENST00000488452 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFA-215ENST00000488452 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFA-215ENST00000488452 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.16■■□□□ 1.62
NELFA-215ENST00000488452 RICTORQ6R327 1708 aa25.15■■□□□ 1.62
NELFA-215ENST00000488452 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NELFA-215ENST00000488452 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.14■■□□□ 1.61
NELFA-215ENST00000488452 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NELFA-215ENST00000488452 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.12■■□□□ 1.61
NELFA-215ENST00000488452 FMN1Q68DA7 1419 aa25.11■■□□□ 1.61
NELFA-215ENST00000488452 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFA-215ENST00000488452 MADDQ8WXG6 1647 aa25.1■■□□□ 1.61
NELFA-215ENST00000488452 PLCH2O75038 1416 aa25.09■■□□□ 1.61
NELFA-215ENST00000488452 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
NELFA-215ENST00000488452 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.07■■□□□ 1.6
NELFA-215ENST00000488452 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.06■■□□□ 1.6
NELFA-215ENST00000488452 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFA-215ENST00000488452 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFA-215ENST00000488452 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFA-215ENST00000488452 HECW1Q76N89 1606 aa25.04■■□□□ 1.6
NELFA-215ENST00000488452 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFA-215ENST00000488452 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.03■■□□□ 1.6
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