RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.99■■■■□ 3.83
PTPN4-211ENST00000488279 CUL7Q14999 1698 aa38.97■■■■□ 3.83
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PTPN4-211ENST00000488279 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.94■■■■□ 3.82
PTPN4-211ENST00000488279 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP38.74■■■■□ 3.79
PTPN4-211ENST00000488279 PTPRGP23470 1445 aa38.58■■■■□ 3.77
PTPN4-211ENST00000488279 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa38.58■■■■□ 3.77
PTPN4-211ENST00000488279 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.58■■■■□ 3.77
PTPN4-211ENST00000488279 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.54■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 IQGAP2Q13576 1575 aa38.53■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 ADCY10Q96PN6 1610 aa38.52■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 FAM69CQ0P6D2 419 aa38.51■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 TNIKQ9UKE5 1360 aa38.51■■■■□ 3.76
PTPN4-211ENST00000488279 MAPKBP1O60336 1514 aa38.47■■■■□ 3.75
PTPN4-211ENST00000488279 ABCC10Q5T3U5 1492 aa38.45■■■■□ 3.75
PTPN4-211ENST00000488279 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.41■■■■□ 3.74
PTPN4-211ENST00000488279 DISP1Q96F81 1524 aa38.36■■■■□ 3.73
PTPN4-211ENST00000488279 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.33■■■■□ 3.73
PTPN4-211ENST00000488279 ABCC2Q92887 1545 aa38.28■■■■□ 3.72
PTPN4-211ENST00000488279 DIP2BQ9P265 1576 aa38.27■■■■□ 3.72
PTPN4-211ENST00000488279 UACAQ9BZF9 1416 aa38.26■■■■□ 3.72
PTPN4-211ENST00000488279 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa38.23■■■■□ 3.71
PTPN4-211ENST00000488279 PRXQ9BXM0 1461 aa38.23■■■■□ 3.71
PTPN4-211ENST00000488279 KIAA0556O60303 1618 aa38.16■■■■□ 3.7
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PTPN4-211ENST00000488279 ASXL2Q76L83 1435 aa38.13■■■■□ 3.7
PTPN4-211ENST00000488279 PLB1Q6P1J6 1458 aa38.13■■■■□ 3.69
PTPN4-211ENST00000488279 CSRNP3Q8WYN3 585 aa38.11■■■■□ 3.69
PTPN4-211ENST00000488279 GOLGA3Q08378 1498 aa38.09■■■■□ 3.69
PTPN4-211ENST00000488279 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.08■■■■□ 3.69
PTPN4-211ENST00000488279 KDM5BQ9UGL1 1544 aa38.05■■■■□ 3.68
PTPN4-211ENST00000488279 TSPOAP1O95153 1857 aa37.96■■■■□ 3.67
PTPN4-211ENST00000488279 GLI2P10070 1586 aa37.94■■■■□ 3.66
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PTPN4-211ENST00000488279 EEA1Q15075 1411 aa37.92■■■■□ 3.66
PTPN4-211ENST00000488279 KDM6BO15054 1643 aa37.9■■■■□ 3.66
PTPN4-211ENST00000488279 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
PTPN4-211ENST00000488279 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
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PTPN4-211ENST00000488279 ABCA8O94911 1581 aa37.81■■■■□ 3.64
PTPN4-211ENST00000488279 WDR7Q9Y4E6 1490 aa37.78■■■■□ 3.64
PTPN4-211ENST00000488279 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP37.72■■■■□ 3.63
PTPN4-211ENST00000488279 KCNH8Q96L42 1107 aa37.72■■■■□ 3.63
PTPN4-211ENST00000488279 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa37.7■■■■□ 3.63
PTPN4-211ENST00000488279 TEX14Q8IWB6 1497 aa37.68■■■■□ 3.62
PTPN4-211ENST00000488279 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
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PTPN4-211ENST00000488279 SAMD9Q5K651 1589 aa37.62■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.6■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 CD109Q6YHK3 1445 aa37.59■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 ATP10BO94823 1461 aa37.58■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
PTPN4-211ENST00000488279 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa37.53■■■■□ 3.6
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PTPN4-211ENST00000488279 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.49■■■■□ 3.59
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PTPN4-211ENST00000488279 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.45■■■■□ 3.59
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PTPN4-211ENST00000488279 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.36■■■■□ 3.57
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PTPN4-211ENST00000488279 ABCA9Q8IUA7 1624 aa37.24■■■■□ 3.55
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PTPN4-211ENST00000488279 ADGRL1O94910 1474 aa37.21■■■■□ 3.55
PTPN4-211ENST00000488279 ARAP3Q8WWN8 1544 aa37.2■■■■□ 3.55
PTPN4-211ENST00000488279 NEO1Q92859 1461 aa37.1■■■■□ 3.53
PTPN4-211ENST00000488279 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
PTPN4-211ENST00000488279 FMN1Q68DA7 1419 aa37.1■■■■□ 3.53
PTPN4-211ENST00000488279 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa37.07■■■■□ 3.53
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PTPN4-211ENST00000488279 HECW1Q76N89 1606 aa36.9■■■■□ 3.5
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PTPN4-211ENST00000488279 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.8■■■■□ 3.48
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PTPN4-211ENST00000488279 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
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PTPN4-211ENST00000488279 KIF14Q15058 1648 aa36.63■■■■□ 3.45
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PTPN4-211ENST00000488279 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.59■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.58■■■■□ 3.45
PTPN4-211ENST00000488279 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.45
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