RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.3■□□□□ 0.68
NISCH-211ENST00000488243 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.28■□□□□ 0.68
NISCH-211ENST00000488243 IGF1RP08069 1367 aa19.27■□□□□ 0.68
NISCH-211ENST00000488243 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.25■□□□□ 0.67
NISCH-211ENST00000488243 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-211ENST00000488243 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
NISCH-211ENST00000488243 CUL7Q14999 1698 aa19.21■□□□□ 0.67
NISCH-211ENST00000488243 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-211ENST00000488243 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.2■□□□□ 0.66
NISCH-211ENST00000488243 JPH4Q96JJ6 628 aa19.18■□□□□ 0.66
NISCH-211ENST00000488243 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
NISCH-211ENST00000488243 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.17■□□□□ 0.66
NISCH-211ENST00000488243 PRXQ9BXM0 1461 aa19.16■□□□□ 0.66
NISCH-211ENST00000488243 ABCC10Q5T3U5 1492 aa19.16■□□□□ 0.66
NISCH-211ENST00000488243 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.13■□□□□ 0.65
NISCH-211ENST00000488243 KIF21BO75037 1637 aa19.12■□□□□ 0.65
NISCH-211ENST00000488243 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa19.12■□□□□ 0.65
NISCH-211ENST00000488243 KDM6BO15054 1643 aa19.08■□□□□ 0.65
NISCH-211ENST00000488243 DIP2BQ9P265 1576 aa19.08■□□□□ 0.65
NISCH-211ENST00000488243 MAPKBP1O60336 1514 aa19.07■□□□□ 0.64
NISCH-211ENST00000488243 GOLGA3Q08378 1498 aa19.05■□□□□ 0.64
NISCH-211ENST00000488243 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.05■□□□□ 0.64
NISCH-211ENST00000488243 TSPOAP1O95153 1857 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-211ENST00000488243 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.96■□□□□ 0.63
NISCH-211ENST00000488243 UBTFP17480 764 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
NISCH-211ENST00000488243 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-211ENST00000488243 PTPRGP23470 1445 aa18.88■□□□□ 0.61
NISCH-211ENST00000488243 ADGRL1O94910 1474 aa18.87■□□□□ 0.61
NISCH-211ENST00000488243 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.86■□□□□ 0.61
NISCH-211ENST00000488243 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.85■□□□□ 0.61
NISCH-211ENST00000488243 IQGAP2Q13576 1575 aa18.82■□□□□ 0.6
NISCH-211ENST00000488243 ABCC2Q92887 1545 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-211ENST00000488243 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-211ENST00000488243 ASXL2Q76L83 1435 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-211ENST00000488243 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.81■□□□□ 0.6
NISCH-211ENST00000488243 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.79■□□□□ 0.6
NISCH-211ENST00000488243 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
NISCH-211ENST00000488243 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.77■□□□□ 0.6
NISCH-211ENST00000488243 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.77■□□□□ 0.59
NISCH-211ENST00000488243 GLI2P10070 1586 aa18.75■□□□□ 0.59
NISCH-211ENST00000488243 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
NISCH-211ENST00000488243 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.73■□□□□ 0.59
NISCH-211ENST00000488243 UACAQ9BZF9 1416 aa18.72■□□□□ 0.59
NISCH-211ENST00000488243 CEP162Q5TB80 1403 aa18.71■□□□□ 0.59
NISCH-211ENST00000488243 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.71■□□□□ 0.59
NISCH-211ENST00000488243 CLIP1P30622 1438 aa18.7■□□□□ 0.58
NISCH-211ENST00000488243 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
NISCH-211ENST00000488243 DISP1Q96F81 1524 aa18.68■□□□□ 0.58
NISCH-211ENST00000488243 SAMD9Q5K651 1589 aa18.67■□□□□ 0.58
NISCH-211ENST00000488243 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.65■□□□□ 0.58
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-211ENST00000488243 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.64■□□□□ 0.57
NISCH-211ENST00000488243 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
NISCH-211ENST00000488243 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.63■□□□□ 0.57
NISCH-211ENST00000488243 FBXO41Q8TF61 875 aa18.62■□□□□ 0.57
NISCH-211ENST00000488243 KIAA0556O60303 1618 aa18.62■□□□□ 0.57
NISCH-211ENST00000488243 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
NISCH-211ENST00000488243 FMN1Q68DA7 1419 aa18.57■□□□□ 0.56
NISCH-211ENST00000488243 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.55■□□□□ 0.56
NISCH-211ENST00000488243 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.52■□□□□ 0.56
NISCH-211ENST00000488243 P3H3Q8IVL6 736 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-211ENST00000488243 KCNH8Q96L42 1107 aa18.51■□□□□ 0.55
NISCH-211ENST00000488243 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-211ENST00000488243 CD109Q6YHK3 1445 aa18.49■□□□□ 0.55
NISCH-211ENST00000488243 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.46■□□□□ 0.55
NISCH-211ENST00000488243 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.45■□□□□ 0.54
NISCH-211ENST00000488243 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.44■□□□□ 0.54
NISCH-211ENST00000488243 ABCA8O94911 1581 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-211ENST00000488243 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.42■□□□□ 0.54
NISCH-211ENST00000488243 ARID3CA6NKF2 412 aa18.4■□□□□ 0.54
NISCH-211ENST00000488243 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.39■□□□□ 0.53
NISCH-211ENST00000488243 HECW1Q76N89 1606 aa18.38■□□□□ 0.53
NISCH-211ENST00000488243 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
NISCH-211ENST00000488243 MAP3K1Q13233 1512 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-211ENST00000488243 PTPRMP28827 1452 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-211ENST00000488243 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.34■□□□□ 0.53
NISCH-211ENST00000488243 APLP2Q06481 763 aa18.33■□□□□ 0.52
NISCH-211ENST00000488243 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
NISCH-211ENST00000488243 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.31■□□□□ 0.52
NISCH-211ENST00000488243 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.3■□□□□ 0.52
NISCH-211ENST00000488243 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
NISCH-211ENST00000488243 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
NISCH-211ENST00000488243 ATP10BO94823 1461 aa18.28■□□□□ 0.52
NISCH-211ENST00000488243 RAPGEF3O95398 923 aa18.26■□□□□ 0.51
NISCH-211ENST00000488243 ABCA9Q8IUA7 1624 aa18.25■□□□□ 0.51
NISCH-211ENST00000488243 TIAM1Q13009 1591 aa18.23■□□□□ 0.51
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-211ENST00000488243 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-211ENST00000488243 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
NISCH-211ENST00000488243 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.21■□□□□ 0.51
NISCH-211ENST00000488243 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 MADDQ8WXG6 1647 aa18.2■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 NEO1Q92859 1461 aa18.19■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa18.17■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.17■□□□□ 0.5
NISCH-211ENST00000488243 MTUS2Q5JR59 1369 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms