RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMP-208ENST00000487577 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.58■■■■□ 3.77
TYMP-208ENST00000487577 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.54■■■■□ 3.76
TYMP-208ENST00000487577 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
TYMP-208ENST00000487577 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
TYMP-208ENST00000487577 EFCAB5A4FU69 1503 aa38.39■■■■□ 3.74
TYMP-208ENST00000487577 APLP2Q06481 763 aa38.37■■■■□ 3.73
TYMP-208ENST00000487577 GRIN2AQ12879 1464 aa38.32■■■■□ 3.72
TYMP-208ENST00000487577 SYNJ2O15056 1496 aa38.31■■■■□ 3.72
TYMP-208ENST00000487577 P3H3Q8IVL6 736 aa38.27■■■■□ 3.72
TYMP-208ENST00000487577 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
TYMP-208ENST00000487577 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.26■■■■□ 3.72
TYMP-208ENST00000487577 IQGAP2Q13576 1575 aa38.25■■■■□ 3.71
TYMP-208ENST00000487577 FHOD3Q2V2M9 1422 aa38.22■■■■□ 3.71
TYMP-208ENST00000487577 SAMD9Q5K651 1589 aa38.21■■■■□ 3.71
TYMP-208ENST00000487577 FBLN2P98095 1184 aa38.19■■■■□ 3.7
TYMP-208ENST00000487577 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.15■■■■□ 3.7
TYMP-208ENST00000487577 FMN1Q68DA7 1419 aa38.07■■■■□ 3.68
TYMP-208ENST00000487577 CEP170Q5SW79 1584 aa38.06■■■■□ 3.68
TYMP-208ENST00000487577 UGGT2Q9NYU1 1516 aa38.05■■■■□ 3.68
TYMP-208ENST00000487577 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP38.04■■■■□ 3.68
TYMP-208ENST00000487577 NUP160Q12769 1436 aa38.01■■■■□ 3.68
TYMP-208ENST00000487577 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa37.97■■■■□ 3.67
TYMP-208ENST00000487577 FYCO1Q9BQS8 1478 aa37.97■■■■□ 3.67
TYMP-208ENST00000487577 MAP3K1Q13233 1512 aa37.94■■■■□ 3.66
TYMP-208ENST00000487577 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
TYMP-208ENST00000487577 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.92■■■■□ 3.66
TYMP-208ENST00000487577 TIAM1Q13009 1591 aa37.92■■■■□ 3.66
TYMP-208ENST00000487577 CHD1O14646 1710 aa37.89■■■■□ 3.66
TYMP-208ENST00000487577 KIAA0556O60303 1618 aa37.86■■■■□ 3.65
TYMP-208ENST00000487577 DISP1Q96F81 1524 aa37.84■■■■□ 3.65
TYMP-208ENST00000487577 CFAP43Q8NDM7 1665 aa37.84■■■■□ 3.65
TYMP-208ENST00000487577 JPH4Q96JJ6 628 aa37.78■■■■□ 3.64
TYMP-208ENST00000487577 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.75■■■■□ 3.63
TYMP-208ENST00000487577 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.71■■■■□ 3.63
TYMP-208ENST00000487577 HECW1Q76N89 1606 aa37.66■■■■□ 3.62
TYMP-208ENST00000487577 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa37.64■■■■□ 3.62
TYMP-208ENST00000487577 CCDC18Q5T9S5 1454 aa37.59■■■■□ 3.61
TYMP-208ENST00000487577 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
TYMP-208ENST00000487577 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa37.51■■■■□ 3.59
TYMP-208ENST00000487577 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.51■■■■□ 3.59
TYMP-208ENST00000487577 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
TYMP-208ENST00000487577 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
TYMP-208ENST00000487577 HRCP23327 699 aa37.48■■■■□ 3.59
TYMP-208ENST00000487577 SHROOM2Q13796 1616 aa37.47■■■■□ 3.59
TYMP-208ENST00000487577 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.41■■■■□ 3.58
TYMP-208ENST00000487577 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.41■■■■□ 3.58
TYMP-208ENST00000487577 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.41■■■■□ 3.58
TYMP-208ENST00000487577 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.41■■■■□ 3.58
TYMP-208ENST00000487577 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
TYMP-208ENST00000487577 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
TYMP-208ENST00000487577 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP37.4■■■■□ 3.58
TYMP-208ENST00000487577 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.39■■■■□ 3.58
TYMP-208ENST00000487577 ARID3CA6NKF2 412 aa37.37■■■■□ 3.57
TYMP-208ENST00000487577 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.33■■■■□ 3.57
TYMP-208ENST00000487577 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa37.32■■■■□ 3.57
TYMP-208ENST00000487577 PTPRGP23470 1445 aa37.31■■■■□ 3.56
TYMP-208ENST00000487577 ABCA8O94911 1581 aa37.29■■■■□ 3.56
TYMP-208ENST00000487577 NCOA2Q15596 1464 aa37.27■■■■□ 3.56
TYMP-208ENST00000487577 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
TYMP-208ENST00000487577 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP37.22■■■■□ 3.55
TYMP-208ENST00000487577 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.22■■■■□ 3.55
TYMP-208ENST00000487577 ARHGEF11O15085 1522 aa37.16■■■■□ 3.54
TYMP-208ENST00000487577 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
TYMP-208ENST00000487577 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.14■■■■□ 3.54
TYMP-208ENST00000487577 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.14■■■■□ 3.54
TYMP-208ENST00000487577 ITGAEP38570 1179 aa37.1■■■■□ 3.53
TYMP-208ENST00000487577 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
TYMP-208ENST00000487577 UACAQ9BZF9 1416 aa37.09■■■■□ 3.53
TYMP-208ENST00000487577 OSCARQ8IYS5 282 aa37.09■■■■□ 3.53
TYMP-208ENST00000487577 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.08■■■■□ 3.53
TYMP-208ENST00000487577 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
TYMP-208ENST00000487577 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
TYMP-208ENST00000487577 ATP10BO94823 1461 aa37.06■■■■□ 3.52
TYMP-208ENST00000487577 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.97■■■■□ 3.51
TYMP-208ENST00000487577 ABCC2Q92887 1545 aa36.96■■■■□ 3.51
TYMP-208ENST00000487577 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.95■■■■□ 3.51
TYMP-208ENST00000487577 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.93■■■■□ 3.5
TYMP-208ENST00000487577 MIA2Q96PC5 1412 aa36.91■■■■□ 3.5
TYMP-208ENST00000487577 KIF14Q15058 1648 aa36.87■■■■□ 3.49
TYMP-208ENST00000487577 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
TYMP-208ENST00000487577 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.84■■■■□ 3.49
TYMP-208ENST00000487577 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.79■■■■□ 3.48
TYMP-208ENST00000487577 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.74■■■■□ 3.47
TYMP-208ENST00000487577 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
TYMP-208ENST00000487577 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
TYMP-208ENST00000487577 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.71■■■■□ 3.47
TYMP-208ENST00000487577 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.71■■■■□ 3.47
TYMP-208ENST00000487577 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.7■■■■□ 3.47
TYMP-208ENST00000487577 PTPRKQ15262 1439 aa36.69■■■■□ 3.46
TYMP-208ENST00000487577 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
TYMP-208ENST00000487577 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa36.63■■■■□ 3.46
TYMP-208ENST00000487577 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
TYMP-208ENST00000487577 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
TYMP-208ENST00000487577 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa36.59■■■■□ 3.45
TYMP-208ENST00000487577 HFM1A2PYH4 1435 aa36.56■■■■□ 3.44
TYMP-208ENST00000487577 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.56■■■■□ 3.44
TYMP-208ENST00000487577 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
TYMP-208ENST00000487577 DAPK1P53355 1430 aa36.54■■■■□ 3.44
TYMP-208ENST00000487577 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.51■■■■□ 3.44
TYMP-208ENST00000487577 KCNH8Q96L42 1107 aa36.5■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.5 ms