RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486418.5

TIMMDC1-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TIMMDC1, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-205ENST00000486418 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.69■■□□□ 1.7
TIMMDC1-205ENST00000486418 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.68■■□□□ 1.7
TIMMDC1-205ENST00000486418 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
TIMMDC1-205ENST00000486418 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.59■■□□□ 1.69
TIMMDC1-205ENST00000486418 IQGAP2Q13576 1575 aa25.48■■□□□ 1.67
TIMMDC1-205ENST00000486418 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMMDC1-205ENST00000486418 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.43■■□□□ 1.66
TIMMDC1-205ENST00000486418 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
TIMMDC1-205ENST00000486418 PRXQ9BXM0 1461 aa25.4■■□□□ 1.66
TIMMDC1-205ENST00000486418 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.38■■□□□ 1.65
TIMMDC1-205ENST00000486418 PTPRGP23470 1445 aa25.37■■□□□ 1.65
TIMMDC1-205ENST00000486418 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TIMMDC1-205ENST00000486418 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.36■■□□□ 1.65
TIMMDC1-205ENST00000486418 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.35■■□□□ 1.65
TIMMDC1-205ENST00000486418 EEA1Q15075 1411 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMMDC1-205ENST00000486418 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.32■■□□□ 1.64
TIMMDC1-205ENST00000486418 DISP1Q96F81 1524 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMMDC1-205ENST00000486418 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.3■■□□□ 1.64
TIMMDC1-205ENST00000486418 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIAA0556O60303 1618 aa25.22■■□□□ 1.63
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.21■■□□□ 1.63
TIMMDC1-205ENST00000486418 GOLGA3Q08378 1498 aa25.21■■□□□ 1.63
TIMMDC1-205ENST00000486418 UACAQ9BZF9 1416 aa25.18■■□□□ 1.62
TIMMDC1-205ENST00000486418 MAPKBP1O60336 1514 aa25.17■■□□□ 1.62
TIMMDC1-205ENST00000486418 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.15■■□□□ 1.62
TIMMDC1-205ENST00000486418 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.14■■□□□ 1.62
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCC2Q92887 1545 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.11■■□□□ 1.61
TIMMDC1-205ENST00000486418 P3H3Q8IVL6 736 aa25.08■■□□□ 1.61
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIF21BO75037 1637 aa25.08■■□□□ 1.6
TIMMDC1-205ENST00000486418 DIP2BQ9P265 1576 aa25.04■■□□□ 1.6
TIMMDC1-205ENST00000486418 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMMDC1-205ENST00000486418 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
TIMMDC1-205ENST00000486418 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.02■■□□□ 1.6
TIMMDC1-205ENST00000486418 ASXL2Q76L83 1435 aa25.01■■□□□ 1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 TSPOAP1O95153 1857 aa24.98■■□□□ 1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.98■■□□□ 1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCA8O94911 1581 aa24.97■■□□□ 1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 SAMD9Q5K651 1589 aa24.97■■□□□ 1.59
TIMMDC1-205ENST00000486418 GLI2P10070 1586 aa24.89■■□□□ 1.58
TIMMDC1-205ENST00000486418 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 EFCAB5A4FU69 1503 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 KCNH8Q96L42 1107 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 FHOD3Q2V2M9 1422 aa24.83■■□□□ 1.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.83■■□□□ 1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.83■■□□□ 1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARID3CA6NKF2 412 aa24.82■■□□□ 1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 ATP10BO94823 1461 aa24.8■■□□□ 1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TIMMDC1-205ENST00000486418 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.76■■□□□ 1.55
TIMMDC1-205ENST00000486418 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
TIMMDC1-205ENST00000486418 KDM6BO15054 1643 aa24.74■■□□□ 1.55
TIMMDC1-205ENST00000486418 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1-205ENST00000486418 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1-205ENST00000486418 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.69■■□□□ 1.54
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.67■■□□□ 1.54
TIMMDC1-205ENST00000486418 CD109Q6YHK3 1445 aa24.67■■□□□ 1.54
TIMMDC1-205ENST00000486418 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.65■■□□□ 1.54
TIMMDC1-205ENST00000486418 FMN1Q68DA7 1419 aa24.64■■□□□ 1.54
TIMMDC1-205ENST00000486418 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TIMMDC1-205ENST00000486418 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.61■■□□□ 1.53
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.56■■□□□ 1.52
TIMMDC1-205ENST00000486418 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TIMMDC1-205ENST00000486418 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
TIMMDC1-205ENST00000486418 HECW1Q76N89 1606 aa24.52■■□□□ 1.52
TIMMDC1-205ENST00000486418 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TIMMDC1-205ENST00000486418 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TIMMDC1-205ENST00000486418 CLIP1P30622 1438 aa24.47■■□□□ 1.51
TIMMDC1-205ENST00000486418 PHLDB1Q86UU1 1377 aa24.45■■□□□ 1.5
TIMMDC1-205ENST00000486418 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa24.42■■□□□ 1.5
TIMMDC1-205ENST00000486418 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa24.41■■□□□ 1.5
TIMMDC1-205ENST00000486418 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.4■■□□□ 1.5
TIMMDC1-205ENST00000486418 NEO1Q92859 1461 aa24.38■■□□□ 1.49
TIMMDC1-205ENST00000486418 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TIMMDC1-205ENST00000486418 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.35■■□□□ 1.49
TIMMDC1-205ENST00000486418 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.34■■□□□ 1.49
TIMMDC1-205ENST00000486418 CCDC18Q5T9S5 1454 aa24.33■■□□□ 1.49
TIMMDC1-205ENST00000486418 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 FYCO1Q9BQS8 1478 aa24.32■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.31■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 RAPGEF3O95398 923 aa24.31■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 AKNAQ7Z591 1439 aa24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 FANCAO15360 1455 aa24.3■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 CEP162Q5TB80 1403 aa24.29■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 PLCH2O75038 1416 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIF14Q15058 1648 aa24.28■■□□□ 1.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.26■■□□□ 1.47
TIMMDC1-205ENST00000486418 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
TIMMDC1-205ENST00000486418 RICTORQ6R327 1708 aa24.19■■□□□ 1.46
TIMMDC1-205ENST00000486418 ADGRL1O94910 1474 aa24.19■■□□□ 1.46
TIMMDC1-205ENST00000486418 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1-205ENST00000486418 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.16■■□□□ 1.46
TIMMDC1-205ENST00000486418 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.16■■□□□ 1.46
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