RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486372.1

TOR1B-203, Transcript of torsin family 1 member B, humanhuman

TSL 2

Gene TOR1B, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1B-203ENST00000486372 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.55■■■■■ 4.56
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TOR1B-203ENST00000486372 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.52■■■■■ 4.56
TOR1B-203ENST00000486372 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.42■■■■■ 4.54
TOR1B-203ENST00000486372 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa43.22■■■■■ 4.51
TOR1B-203ENST00000486372 IQGAP2Q13576 1575 aa43.18■■■■■ 4.5
TOR1B-203ENST00000486372 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP43.17■■■■■ 4.5
TOR1B-203ENST00000486372 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.17■■■■■ 4.5
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TOR1B-203ENST00000486372 PTPRGP23470 1445 aa43.09■■■■■ 4.49
TOR1B-203ENST00000486372 EEA1Q15075 1411 aa43.05■■■■■ 4.48
TOR1B-203ENST00000486372 TNIKQ9UKE5 1360 aa43.05■■■■■ 4.48
TOR1B-203ENST00000486372 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.04■■■■■ 4.48
TOR1B-203ENST00000486372 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.01■■■■■ 4.48
TOR1B-203ENST00000486372 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.92■■■■■ 4.46
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TOR1B-203ENST00000486372 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.83■■■■■ 4.45
TOR1B-203ENST00000486372 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.8■■■■■ 4.44
TOR1B-203ENST00000486372 GOLGA3Q08378 1498 aa42.8■■■■■ 4.44
TOR1B-203ENST00000486372 KIAA0556O60303 1618 aa42.73■■■■■ 4.43
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TOR1B-203ENST00000486372 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.63■■■■■ 4.42
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TOR1B-203ENST00000486372 ABCA8O94911 1581 aa42.3■■■■■ 4.36
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TOR1B-203ENST00000486372 WDR7Q9Y4E6 1490 aa42.13■■■■■ 4.34
TOR1B-203ENST00000486372 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.13■■■■■ 4.33
TOR1B-203ENST00000486372 TSPOAP1O95153 1857 aa42.08■■■■■ 4.33
TOR1B-203ENST00000486372 ATP10BO94823 1461 aa42.04■■■■■ 4.32
TOR1B-203ENST00000486372 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa42.03■■■■■ 4.32
TOR1B-203ENST00000486372 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
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TOR1B-203ENST00000486372 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.9■■■■■ 4.3
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TOR1B-203ENST00000486372 FMN1Q68DA7 1419 aa41.86■■■■■ 4.29
TOR1B-203ENST00000486372 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.86■■■■■ 4.29
TOR1B-203ENST00000486372 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.85■■■■■ 4.29
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TOR1B-203ENST00000486372 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.71■■■■■ 4.27
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TOR1B-203ENST00000486372 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
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TOR1B-203ENST00000486372 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
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TOR1B-203ENST00000486372 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
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TOR1B-203ENST00000486372 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.44■■■■■ 4.22
TOR1B-203ENST00000486372 NEO1Q92859 1461 aa41.38■■■■■ 4.21
TOR1B-203ENST00000486372 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.35■■■■■ 4.21
TOR1B-203ENST00000486372 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.34■■■■■ 4.21
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TOR1B-203ENST00000486372 AKNAQ7Z591 1439 aa41.22■■■■■ 4.19
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TOR1B-203ENST00000486372 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
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TOR1B-203ENST00000486372 ADGRL1O94910 1474 aa41.02■■■■■ 4.16
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TOR1B-203ENST00000486372 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.99■■■■■ 4.15
TOR1B-203ENST00000486372 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.98■■■■■ 4.15
TOR1B-203ENST00000486372 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.93■■■■■ 4.14
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