RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.26■■■□□ 2.75
NISCH-209ENST00000485765 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa32.26■■■□□ 2.75
NISCH-209ENST00000485765 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.2■■■□□ 2.75
NISCH-209ENST00000485765 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.17■■■□□ 2.74
NISCH-209ENST00000485765 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.07■■■□□ 2.72
NISCH-209ENST00000485765 PRXQ9BXM0 1461 aa32.06■■■□□ 2.72
NISCH-209ENST00000485765 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.01■■■□□ 2.71
NISCH-209ENST00000485765 EEA1Q15075 1411 aa31.97■■■□□ 2.71
NISCH-209ENST00000485765 IQGAP2Q13576 1575 aa31.97■■■□□ 2.71
NISCH-209ENST00000485765 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.89■■■□□ 2.7
NISCH-209ENST00000485765 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.85■■■□□ 2.69
NISCH-209ENST00000485765 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
NISCH-209ENST00000485765 DISP1Q96F81 1524 aa31.83■■■□□ 2.69
NISCH-209ENST00000485765 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.82■■■□□ 2.69
NISCH-209ENST00000485765 PTPRGP23470 1445 aa31.81■■■□□ 2.68
NISCH-209ENST00000485765 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
NISCH-209ENST00000485765 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.76■■■□□ 2.67
NISCH-209ENST00000485765 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.69■■■□□ 2.66
NISCH-209ENST00000485765 KIAA0556O60303 1618 aa31.67■■■□□ 2.66
NISCH-209ENST00000485765 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.67■■■□□ 2.66
NISCH-209ENST00000485765 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
NISCH-209ENST00000485765 GOLGA3Q08378 1498 aa31.65■■■□□ 2.66
NISCH-209ENST00000485765 KIF21BO75037 1637 aa31.6■■■□□ 2.65
NISCH-209ENST00000485765 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa31.59■■■□□ 2.65
NISCH-209ENST00000485765 UACAQ9BZF9 1416 aa31.59■■■□□ 2.65
NISCH-209ENST00000485765 MAPKBP1O60336 1514 aa31.55■■■□□ 2.64
NISCH-209ENST00000485765 ABCC2Q92887 1545 aa31.53■■■□□ 2.64
NISCH-209ENST00000485765 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.46■■■□□ 2.63
NISCH-209ENST00000485765 P3H3Q8IVL6 736 aa31.43■■■□□ 2.62
NISCH-209ENST00000485765 KDM5BQ9UGL1 1544 aa31.43■■■□□ 2.62
NISCH-209ENST00000485765 SAMD9Q5K651 1589 aa31.43■■■□□ 2.62
NISCH-209ENST00000485765 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.42■■■□□ 2.62
NISCH-209ENST00000485765 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.4■■■□□ 2.62
NISCH-209ENST00000485765 ABCA8O94911 1581 aa31.39■■■□□ 2.61
NISCH-209ENST00000485765 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.38■■■□□ 2.61
NISCH-209ENST00000485765 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
NISCH-209ENST00000485765 ASXL2Q76L83 1435 aa31.35■■■□□ 2.61
NISCH-209ENST00000485765 DIP2BQ9P265 1576 aa31.34■■■□□ 2.61
NISCH-209ENST00000485765 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.33■■■□□ 2.61
NISCH-209ENST00000485765 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
NISCH-209ENST00000485765 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
NISCH-209ENST00000485765 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.25■■■□□ 2.59
NISCH-209ENST00000485765 FHOD3Q2V2M9 1422 aa31.24■■■□□ 2.59
NISCH-209ENST00000485765 GLI2P10070 1586 aa31.19■■■□□ 2.58
NISCH-209ENST00000485765 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
NISCH-209ENST00000485765 ATP10BO94823 1461 aa31.16■■■□□ 2.58
NISCH-209ENST00000485765 WDR7Q9Y4E6 1490 aa31.14■■■□□ 2.58
NISCH-209ENST00000485765 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa31.13■■■□□ 2.57
NISCH-209ENST00000485765 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.11■■■□□ 2.57
NISCH-209ENST00000485765 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
NISCH-209ENST00000485765 ARID3CA6NKF2 412 aa31.07■■■□□ 2.56
NISCH-209ENST00000485765 KCNH8Q96L42 1107 aa31.02■■■□□ 2.56
NISCH-209ENST00000485765 TSPOAP1O95153 1857 aa30.99■■■□□ 2.55
NISCH-209ENST00000485765 FMN1Q68DA7 1419 aa30.99■■■□□ 2.55
NISCH-209ENST00000485765 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.99■■■□□ 2.55
NISCH-209ENST00000485765 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
NISCH-209ENST00000485765 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
NISCH-209ENST00000485765 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
NISCH-209ENST00000485765 CD109Q6YHK3 1445 aa30.9■■■□□ 2.54
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.88■■■□□ 2.53
NISCH-209ENST00000485765 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.88■■■□□ 2.53
NISCH-209ENST00000485765 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.87■■■□□ 2.53
NISCH-209ENST00000485765 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.86■■■□□ 2.53
NISCH-209ENST00000485765 CLIP1P30622 1438 aa30.85■■■□□ 2.53
NISCH-209ENST00000485765 KDM6BO15054 1643 aa30.84■■■□□ 2.53
NISCH-209ENST00000485765 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
NISCH-209ENST00000485765 HECW1Q76N89 1606 aa30.8■■■□□ 2.52
NISCH-209ENST00000485765 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
NISCH-209ENST00000485765 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.79■■■□□ 2.52
NISCH-209ENST00000485765 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
NISCH-209ENST00000485765 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.75■■■□□ 2.51
NISCH-209ENST00000485765 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.74■■■□□ 2.51
NISCH-209ENST00000485765 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
NISCH-209ENST00000485765 CEP162Q5TB80 1403 aa30.67■■■□□ 2.5
NISCH-209ENST00000485765 PHLDB1Q86UU1 1377 aa30.66■■■□□ 2.5
NISCH-209ENST00000485765 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP30.66■■■□□ 2.5
NISCH-209ENST00000485765 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.5
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NISCH-209ENST00000485765 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa30.62■■■□□ 2.49
NISCH-209ENST00000485765 CCDC18Q5T9S5 1454 aa30.61■■■□□ 2.49
NISCH-209ENST00000485765 ARAP3Q8WWN8 1544 aa30.61■■■□□ 2.49
NISCH-209ENST00000485765 NEO1Q92859 1461 aa30.59■■■□□ 2.49
NISCH-209ENST00000485765 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP30.59■■■□□ 2.49
NISCH-209ENST00000485765 TTC37Q6PGP7 1564 aa30.55■■■□□ 2.48
NISCH-209ENST00000485765 PLCH2O75038 1416 aa30.52■■■□□ 2.48
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NISCH-209ENST00000485765 AKNAQ7Z591 1439 aa30.47■■■□□ 2.47
NISCH-209ENST00000485765 KIF14Q15058 1648 aa30.46■■■□□ 2.47
NISCH-209ENST00000485765 RAPGEF3O95398 923 aa30.44■■■□□ 2.46
NISCH-209ENST00000485765 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30.4■■■□□ 2.46
NISCH-209ENST00000485765 CFAP74Q9C0B2 1584 aa30.4■■■□□ 2.46
NISCH-209ENST00000485765 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
NISCH-209ENST00000485765 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.36■■■□□ 2.45
NISCH-209ENST00000485765 MYO5CQ9NQX4 1742 aa30.35■■■□□ 2.45
NISCH-209ENST00000485765 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa30.33■■■□□ 2.45
NISCH-209ENST00000485765 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
NISCH-209ENST00000485765 VPS8Q8N3P4 1428 aa30.32■■■□□ 2.44
NISCH-209ENST00000485765 SCAPERQ9BY12 1400 aa30.3■■■□□ 2.44
NISCH-209ENST00000485765 ADGRL1O94910 1474 aa30.3■■■□□ 2.44
NISCH-209ENST00000485765 MTUS2Q5JR59 1369 aa30.28■■■□□ 2.44
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