RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484428.5

C1orf61-216, Transcript of chromosome 1 open reading frame 61, humanhuman

TSL 3

Gene C1orf61, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61-216ENST00000484428 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.27■■■□□ 2.44
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C1orf61-216ENST00000484428 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.12■■■□□ 2.41
C1orf61-216ENST00000484428 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
C1orf61-216ENST00000484428 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.92■■■□□ 2.38
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C1orf61-216ENST00000484428 DIP2BQ9P265 1576 aa29.74■■■□□ 2.35
C1orf61-216ENST00000484428 UGGT2Q9NYU1 1516 aa29.72■■■□□ 2.35
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C1orf61-216ENST00000484428 GLI2P10070 1586 aa29.49■■■□□ 2.31
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C1orf61-216ENST00000484428 EEA1Q15075 1411 aa29.3■■■□□ 2.28
C1orf61-216ENST00000484428 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf61-216ENST00000484428 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa29.29■■■□□ 2.28
C1orf61-216ENST00000484428 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.23■■■□□ 2.27
C1orf61-216ENST00000484428 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
C1orf61-216ENST00000484428 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
C1orf61-216ENST00000484428 P3H3Q8IVL6 736 aa29.18■■■□□ 2.26
C1orf61-216ENST00000484428 SAMD9Q5K651 1589 aa29.17■■■□□ 2.26
C1orf61-216ENST00000484428 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.16■■■□□ 2.26
C1orf61-216ENST00000484428 KCNH8Q96L42 1107 aa29.12■■■□□ 2.25
C1orf61-216ENST00000484428 ATP10BO94823 1461 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-216ENST00000484428 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-216ENST00000484428 CD109Q6YHK3 1445 aa29.11■■■□□ 2.25
C1orf61-216ENST00000484428 CFAP43Q8NDM7 1665 aa29.08■■■□□ 2.25
C1orf61-216ENST00000484428 ARID3CA6NKF2 412 aa29.03■■■□□ 2.24
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C1orf61-216ENST00000484428 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa29■■■□□ 2.23
C1orf61-216ENST00000484428 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.96■■■□□ 2.23
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C1orf61-216ENST00000484428 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.95■■■□□ 2.22
C1orf61-216ENST00000484428 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
C1orf61-216ENST00000484428 EFCAB5A4FU69 1503 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-216ENST00000484428 ADGRL1O94910 1474 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-216ENST00000484428 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.91■■■□□ 2.22
C1orf61-216ENST00000484428 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.89■■■□□ 2.21
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C1orf61-216ENST00000484428 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.87■■■□□ 2.21
C1orf61-216ENST00000484428 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.79■■■□□ 2.2
C1orf61-216ENST00000484428 UBTFP17480 764 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
C1orf61-216ENST00000484428 NEO1Q92859 1461 aa28.78■■■□□ 2.2
C1orf61-216ENST00000484428 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.7■■■□□ 2.18
C1orf61-216ENST00000484428 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.68■■■□□ 2.18
C1orf61-216ENST00000484428 RAPGEF3O95398 923 aa28.68■■■□□ 2.18
C1orf61-216ENST00000484428 FMN1Q68DA7 1419 aa28.67■■■□□ 2.18
C1orf61-216ENST00000484428 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.185e-6■■■■■ 35.4
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C1orf61-216ENST00000484428 FANCAO15360 1455 aa28.58■■■□□ 2.17
C1orf61-216ENST00000484428 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.56■■■□□ 2.16
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C1orf61-216ENST00000484428 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.54■■■□□ 2.16
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C1orf61-216ENST00000484428 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
C1orf61-216ENST00000484428 PLCH2O75038 1416 aa28.51■■■□□ 2.15
C1orf61-216ENST00000484428 RICTORQ6R327 1708 aa28.49■■■□□ 2.15
C1orf61-216ENST00000484428 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.45■■■□□ 2.14
C1orf61-216ENST00000484428 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.45■■■□□ 2.14
C1orf61-216ENST00000484428 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf61-216ENST00000484428 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.43■■■□□ 2.14
C1orf61-216ENST00000484428 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
C1orf61-216ENST00000484428 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.4■■■□□ 2.14
C1orf61-216ENST00000484428 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa28.39■■■□□ 2.14
C1orf61-216ENST00000484428 PTPRMP28827 1452 aa28.39■■■□□ 2.13
C1orf61-216ENST00000484428 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
C1orf61-216ENST00000484428 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa28.38■■■□□ 2.13
C1orf61-216ENST00000484428 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.38■■■□□ 2.13
C1orf61-216ENST00000484428 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.38■■■□□ 2.13
C1orf61-216ENST00000484428 KIF14Q15058 1648 aa28.36■■■□□ 2.13
C1orf61-216ENST00000484428 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.36■■■□□ 2.13
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