RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484349.1

CHTF18-210, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-210ENST00000484349 JPH4Q96JJ6 628 aa31.54■■■□□ 2.64
CHTF18-210ENST00000484349 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.48■■■□□ 2.63
CHTF18-210ENST00000484349 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CHTF18-210ENST00000484349 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.4■■■□□ 2.62
CHTF18-210ENST00000484349 TRHP20396 242 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
CHTF18-210ENST00000484349 IQGAP2Q13576 1575 aa31.26■■■□□ 2.59
CHTF18-210ENST00000484349 PRXQ9BXM0 1461 aa31.21■■■□□ 2.59
CHTF18-210ENST00000484349 CSRNP3Q8WYN3 585 aa31.17■■■□□ 2.58
CHTF18-210ENST00000484349 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa31.16■■■□□ 2.58
CHTF18-210ENST00000484349 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.15■■■□□ 2.58
CHTF18-210ENST00000484349 EEA1Q15075 1411 aa31.15■■■□□ 2.58
CHTF18-210ENST00000484349 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa31.09■■■□□ 2.57
CHTF18-210ENST00000484349 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.08■■■□□ 2.57
CHTF18-210ENST00000484349 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.08■■■□□ 2.57
CHTF18-210ENST00000484349 PTPRGP23470 1445 aa31.07■■■□□ 2.57
CHTF18-210ENST00000484349 DISP1Q96F81 1524 aa31.06■■■□□ 2.56
CHTF18-210ENST00000484349 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
CHTF18-210ENST00000484349 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.02■■■□□ 2.56
CHTF18-210ENST00000484349 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
CHTF18-210ENST00000484349 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.01■■■□□ 2.55
CHTF18-210ENST00000484349 KIAA0556O60303 1618 aa30.96■■■□□ 2.55
CHTF18-210ENST00000484349 GOLGA3Q08378 1498 aa30.91■■■□□ 2.54
CHTF18-210ENST00000484349 UACAQ9BZF9 1416 aa30.86■■■□□ 2.53
CHTF18-210ENST00000484349 MAPKBP1O60336 1514 aa30.86■■■□□ 2.53
CHTF18-210ENST00000484349 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.83■■■□□ 2.53
CHTF18-210ENST00000484349 KIF21BO75037 1637 aa30.82■■■□□ 2.52
CHTF18-210ENST00000484349 ABCC2Q92887 1545 aa30.81■■■□□ 2.52
CHTF18-210ENST00000484349 KIF13AQ9H1H9 1805 aa30.76■■■□□ 2.51
CHTF18-210ENST00000484349 ABCC10Q5T3U5 1492 aa30.76■■■□□ 2.51
CHTF18-210ENST00000484349 FAM69CQ0P6D2 419 aa30.73■■■□□ 2.51
CHTF18-210ENST00000484349 P3H3Q8IVL6 736 aa30.71■■■□□ 2.51
CHTF18-210ENST00000484349 PLB1Q6P1J6 1458 aa30.69■■■□□ 2.5
CHTF18-210ENST00000484349 SAMD9Q5K651 1589 aa30.68■■■□□ 2.5
CHTF18-210ENST00000484349 DIP2BQ9P265 1576 aa30.68■■■□□ 2.5
CHTF18-210ENST00000484349 KDM5BQ9UGL1 1544 aa30.68■■■□□ 2.5
CHTF18-210ENST00000484349 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
CHTF18-210ENST00000484349 ASXL2Q76L83 1435 aa30.64■■■□□ 2.5
CHTF18-210ENST00000484349 ABCA8O94911 1581 aa30.64■■■□□ 2.5
CHTF18-210ENST00000484349 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.64■■■□□ 2.5
CHTF18-210ENST00000484349 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CHTF18-210ENST00000484349 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CHTF18-210ENST00000484349 EFCAB5A4FU69 1503 aa30.51■■■□□ 2.47
CHTF18-210ENST00000484349 FHOD3Q2V2M9 1422 aa30.5■■■□□ 2.47
CHTF18-210ENST00000484349 GLI2P10070 1586 aa30.49■■■□□ 2.47
CHTF18-210ENST00000484349 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP30.47■■■□□ 2.47
CHTF18-210ENST00000484349 WDR7Q9Y4E6 1490 aa30.44■■■□□ 2.46
CHTF18-210ENST00000484349 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.44■■■□□ 2.46
CHTF18-210ENST00000484349 TSPOAP1O95153 1857 aa30.44■■■□□ 2.46
CHTF18-210ENST00000484349 ARID3CA6NKF2 412 aa30.41■■■□□ 2.46
CHTF18-210ENST00000484349 ATP10BO94823 1461 aa30.41■■■□□ 2.46
CHTF18-210ENST00000484349 KCNH8Q96L42 1107 aa30.34■■■□□ 2.45
CHTF18-210ENST00000484349 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa30.33■■■□□ 2.45
CHTF18-210ENST00000484349 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa30.32■■■□□ 2.44
CHTF18-210ENST00000484349 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
CHTF18-210ENST00000484349 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
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CHTF18-210ENST00000484349 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CHTF18-210ENST00000484349 KDM6BO15054 1643 aa30.27■■■□□ 2.44
CHTF18-210ENST00000484349 FMN1Q68DA7 1419 aa30.24■■■□□ 2.43
CHTF18-210ENST00000484349 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.23■■■□□ 2.43
CHTF18-210ENST00000484349 CFAP43Q8NDM7 1665 aa30.22■■■□□ 2.43
CHTF18-210ENST00000484349 CD109Q6YHK3 1445 aa30.21■■■□□ 2.43
CHTF18-210ENST00000484349 PLEKHD1A6NEE1 506 aa30.16■■■□□ 2.42
CHTF18-210ENST00000484349 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.16■■■□□ 2.42
CHTF18-210ENST00000484349 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP30.14■■■□□ 2.42
CHTF18-210ENST00000484349 HECW1Q76N89 1606 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-210ENST00000484349 ABCA9Q8IUA7 1624 aa30.11■■■□□ 2.41
CHTF18-210ENST00000484349 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
CHTF18-210ENST00000484349 CLIP1P30622 1438 aa30.08■■■□□ 2.41
CHTF18-210ENST00000484349 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CHTF18-210ENST00000484349 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
CHTF18-210ENST00000484349 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa29.97■■■□□ 2.39
CHTF18-210ENST00000484349 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
CHTF18-210ENST00000484349 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
CHTF18-210ENST00000484349 PHLDB1Q86UU1 1377 aa29.93■■■□□ 2.38
CHTF18-210ENST00000484349 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa29.93■■■□□ 2.38
CHTF18-210ENST00000484349 NEO1Q92859 1461 aa29.89■■■□□ 2.38
CHTF18-210ENST00000484349 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.89■■■□□ 2.38
CHTF18-210ENST00000484349 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa29.89■■■□□ 2.38
CHTF18-210ENST00000484349 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.89■■■□□ 2.38
CHTF18-210ENST00000484349 CEP162Q5TB80 1403 aa29.88■■■□□ 2.37
CHTF18-210ENST00000484349 CCDC18Q5T9S5 1454 aa29.87■■■□□ 2.37
CHTF18-210ENST00000484349 TTC37Q6PGP7 1564 aa29.87■■■□□ 2.37
CHTF18-210ENST00000484349 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CHTF18-210ENST00000484349 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
CHTF18-210ENST00000484349 FANCAO15360 1455 aa29.8■■■□□ 2.36
CHTF18-210ENST00000484349 KIF14Q15058 1648 aa29.79■■■□□ 2.36
CHTF18-210ENST00000484349 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.78■■■□□ 2.36
CHTF18-210ENST00000484349 PLCH2O75038 1416 aa29.77■■■□□ 2.36
CHTF18-210ENST00000484349 AKNAQ7Z591 1439 aa29.77■■■□□ 2.36
CHTF18-210ENST00000484349 RAPGEF3O95398 923 aa29.75■■■□□ 2.35
CHTF18-210ENST00000484349 MYO5CQ9NQX4 1742 aa29.72■■■□□ 2.35
CHTF18-210ENST00000484349 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa29.7■■■□□ 2.35
CHTF18-210ENST00000484349 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
CHTF18-210ENST00000484349 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.68■■■□□ 2.34
CHTF18-210ENST00000484349 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.66■■■□□ 2.34
CHTF18-210ENST00000484349 ADGRL1O94910 1474 aa29.62■■■□□ 2.33
CHTF18-210ENST00000484349 RICTORQ6R327 1708 aa29.62■■■□□ 2.33
CHTF18-210ENST00000484349 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.61■■■□□ 2.33
CHTF18-210ENST00000484349 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.61■■■□□ 2.33
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