RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484048.1

UBE2E1-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2E1, Length 786 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1-209ENST00000484048 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
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UBE2E1-209ENST00000484048 CSRNP3Q8WYN3 585 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E1-209ENST00000484048 CUL7Q14999 1698 aa26.59■■□□□ 1.85
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UBE2E1-209ENST00000484048 DIP2BQ9P265 1576 aa26.48■■□□□ 1.83
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UBE2E1-209ENST00000484048 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.48■■□□□ 1.83
UBE2E1-209ENST00000484048 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.44■■□□□ 1.82
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UBE2E1-209ENST00000484048 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.2■■□□□ 1.78
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UBE2E1-209ENST00000484048 ASXL2Q76L83 1435 aa25.96■■□□□ 1.75
UBE2E1-209ENST00000484048 ABCC2Q92887 1545 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.95■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 PTPRGP23470 1445 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2E1-209ENST00000484048 UGGT2Q9NYU1 1516 aa25.91■■□□□ 1.74
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UBE2E1-209ENST00000484048 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.84■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.84■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
UBE2E1-209ENST00000484048 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
UBE2E1-209ENST00000484048 KIAA0556O60303 1618 aa25.8■■□□□ 1.72
UBE2E1-209ENST00000484048 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.8■■□□□ 1.72
UBE2E1-209ENST00000484048 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.79■■□□□ 1.72
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UBE2E1-209ENST00000484048 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.48■■□□□ 1.67
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UBE2E1-209ENST00000484048 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.46■■□□□ 1.67
UBE2E1-209ENST00000484048 ABCA8O94911 1581 aa25.45■■□□□ 1.66
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UBE2E1-209ENST00000484048 APLP2Q06481 763 aa25.23■■□□□ 1.63
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UBE2E1-209ENST00000484048 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.21■■□□□ 1.63
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UBE2E1-209ENST00000484048 ATP10BO94823 1461 aa25.2■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.18■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.15■■□□□ 1.62
UBE2E1-209ENST00000484048 HSPA2P54652 639 aa25.15■■□□□ 1.62
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UBE2E1-209ENST00000484048 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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