RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERICH3Q5RHP9 1530 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CEP170Q5SW79 1584 aa9.56□□□□□ -0.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GRIN2AQ12879 1464 aa9.55□□□□□ -0.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FBLN2P98095 1184 aa9.53□□□□□ -0.88
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NUP160Q12769 1436 aa9.52□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa9.51□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CUL7Q14999 1698 aa9.5□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CYB5RLQ6IPT4 315 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.49□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.48□□□□□ -0.89
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF27Q86VH2 1401 aa9.38□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.37□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KCNA4P22459 653 aa9.37□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADCY10Q96PN6 1610 aa9.37□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.36□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAPKBP1O60336 1514 aa9.36□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.36□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IGF1RP08069 1367 aa9.34□□□□□ -0.91
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IQGAP2Q13576 1575 aa9.33□□□□□ -0.92
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DIP2BQ9P265 1576 aa9.33□□□□□ -0.92
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 JPH4Q96JJ6 628 aa9.3□□□□□ -0.92
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TSPOAP1O95153 1857 aa9.28□□□□□ -0.92
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.28□□□□□ -0.92
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.28□□□□□ -0.92
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.26□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa9.26□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIAA0556O60303 1618 aa9.26□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DISP1Q96F81 1524 aa9.25□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa9.24□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 POTEHQ6S545 545 aa9.24□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.23□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.22□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCC2Q92887 1545 aa9.22□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GLI2P10070 1586 aa9.22□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa9.22□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KDM6BO15054 1643 aa9.21□□□□□ -0.93
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.21□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PTPRGP23470 1445 aa9.19□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KDM5BQ9UGL1 1544 aa9.19□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.17□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PRXQ9BXM0 1461 aa9.17□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.16□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UACAQ9BZF9 1416 aa9.16□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.16□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RNF39Q9H2S5 420 aa9.16□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCA8O94911 1581 aa9.16□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SAMD9Q5K651 1589 aa9.16□□□□□ -0.94
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GOLGA3Q08378 1498 aa9.15□□□□□ -0.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ASXL2Q76L83 1435 aa9.14□□□□□ -0.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM69CQ0P6D2 419 aa9.13□□□□□ -0.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.1□□□□□ -0.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF21BO75037 1637 aa9.09□□□□□ -0.95
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TEX14Q8IWB6 1497 aa9.08□□□□□ -0.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EEA1Q15075 1411 aa9.08□□□□□ -0.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa9.08□□□□□ -0.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.07□□□□□ -0.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa9.05□□□□□ -0.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.04□□□□□ -0.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.96
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ATP10BO94823 1461 aa8.99□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RICTORQ6R327 1708 aa8.99□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa8.99□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.99□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CFAP74Q9C0B2 1584 aa8.99□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADGRL1O94910 1474 aa8.98□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CD109Q6YHK3 1445 aa8.97□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa8.97□□□□□ -0.97
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.96□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.96□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HECW1Q76N89 1606 aa8.95□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NEO1Q92859 1461 aa8.95□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TTC37Q6PGP7 1564 aa8.95□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FHOD3Q2V2M9 1422 aa8.94□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.94□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PHLDB1Q86UU1 1377 aa8.93□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.92□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.91□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.2 ms