RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477348.1

OTX1-205, Transcript of orthodenticle homeobox 1, humanhuman

TSL 3

Gene OTX1, Length 624 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1-205ENST00000477348 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
OTX1-205ENST00000477348 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa31.79■■■□□ 2.68
OTX1-205ENST00000477348 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa31.76■■■□□ 2.68
OTX1-205ENST00000477348 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.71■■■□□ 2.67
OTX1-205ENST00000477348 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
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OTX1-205ENST00000477348 FAM69CQ0P6D2 419 aa31.64■■■□□ 2.66
OTX1-205ENST00000477348 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP31.56■■■□□ 2.64
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OTX1-205ENST00000477348 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.54■■■□□ 2.64
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OTX1-205ENST00000477348 MAPKBP1O60336 1514 aa31.5■■■□□ 2.63
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OTX1-205ENST00000477348 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.47■■■□□ 2.63
OTX1-205ENST00000477348 TNIKQ9UKE5 1360 aa31.45■■■□□ 2.63
OTX1-205ENST00000477348 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.37■■■□□ 2.61
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OTX1-205ENST00000477348 DIP2BQ9P265 1576 aa31.35■■■□□ 2.61
OTX1-205ENST00000477348 ABCC2Q92887 1545 aa31.29■■■□□ 2.6
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OTX1-205ENST00000477348 UACAQ9BZF9 1416 aa31.26■■■□□ 2.6
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OTX1-205ENST00000477348 ASXL2Q76L83 1435 aa31.22■■■□□ 2.59
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OTX1-205ENST00000477348 UGGT2Q9NYU1 1516 aa31.2■■■□□ 2.59
OTX1-205ENST00000477348 KDM6BO15054 1643 aa31.12■■■□□ 2.57
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OTX1-205ENST00000477348 TSPOAP1O95153 1857 aa31.08■■■□□ 2.57
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OTX1-205ENST00000477348 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa30.9■■■□□ 2.54
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OTX1-205ENST00000477348 CD109Q6YHK3 1445 aa30.76■■■□□ 2.51
OTX1-205ENST00000477348 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa30.67■■■□□ 2.5
OTX1-205ENST00000477348 EEA1Q15075 1411 aa30.66■■■□□ 2.5
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OTX1-205ENST00000477348 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
OTX1-205ENST00000477348 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.88■■■□□ 2.37
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