RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.52■■□□□ 1.19
PRAME-211ENST00000476336 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.51■■□□□ 1.19
PRAME-211ENST00000476336 JPH4Q96JJ6 628 aa22.48■■□□□ 1.19
PRAME-211ENST00000476336 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.47■■□□□ 1.19
PRAME-211ENST00000476336 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
PRAME-211ENST00000476336 EEA1Q15075 1411 aa22.41■■□□□ 1.18
PRAME-211ENST00000476336 IQGAP2Q13576 1575 aa22.36■■□□□ 1.17
PRAME-211ENST00000476336 PRXQ9BXM0 1461 aa22.34■■□□□ 1.17
PRAME-211ENST00000476336 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.31■■□□□ 1.16
PRAME-211ENST00000476336 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.31■■□□□ 1.16
PRAME-211ENST00000476336 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.29■■□□□ 1.16
PRAME-211ENST00000476336 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.28■■□□□ 1.16
PRAME-211ENST00000476336 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.23■■□□□ 1.15
PRAME-211ENST00000476336 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.22■■□□□ 1.15
PRAME-211ENST00000476336 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PRAME-211ENST00000476336 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.2■■□□□ 1.14
PRAME-211ENST00000476336 PTPRGP23470 1445 aa22.17■■□□□ 1.14
PRAME-211ENST00000476336 GOLGA3Q08378 1498 aa22.16■■□□□ 1.14
PRAME-211ENST00000476336 DISP1Q96F81 1524 aa22.15■■□□□ 1.14
PRAME-211ENST00000476336 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PRAME-211ENST00000476336 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.13■■□□□ 1.13
PRAME-211ENST00000476336 MAPKBP1O60336 1514 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAME-211ENST00000476336 KIAA0556O60303 1618 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAME-211ENST00000476336 KIF21BO75037 1637 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAME-211ENST00000476336 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.11■■□□□ 1.13
PRAME-211ENST00000476336 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.1■■□□□ 1.13
PRAME-211ENST00000476336 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRAME-211ENST00000476336 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.04■■□□□ 1.12
PRAME-211ENST00000476336 UACAQ9BZF9 1416 aa22.03■■□□□ 1.12
PRAME-211ENST00000476336 DIP2BQ9P265 1576 aa22.03■■□□□ 1.12
PRAME-211ENST00000476336 ABCC2Q92887 1545 aa22■■□□□ 1.11
PRAME-211ENST00000476336 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PRAME-211ENST00000476336 SAMD9Q5K651 1589 aa21.95■■□□□ 1.1
PRAME-211ENST00000476336 TSPOAP1O95153 1857 aa21.92■■□□□ 1.1
PRAME-211ENST00000476336 KDM5BQ9UGL1 1544 aa21.91■■□□□ 1.1
PRAME-211ENST00000476336 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PRAME-211ENST00000476336 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.9■■□□□ 1.1
PRAME-211ENST00000476336 PLB1Q6P1J6 1458 aa21.9■■□□□ 1.1
PRAME-211ENST00000476336 ABCA8O94911 1581 aa21.88■■□□□ 1.09
PRAME-211ENST00000476336 KDM6BO15054 1643 aa21.85■■□□□ 1.09
PRAME-211ENST00000476336 ASXL2Q76L83 1435 aa21.85■■□□□ 1.09
PRAME-211ENST00000476336 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PRAME-211ENST00000476336 GLI2P10070 1586 aa21.82■■□□□ 1.08
PRAME-211ENST00000476336 P3H3Q8IVL6 736 aa21.82■■□□□ 1.08
PRAME-211ENST00000476336 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa21.77■■□□□ 1.08
PRAME-211ENST00000476336 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PRAME-211ENST00000476336 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.74■■□□□ 1.07
PRAME-211ENST00000476336 WDR7Q9Y4E6 1490 aa21.74■■□□□ 1.07
PRAME-211ENST00000476336 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PRAME-211ENST00000476336 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PRAME-211ENST00000476336 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.72■■□□□ 1.07
PRAME-211ENST00000476336 FMN1Q68DA7 1419 aa21.71■■□□□ 1.07
PRAME-211ENST00000476336 ATP10BO94823 1461 aa21.68■■□□□ 1.06
PRAME-211ENST00000476336 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.68■■□□□ 1.06
PRAME-211ENST00000476336 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.67■■□□□ 1.06
PRAME-211ENST00000476336 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.67■■□□□ 1.06
PRAME-211ENST00000476336 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
PRAME-211ENST00000476336 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.64■■□□□ 1.05
PRAME-211ENST00000476336 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.62■■□□□ 1.05
PRAME-211ENST00000476336 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
PRAME-211ENST00000476336 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PRAME-211ENST00000476336 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRAME-211ENST00000476336 HECW1Q76N89 1606 aa21.58■■□□□ 1.05
PRAME-211ENST00000476336 KCNH8Q96L42 1107 aa21.58■■□□□ 1.05
PRAME-211ENST00000476336 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.57■■□□□ 1.04
PRAME-211ENST00000476336 ARID3CA6NKF2 412 aa21.55■■□□□ 1.04
PRAME-211ENST00000476336 CLIP1P30622 1438 aa21.55■■□□□ 1.04
PRAME-211ENST00000476336 CD109Q6YHK3 1445 aa21.55■■□□□ 1.04
PRAME-211ENST00000476336 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.54■■□□□ 1.04
PRAME-211ENST00000476336 ABCA9Q8IUA7 1624 aa21.52■■□□□ 1.04
PRAME-211ENST00000476336 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PRAME-211ENST00000476336 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PRAME-211ENST00000476336 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.47■■□□□ 1.03
PRAME-211ENST00000476336 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.47■■□□□ 1.03
PRAME-211ENST00000476336 ADGRL1O94910 1474 aa21.45■■□□□ 1.03
PRAME-211ENST00000476336 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.45■■□□□ 1.02
PRAME-211ENST00000476336 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.44■■□□□ 1.02
PRAME-211ENST00000476336 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
PRAME-211ENST00000476336 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PRAME-211ENST00000476336 CEP162Q5TB80 1403 aa21.4■■□□□ 1.02
PRAME-211ENST00000476336 NEO1Q92859 1461 aa21.39■■□□□ 1.01
PRAME-211ENST00000476336 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa21.37■■□□□ 1.01
PRAME-211ENST00000476336 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.36■■□□□ 1.017e-13■□□□□ 11.3
PRAME-211ENST00000476336 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.36■■□□□ 1.01
PRAME-211ENST00000476336 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.36■■□□□ 1.01
PRAME-211ENST00000476336 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
PRAME-211ENST00000476336 KIF14Q15058 1648 aa21.34■■□□□ 1.01
PRAME-211ENST00000476336 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.31■■□□□ 1
PRAME-211ENST00000476336 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.3■■□□□ 1
PRAME-211ENST00000476336 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.29■■□□□ 1
PRAME-211ENST00000476336 FANCAO15360 1455 aa21.28■■□□□ 1
PRAME-211ENST00000476336 PLCH2O75038 1416 aa21.28■■□□□ 1
PRAME-211ENST00000476336 AKNAQ7Z591 1439 aa21.23■□□□□ 0.99
PRAME-211ENST00000476336 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.22■□□□□ 0.99
PRAME-211ENST00000476336 RAPGEF3O95398 923 aa21.21■□□□□ 0.99
PRAME-211ENST00000476336 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.2■□□□□ 0.98
PRAME-211ENST00000476336 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PRAME-211ENST00000476336 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.18■□□□□ 0.98
PRAME-211ENST00000476336 HECW2Q9P2P5 1572 aa21.17■□□□□ 0.98
PRAME-211ENST00000476336 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.16■□□□□ 0.98
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