RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471582.5

COL20A1-205, Transcript of collagen type XX alpha 1 chain, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene COL20A1, Length 1,924 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1-205ENST00000471582 PBRM1Q86U86 1689 aa28.22■■■□□ 2.11
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COL20A1-205ENST00000471582 MAP3K1Q13233 1512 aa28.11■■■□□ 2.09
COL20A1-205ENST00000471582 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa28.09■■■□□ 2.09
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COL20A1-205ENST00000471582 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.06■■■□□ 2.08
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COL20A1-205ENST00000471582 TIAM1Q13009 1591 aa28■■■□□ 2.07
COL20A1-205ENST00000471582 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.96■■■□□ 2.07
COL20A1-205ENST00000471582 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
COL20A1-205ENST00000471582 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.9■■■□□ 2.06
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COL20A1-205ENST00000471582 FHOD3Q2V2M9 1422 aa27.82■■■□□ 2.04
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COL20A1-205ENST00000471582 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa27.81■■■□□ 2.04
COL20A1-205ENST00000471582 SAMD9Q5K651 1589 aa27.8■■■□□ 2.04
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COL20A1-205ENST00000471582 IQGAP2Q13576 1575 aa27.74■■■□□ 2.03
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COL20A1-205ENST00000471582 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
COL20A1-205ENST00000471582 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa27.68■■■□□ 2.02
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COL20A1-205ENST00000471582 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
COL20A1-205ENST00000471582 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
COL20A1-205ENST00000471582 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
COL20A1-205ENST00000471582 CHD1O14646 1710 aa27.52■■■□□ 2
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COL20A1-205ENST00000471582 DISP1Q96F81 1524 aa27.45■■□□□ 1.98
COL20A1-205ENST00000471582 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.43■■□□□ 1.98
COL20A1-205ENST00000471582 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.43■■□□□ 1.98
COL20A1-205ENST00000471582 CCDC18Q5T9S5 1454 aa27.43■■□□□ 1.98
COL20A1-205ENST00000471582 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.42■■□□□ 1.98
COL20A1-205ENST00000471582 ITGAEP38570 1179 aa27.42■■□□□ 1.98
COL20A1-205ENST00000471582 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa27.42■■□□□ 1.98
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COL20A1-205ENST00000471582 MYOM3Q5VTT5 1437 aa27.3■■□□□ 1.96
COL20A1-205ENST00000471582 MAPKBP1O60336 1514 aa27.29■■□□□ 1.96
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COL20A1-205ENST00000471582 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.22■■□□□ 1.95
COL20A1-205ENST00000471582 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
COL20A1-205ENST00000471582 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.21■■□□□ 1.95
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COL20A1-205ENST00000471582 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
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COL20A1-205ENST00000471582 ABCA8O94911 1581 aa27.06■■□□□ 1.92
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COL20A1-205ENST00000471582 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27■■□□□ 1.91
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COL20A1-205ENST00000471582 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.98■■□□□ 1.91
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COL20A1-205ENST00000471582 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
COL20A1-205ENST00000471582 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.88■■□□□ 1.89
COL20A1-205ENST00000471582 ATP10BO94823 1461 aa26.86■■□□□ 1.89
COL20A1-205ENST00000471582 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.86■■□□□ 1.89
COL20A1-205ENST00000471582 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
COL20A1-205ENST00000471582 ABCC2Q92887 1545 aa26.84■■□□□ 1.89
COL20A1-205ENST00000471582 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
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COL20A1-205ENST00000471582 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.81■■□□□ 1.88
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