RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.51■■■□□ 2.95
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.43■■■□□ 2.94
SHQ1-206ENST00000471526 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP33.4■■■□□ 2.94
SHQ1-206ENST00000471526 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.39■■■□□ 2.94
SHQ1-206ENST00000471526 CUL7Q14999 1698 aa33.38■■■□□ 2.93
SHQ1-206ENST00000471526 FAM69CQ0P6D2 419 aa33.27■■■□□ 2.92
SHQ1-206ENST00000471526 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
SHQ1-206ENST00000471526 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
SHQ1-206ENST00000471526 ADCY10Q96PN6 1610 aa33.2■■■□□ 2.9
SHQ1-206ENST00000471526 PTPRGP23470 1445 aa33.19■■■□□ 2.9
SHQ1-206ENST00000471526 KIF13AQ9H1H9 1805 aa33.18■■■□□ 2.9
SHQ1-206ENST00000471526 ABCC10Q5T3U5 1492 aa33.18■■■□□ 2.9
SHQ1-206ENST00000471526 MAPKBP1O60336 1514 aa33.14■■■□□ 2.9
SHQ1-206ENST00000471526 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa33.13■■■□□ 2.89
SHQ1-206ENST00000471526 TNIKQ9UKE5 1360 aa33.1■■■□□ 2.89
SHQ1-206ENST00000471526 IQGAP2Q13576 1575 aa33.06■■■□□ 2.88
SHQ1-206ENST00000471526 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.04■■■□□ 2.88
SHQ1-206ENST00000471526 DIP2BQ9P265 1576 aa33.03■■■□□ 2.88
SHQ1-206ENST00000471526 DISP1Q96F81 1524 aa32.94■■■□□ 2.86
SHQ1-206ENST00000471526 ABCC2Q92887 1545 aa32.93■■■□□ 2.86
SHQ1-206ENST00000471526 UACAQ9BZF9 1416 aa32.9■■■□□ 2.86
SHQ1-206ENST00000471526 UGGT2Q9NYU1 1516 aa32.86■■■□□ 2.85
SHQ1-206ENST00000471526 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa32.86■■■□□ 2.85
SHQ1-206ENST00000471526 ASXL2Q76L83 1435 aa32.85■■■□□ 2.85
SHQ1-206ENST00000471526 PLB1Q6P1J6 1458 aa32.82■■■□□ 2.84
SHQ1-206ENST00000471526 TSPOAP1O95153 1857 aa32.8■■■□□ 2.84
SHQ1-206ENST00000471526 KDM6BO15054 1643 aa32.77■■■□□ 2.84
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA0556O60303 1618 aa32.75■■■□□ 2.83
SHQ1-206ENST00000471526 KDM5BQ9UGL1 1544 aa32.72■■■□□ 2.83
SHQ1-206ENST00000471526 PRXQ9BXM0 1461 aa32.68■■■□□ 2.82
SHQ1-206ENST00000471526 GLI2P10070 1586 aa32.67■■■□□ 2.82
SHQ1-206ENST00000471526 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP32.63■■■□□ 2.81
SHQ1-206ENST00000471526 GOLGA3Q08378 1498 aa32.63■■■□□ 2.81
SHQ1-206ENST00000471526 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa32.62■■■□□ 2.81
SHQ1-206ENST00000471526 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
SHQ1-206ENST00000471526 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.57■■■□□ 2.8
SHQ1-206ENST00000471526 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.55■■■□□ 2.8
SHQ1-206ENST00000471526 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
SHQ1-206ENST00000471526 P3H3Q8IVL6 736 aa32.53■■■□□ 2.8
SHQ1-206ENST00000471526 WDR7Q9Y4E6 1490 aa32.5■■■□□ 2.79
SHQ1-206ENST00000471526 KCNH8Q96L42 1107 aa32.5■■■□□ 2.79
SHQ1-206ENST00000471526 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.48■■■□□ 2.79
SHQ1-206ENST00000471526 ABCA8O94911 1581 aa32.47■■■□□ 2.79
SHQ1-206ENST00000471526 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa32.47■■■□□ 2.79
SHQ1-206ENST00000471526 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
SHQ1-206ENST00000471526 TEX14Q8IWB6 1497 aa32.45■■■□□ 2.79
SHQ1-206ENST00000471526 ARID3CA6NKF2 412 aa32.43■■■□□ 2.78
SHQ1-206ENST00000471526 CD109Q6YHK3 1445 aa32.36■■■□□ 2.77
SHQ1-206ENST00000471526 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
SHQ1-206ENST00000471526 EEA1Q15075 1411 aa32.29■■■□□ 2.76
SHQ1-206ENST00000471526 ATP10BO94823 1461 aa32.28■■■□□ 2.76
SHQ1-206ENST00000471526 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa32.26■■■□□ 2.76
SHQ1-206ENST00000471526 ADGRL1O94910 1474 aa32.23■■■□□ 2.75
SHQ1-206ENST00000471526 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
SHQ1-206ENST00000471526 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
SHQ1-206ENST00000471526 CFAP43Q8NDM7 1665 aa32.21■■■□□ 2.75
SHQ1-206ENST00000471526 SAMD9Q5K651 1589 aa32.2■■■□□ 2.75
SHQ1-206ENST00000471526 FHOD3Q2V2M9 1422 aa32.12■■■□□ 2.73
SHQ1-206ENST00000471526 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa32.11■■■□□ 2.73
SHQ1-206ENST00000471526 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.06■■■□□ 2.72
SHQ1-206ENST00000471526 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
SHQ1-206ENST00000471526 ARAP3Q8WWN8 1544 aa32.01■■■□□ 2.72
SHQ1-206ENST00000471526 ABCA9Q8IUA7 1624 aa32■■■□□ 2.71
SHQ1-206ENST00000471526 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.99■■■□□ 2.71
SHQ1-206ENST00000471526 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.98■■■□□ 2.71
SHQ1-206ENST00000471526 KIF21BO75037 1637 aa31.97■■■□□ 2.71
SHQ1-206ENST00000471526 RAPGEF3O95398 923 aa31.96■■■□□ 2.71
SHQ1-206ENST00000471526 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.96■■■□□ 2.71
SHQ1-206ENST00000471526 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.95■■■□□ 2.71
SHQ1-206ENST00000471526 EFCAB5A4FU69 1503 aa31.9■■■□□ 2.7
SHQ1-206ENST00000471526 NEO1Q92859 1461 aa31.89■■■□□ 2.7
SHQ1-206ENST00000471526 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
SHQ1-206ENST00000471526 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 AKNAQ7Z591 1439 aa31.75■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 HECW2Q9P2P5 1572 aa31.74■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP31.74■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 FANCAO15360 1455 aa31.72■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa31.7■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 FMN1Q68DA7 1419 aa31.7■■■□□ 2.67
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.7■■■□□ 2.66
SHQ1-206ENST00000471526 TTC37Q6PGP7 1564 aa31.65■■■□□ 2.66
SHQ1-206ENST00000471526 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
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SHQ1-206ENST00000471526 CFAP74Q9C0B2 1584 aa31.6■■■□□ 2.65
SHQ1-206ENST00000471526 PLCH2O75038 1416 aa31.58■■■□□ 2.65
SHQ1-206ENST00000471526 ADAMTSL3P82987 1691 aa31.58■■■□□ 2.65
SHQ1-206ENST00000471526 HECW1Q76N89 1606 aa31.58■■■□□ 2.65
SHQ1-206ENST00000471526 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
SHQ1-206ENST00000471526 SCAPERQ9BY12 1400 aa31.55■■■□□ 2.64
SHQ1-206ENST00000471526 RICTORQ6R327 1708 aa31.55■■■□□ 2.64
SHQ1-206ENST00000471526 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.53■■■□□ 2.64
SHQ1-206ENST00000471526 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa31.53■■■□□ 2.64
SHQ1-206ENST00000471526 BCORL1Q5H9F3 1711 aa31.52■■■□□ 2.64
SHQ1-206ENST00000471526 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.51■■■□□ 2.64
SHQ1-206ENST00000471526 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
SHQ1-206ENST00000471526 MADDQ8WXG6 1647 aa31.46■■■□□ 2.63
SHQ1-206ENST00000471526 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa31.46■■■□□ 2.63
SHQ1-206ENST00000471526 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.46■■■□□ 2.63
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