RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466964.1

LAMC1-202, Transcript of laminin subunit gamma 1, humanhuman

TSL 4

Gene LAMC1, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1-202ENST00000466964 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa19.17■□□□□ 0.66
LAMC1-202ENST00000466964 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
LAMC1-202ENST00000466964 TOP2BQ02880 1626 aa19.14■□□□□ 0.66
LAMC1-202ENST00000466964 ADCY10Q96PN6 1610 aa19.12■□□□□ 0.65
LAMC1-202ENST00000466964 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa19.12■□□□□ 0.65
LAMC1-202ENST00000466964 FAM69CQ0P6D2 419 aa19.09■□□□□ 0.65
LAMC1-202ENST00000466964 KDM6BO15054 1643 aa19.09■□□□□ 0.65
LAMC1-202ENST00000466964 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
LAMC1-202ENST00000466964 JPH4Q96JJ6 628 aa19.08■□□□□ 0.64
LAMC1-202ENST00000466964 TSPOAP1O95153 1857 aa18.96■□□□□ 0.63
LAMC1-202ENST00000466964 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
LAMC1-202ENST00000466964 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.92■□□□□ 0.62
LAMC1-202ENST00000466964 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.92■□□□□ 0.62
LAMC1-202ENST00000466964 GLI2P10070 1586 aa18.89■□□□□ 0.62
LAMC1-202ENST00000466964 ADGRL1O94910 1474 aa18.87■□□□□ 0.61
LAMC1-202ENST00000466964 ABCC2Q92887 1545 aa18.84■□□□□ 0.61
LAMC1-202ENST00000466964 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.82■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 IGF1RP08069 1367 aa18.79■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 CUL7Q14999 1698 aa18.79■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.78■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 PLB1Q6P1J6 1458 aa18.78■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 ASXL2Q76L83 1435 aa18.78■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP18.78■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 PTPRGP23470 1445 aa18.77■□□□□ 0.6
LAMC1-202ENST00000466964 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.76■□□□□ 0.59
LAMC1-202ENST00000466964 TNIKQ9UKE5 1360 aa18.71■□□□□ 0.59
LAMC1-202ENST00000466964 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
LAMC1-202ENST00000466964 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.69■□□□□ 0.58
LAMC1-202ENST00000466964 DISP1Q96F81 1524 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-202ENST00000466964 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-202ENST00000466964 KIF27Q86VH2 1401 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-202ENST00000466964 UACAQ9BZF9 1416 aa18.65■□□□□ 0.58
LAMC1-202ENST00000466964 TEX14Q8IWB6 1497 aa18.64■□□□□ 0.57
LAMC1-202ENST00000466964 IQGAP2Q13576 1575 aa18.64■□□□□ 0.57
LAMC1-202ENST00000466964 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
LAMC1-202ENST00000466964 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
LAMC1-202ENST00000466964 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa18.58■□□□□ 0.57
LAMC1-202ENST00000466964 UGGT2Q9NYU1 1516 aa18.56■□□□□ 0.56
LAMC1-202ENST00000466964 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa18.54■□□□□ 0.56
LAMC1-202ENST00000466964 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.52■□□□□ 0.56
LAMC1-202ENST00000466964 FBXO41Q8TF61 875 aa18.52■□□□□ 0.56
LAMC1-202ENST00000466964 KIAA0556O60303 1618 aa18.51■□□□□ 0.55
LAMC1-202ENST00000466964 CFAP43Q8NDM7 1665 aa18.5■□□□□ 0.55
LAMC1-202ENST00000466964 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
LAMC1-202ENST00000466964 KIF21BO75037 1637 aa18.45■□□□□ 0.54
LAMC1-202ENST00000466964 ADAMTSL3P82987 1691 aa18.43■□□□□ 0.54
LAMC1-202ENST00000466964 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.42■□□□□ 0.54
LAMC1-202ENST00000466964 CD109Q6YHK3 1445 aa18.41■□□□□ 0.54
LAMC1-202ENST00000466964 ABCA8O94911 1581 aa18.41■□□□□ 0.54
LAMC1-202ENST00000466964 PTPRMP28827 1452 aa18.37■□□□□ 0.53
LAMC1-202ENST00000466964 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa18.37■□□□□ 0.53
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LAMC1-202ENST00000466964 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.31■□□□□ 0.52
LAMC1-202ENST00000466964 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.29■□□□□ 0.52
LAMC1-202ENST00000466964 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.29■□□□□ 0.52
LAMC1-202ENST00000466964 ABCA9Q8IUA7 1624 aa18.27■□□□□ 0.52
LAMC1-202ENST00000466964 PHLDB1Q86UU1 1377 aa18.26■□□□□ 0.51
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LAMC1-202ENST00000466964 KCNH8Q96L42 1107 aa18.21■□□□□ 0.51
LAMC1-202ENST00000466964 NEO1Q92859 1461 aa18.2■□□□□ 0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ATP10BO94823 1461 aa18.2■□□□□ 0.5
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa18.15■□□□□ 0.5
LAMC1-202ENST00000466964 RAPGEF3O95398 923 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-202ENST00000466964 PRXQ9BXM0 1461 aa18.13■□□□□ 0.49
LAMC1-202ENST00000466964 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-202ENST00000466964 RICTORQ6R327 1708 aa18.12■□□□□ 0.49
LAMC1-202ENST00000466964 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa18.1■□□□□ 0.49
LAMC1-202ENST00000466964 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.07■□□□□ 0.48
LAMC1-202ENST00000466964 FHOD3Q2V2M9 1422 aa18.06■□□□□ 0.48
LAMC1-202ENST00000466964 SAMD9Q5K651 1589 aa18.06■□□□□ 0.48
LAMC1-202ENST00000466964 CERKQ8TCT0 537 aa18.05■□□□□ 0.48
LAMC1-202ENST00000466964 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-202ENST00000466964 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.03■□□□□ 0.48
LAMC1-202ENST00000466964 HSPA2P54652 639 aa18.02■□□□□ 0.48
LAMC1-202ENST00000466964 ILDR2Q71H61 639 aa18.02■□□□□ 0.48
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LAMC1-202ENST00000466964 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
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LAMC1-202ENST00000466964 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
LAMC1-202ENST00000466964 FANCAO15360 1455 aa17.98■□□□□ 0.47
LAMC1-202ENST00000466964 AKNAQ7Z591 1439 aa17.97■□□□□ 0.47
LAMC1-202ENST00000466964 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
LAMC1-202ENST00000466964 MAGI2Q86UL8 1455 aa17.96■□□□□ 0.47
LAMC1-202ENST00000466964 YEATS2Q9ULM3 1422 aa17.96■□□□□ 0.47
LAMC1-202ENST00000466964 CFAP74Q9C0B2 1584 aa17.96■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa17.95■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 STRCQ7RTU9 1775 aa17.95■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 EFCAB5A4FU69 1503 aa17.95■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 ARID3CA6NKF2 412 aa17.95■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa17.94■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa17.94■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 POGZQ7Z3K3 1410 aa17.94■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 PREX1Q8TCU6 1659 aa17.93■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 HECW1Q76N89 1606 aa17.9■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.9■□□□□ 0.46
LAMC1-202ENST00000466964 P3H3Q8IVL6 736 aa17.88■□□□□ 0.45
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