RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464025.5

LMO2-204, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LMO2, Length 1,550 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-204ENST00000464025 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
LMO2-204ENST00000464025 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
LMO2-204ENST00000464025 TIAM1Q13009 1591 aa26.42■■□□□ 1.82
LMO2-204ENST00000464025 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.38■■□□□ 1.819e-7■■■□□ 16.1
LMO2-204ENST00000464025 WDR62O43379 1518 aa26.35■■□□□ 1.81
LMO2-204ENST00000464025 PBRM1Q86U86 1689 aa26.34■■□□□ 1.81
LMO2-204ENST00000464025 CFAP43Q8NDM7 1665 aa26.34■■□□□ 1.81
LMO2-204ENST00000464025 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
LMO2-204ENST00000464025 SAMD9Q5K651 1589 aa26.31■■□□□ 1.8
LMO2-204ENST00000464025 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.31■■□□□ 1.8
LMO2-204ENST00000464025 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
LMO2-204ENST00000464025 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.29■■□□□ 1.8
LMO2-204ENST00000464025 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.29■■□□□ 1.8
LMO2-204ENST00000464025 IFT140Q96RY7 1462 aa26.28■■□□□ 1.8
LMO2-204ENST00000464025 FMN1Q68DA7 1419 aa26.26■■□□□ 1.79
LMO2-204ENST00000464025 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.25■■□□□ 1.79
LMO2-204ENST00000464025 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.24■■□□□ 1.79
LMO2-204ENST00000464025 ADAMTS12P58397 1594 aa26.23■■□□□ 1.79
LMO2-204ENST00000464025 GRIN2BQ13224 1484 aa26.22■■□□□ 1.79
LMO2-204ENST00000464025 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.16■■□□□ 1.78
LMO2-204ENST00000464025 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.14■■□□□ 1.78
LMO2-204ENST00000464025 P3H3Q8IVL6 736 aa26.14■■□□□ 1.78
LMO2-204ENST00000464025 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
LMO2-204ENST00000464025 IQGAP2Q13576 1575 aa26.08■■□□□ 1.76
LMO2-204ENST00000464025 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
LMO2-204ENST00000464025 ERCC6Q03468 1493 aa26.05■■□□□ 1.76
LMO2-204ENST00000464025 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.05■■□□□ 1.76
LMO2-204ENST00000464025 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
LMO2-204ENST00000464025 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
LMO2-204ENST00000464025 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
LMO2-204ENST00000464025 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.01■■□□□ 1.75
LMO2-204ENST00000464025 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26■■□□□ 1.75
LMO2-204ENST00000464025 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
LMO2-204ENST00000464025 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.94■■□□□ 1.74
LMO2-204ENST00000464025 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
LMO2-204ENST00000464025 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.93■■□□□ 1.74
LMO2-204ENST00000464025 GRIN2AQ12879 1464 aa25.91■■□□□ 1.74
LMO2-204ENST00000464025 HECW1Q76N89 1606 aa25.9■■□□□ 1.74
LMO2-204ENST00000464025 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.89■■□□□ 1.74
LMO2-204ENST00000464025 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.87■■□□□ 1.73
LMO2-204ENST00000464025 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
LMO2-204ENST00000464025 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.86■■□□□ 1.73
LMO2-204ENST00000464025 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.84■■□□□ 1.73
LMO2-204ENST00000464025 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.83■■□□□ 1.73
LMO2-204ENST00000464025 SYNJ2O15056 1496 aa25.83■■□□□ 1.73
LMO2-204ENST00000464025 ARHGEF11O15085 1522 aa25.83■■□□□ 1.73
LMO2-204ENST00000464025 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
LMO2-204ENST00000464025 KIAA0556O60303 1618 aa25.81■■□□□ 1.72
LMO2-204ENST00000464025 NCOA2Q15596 1464 aa25.81■■□□□ 1.72
LMO2-204ENST00000464025 DISP1Q96F81 1524 aa25.79■■□□□ 1.72
LMO2-204ENST00000464025 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
LMO2-204ENST00000464025 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
LMO2-204ENST00000464025 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.77■■□□□ 1.72
LMO2-204ENST00000464025 ITGAEP38570 1179 aa25.77■■□□□ 1.72
LMO2-204ENST00000464025 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.75■■□□□ 1.71
LMO2-204ENST00000464025 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
LMO2-204ENST00000464025 CEP170Q5SW79 1584 aa25.72■■□□□ 1.71
LMO2-204ENST00000464025 NUP160Q12769 1436 aa25.71■■□□□ 1.71
LMO2-204ENST00000464025 MAPKBP1O60336 1514 aa25.68■■□□□ 1.7
LMO2-204ENST00000464025 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
LMO2-204ENST00000464025 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
LMO2-204ENST00000464025 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.65■■□□□ 1.7
LMO2-204ENST00000464025 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.65■■□□□ 1.7
LMO2-204ENST00000464025 MIA2Q96PC5 1412 aa25.62■■□□□ 1.69
LMO2-204ENST00000464025 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
LMO2-204ENST00000464025 HFM1A2PYH4 1435 aa25.61■■□□□ 1.69
LMO2-204ENST00000464025 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
LMO2-204ENST00000464025 PTPRKQ15262 1439 aa25.58■■□□□ 1.68
LMO2-204ENST00000464025 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.57■■□□□ 1.68
LMO2-204ENST00000464025 AKNAQ7Z591 1439 aa25.52■■□□□ 1.68
LMO2-204ENST00000464025 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.52■■□□□ 1.68
LMO2-204ENST00000464025 JPH4Q96JJ6 628 aa25.51■■□□□ 1.67
LMO2-204ENST00000464025 NAIPQ13075 1403 aa25.5■■□□□ 1.67
LMO2-204ENST00000464025 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
LMO2-204ENST00000464025 UACAQ9BZF9 1416 aa25.47■■□□□ 1.67
LMO2-204ENST00000464025 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.46■■□□□ 1.67
LMO2-204ENST00000464025 FBLN2P98095 1184 aa25.45■■□□□ 1.66
LMO2-204ENST00000464025 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.44■■□□□ 1.66
LMO2-204ENST00000464025 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
LMO2-204ENST00000464025 ABCA8O94911 1581 aa25.42■■□□□ 1.66
LMO2-204ENST00000464025 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.41■■□□□ 1.66
LMO2-204ENST00000464025 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
LMO2-204ENST00000464025 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.36■■□□□ 1.65
LMO2-204ENST00000464025 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
LMO2-204ENST00000464025 ROCK1Q13464 1354 aa25.35■■□□□ 1.65
LMO2-204ENST00000464025 CHD1O14646 1710 aa25.33■■□□□ 1.65
LMO2-204ENST00000464025 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
LMO2-204ENST00000464025 DAPK1P53355 1430 aa25.3■■□□□ 1.64
LMO2-204ENST00000464025 SHROOM2Q13796 1616 aa25.3■■□□□ 1.64
LMO2-204ENST00000464025 ARID3CA6NKF2 412 aa25.3■■□□□ 1.64
LMO2-204ENST00000464025 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.29■■□□□ 1.64
LMO2-204ENST00000464025 ABCC5O15440 1437 aa25.26■■□□□ 1.63
LMO2-204ENST00000464025 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
LMO2-204ENST00000464025 ATP10BO94823 1461 aa25.25■■□□□ 1.63
LMO2-204ENST00000464025 KIF14Q15058 1648 aa25.24■■□□□ 1.63
LMO2-204ENST00000464025 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
LMO2-204ENST00000464025 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.22■■□□□ 1.63
LMO2-204ENST00000464025 NEUROD1Q13562 356 aa25.21■■□□□ 1.63
LMO2-204ENST00000464025 PTPRGP23470 1445 aa25.21■■□□□ 1.63
LMO2-204ENST00000464025 MIER1Q8N108 512 aa25.2■■□□□ 1.62
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