RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 NUP160Q12769 1436 aa25.55■■□□□ 1.68
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C9orf3-211ENST00000463372 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
C9orf3-211ENST00000463372 ADAMTS12P58397 1594 aa25.43■■□□□ 1.66
C9orf3-211ENST00000463372 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.41■■□□□ 1.66
C9orf3-211ENST00000463372 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.38■■□□□ 1.65
C9orf3-211ENST00000463372 SOCS7O14512 581 aa25.34■■□□□ 1.65
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C9orf3-211ENST00000463372 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.29■■□□□ 1.64
C9orf3-211ENST00000463372 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
C9orf3-211ENST00000463372 TOP2BQ02880 1626 aa25.22■■□□□ 1.63
C9orf3-211ENST00000463372 ILDR2Q71H61 639 aa25.19■■□□□ 1.62
C9orf3-211ENST00000463372 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.13■■□□□ 1.61
C9orf3-211ENST00000463372 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.11■■□□□ 1.61
C9orf3-211ENST00000463372 GLI2P10070 1586 aa25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-211ENST00000463372 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
C9orf3-211ENST00000463372 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.08■■□□□ 1.61
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C9orf3-211ENST00000463372 ASXL2Q76L83 1435 aa25■■□□□ 1.59
C9orf3-211ENST00000463372 TEX14Q8IWB6 1497 aa25■■□□□ 1.59
C9orf3-211ENST00000463372 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.94■■□□□ 1.58
C9orf3-211ENST00000463372 ABCC2Q92887 1545 aa24.94■■□□□ 1.58
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C9orf3-211ENST00000463372 PTPRGP23470 1445 aa24.89■■□□□ 1.58
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C9orf3-211ENST00000463372 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.8■■□□□ 1.56
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C9orf3-211ENST00000463372 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.78■■□□□ 1.56
C9orf3-211ENST00000463372 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.71■■□□□ 1.55
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C9orf3-211ENST00000463372 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.69■■□□□ 1.54
C9orf3-211ENST00000463372 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.68■■□□□ 1.54
C9orf3-211ENST00000463372 UACAQ9BZF9 1416 aa24.64■■□□□ 1.54
C9orf3-211ENST00000463372 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.61■■□□□ 1.53
C9orf3-211ENST00000463372 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
C9orf3-211ENST00000463372 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa24.56■■□□□ 1.52
C9orf3-211ENST00000463372 HSPA2P54652 639 aa24.56■■□□□ 1.52
C9orf3-211ENST00000463372 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.56■■□□□ 1.52
C9orf3-211ENST00000463372 CD109Q6YHK3 1445 aa24.55■■□□□ 1.52
C9orf3-211ENST00000463372 MADDQ8WXG6 1647 aa24.53■■□□□ 1.52
C9orf3-211ENST00000463372 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.52■■□□□ 1.52
C9orf3-211ENST00000463372 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.51■■□□□ 1.51
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C9orf3-211ENST00000463372 KIF27Q86VH2 1401 aa24.25■■□□□ 1.47
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C9orf3-211ENST00000463372 KIAA0556O60303 1618 aa24.19■■□□□ 1.46
C9orf3-211ENST00000463372 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.17■■□□□ 1.46
C9orf3-211ENST00000463372 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.15■■□□□ 1.46
C9orf3-211ENST00000463372 STRCQ7RTU9 1775 aa24.14■■□□□ 1.46
C9orf3-211ENST00000463372 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.14■■□□□ 1.45
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C9orf3-211ENST00000463372 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.09■■□□□ 1.45
C9orf3-211ENST00000463372 FANCAO15360 1455 aa24.07■■□□□ 1.44
C9orf3-211ENST00000463372 NEO1Q92859 1461 aa24.07■■□□□ 1.44
C9orf3-211ENST00000463372 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.07■■□□□ 1.44
C9orf3-211ENST00000463372 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.06■■□□□ 1.44
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C9orf3-211ENST00000463372 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.98■■□□□ 1.43
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C9orf3-211ENST00000463372 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
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C9orf3-211ENST00000463372 GOLGA3Q08378 1498 aa23.89■■□□□ 1.42
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C9orf3-211ENST00000463372 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.84■■□□□ 1.41
C9orf3-211ENST00000463372 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
C9orf3-211ENST00000463372 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
C9orf3-211ENST00000463372 ATP10BO94823 1461 aa23.82■■□□□ 1.4
C9orf3-211ENST00000463372 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.81■■□□□ 1.4
C9orf3-211ENST00000463372 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa23.81■■□□□ 1.4
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