RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462892.1

SEMA4A-209, Transcript of semaphorin 4A, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA4A, Length 993 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4A-209ENST00000462892 JPH4Q96JJ6 628 aa42.93■■■■■ 4.46
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SEMA4A-209ENST00000462892 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.84■■■■■ 4.45
SEMA4A-209ENST00000462892 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.69■■■■■ 4.42
SEMA4A-209ENST00000462892 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
SEMA4A-209ENST00000462892 IQGAP2Q13576 1575 aa42.53■■■■■ 4.4
SEMA4A-209ENST00000462892 PRXQ9BXM0 1461 aa42.46■■■■■ 4.39
SEMA4A-209ENST00000462892 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.39■■■■■ 4.38
SEMA4A-209ENST00000462892 CSRNP3Q8WYN3 585 aa42.36■■■■■ 4.37
SEMA4A-209ENST00000462892 PTPRGP23470 1445 aa42.31■■■■■ 4.36
SEMA4A-209ENST00000462892 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.3■■■■■ 4.36
SEMA4A-209ENST00000462892 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.3■■■■■ 4.36
SEMA4A-209ENST00000462892 EEA1Q15075 1411 aa42.29■■■■■ 4.36
SEMA4A-209ENST00000462892 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.29■■■■■ 4.36
SEMA4A-209ENST00000462892 DISP1Q96F81 1524 aa42.29■■■■■ 4.36
SEMA4A-209ENST00000462892 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
SEMA4A-209ENST00000462892 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.25■■■■■ 4.35
SEMA4A-209ENST00000462892 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.24■■■■■ 4.35
SEMA4A-209ENST00000462892 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.19■■■■■ 4.34
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SEMA4A-209ENST00000462892 KIAA0556O60303 1618 aa42.13■■■■■ 4.34
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SEMA4A-209ENST00000462892 UACAQ9BZF9 1416 aa42.01■■■■■ 4.32
SEMA4A-209ENST00000462892 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.98■■■■■ 4.31
SEMA4A-209ENST00000462892 ABCC2Q92887 1545 aa41.96■■■■■ 4.31
SEMA4A-209ENST00000462892 ABCC10Q5T3U5 1492 aa41.92■■■■■ 4.3
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SEMA4A-209ENST00000462892 DIP2BQ9P265 1576 aa41.82■■■■■ 4.29
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SEMA4A-209ENST00000462892 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.78■■■■■ 4.28
SEMA4A-209ENST00000462892 ASXL2Q76L83 1435 aa41.74■■■■■ 4.27
SEMA4A-209ENST00000462892 SAMD9Q5K651 1589 aa41.73■■■■■ 4.27
SEMA4A-209ENST00000462892 ABCA8O94911 1581 aa41.71■■■■■ 4.27
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SEMA4A-209ENST00000462892 GLI2P10070 1586 aa41.52■■■■■ 4.24
SEMA4A-209ENST00000462892 FHOD3Q2V2M9 1422 aa41.51■■■■■ 4.24
SEMA4A-209ENST00000462892 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
SEMA4A-209ENST00000462892 EFCAB5A4FU69 1503 aa41.47■■■■■ 4.23
SEMA4A-209ENST00000462892 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.46■■■■■ 4.23
SEMA4A-209ENST00000462892 TSPOAP1O95153 1857 aa41.45■■■■■ 4.23
SEMA4A-209ENST00000462892 ARID3CA6NKF2 412 aa41.43■■■■■ 4.22
SEMA4A-209ENST00000462892 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.41■■■■■ 4.22
SEMA4A-209ENST00000462892 ATP10BO94823 1461 aa41.39■■■■■ 4.22
SEMA4A-209ENST00000462892 KCNH8Q96L42 1107 aa41.31■■■■■ 4.2
SEMA4A-209ENST00000462892 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.31■■■■■ 4.2
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SEMA4A-209ENST00000462892 FMN1Q68DA7 1419 aa41.1■■■■■ 4.17
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SEMA4A-209ENST00000462892 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41■■■■■ 4.15
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SEMA4A-209ENST00000462892 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.98■■■■■ 4.15
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SEMA4A-209ENST00000462892 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
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SEMA4A-209ENST00000462892 CLIP1P30622 1438 aa40.87■■■■■ 4.13
SEMA4A-209ENST00000462892 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa40.76■■■■■ 4.11
SEMA4A-209ENST00000462892 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.11
SEMA4A-209ENST00000462892 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
SEMA4A-209ENST00000462892 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
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SEMA4A-209ENST00000462892 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.71■■■■■ 4.11
SEMA4A-209ENST00000462892 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.71■■■■■ 4.11
SEMA4A-209ENST00000462892 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa40.7■■■■■ 4.11
SEMA4A-209ENST00000462892 NEO1Q92859 1461 aa40.69■■■■■ 4.1
SEMA4A-209ENST00000462892 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.68■■■■■ 4.1
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SEMA4A-209ENST00000462892 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.29■■■■■ 4.04
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