RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.04■■□□□ 1.44
NOP56-204ENST00000460258 CUX1P39880 1505 aa24.03■■□□□ 1.44
NOP56-204ENST00000460258 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.99■■□□□ 1.43
NOP56-204ENST00000460258 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
NOP56-204ENST00000460258 ADAMTS12P58397 1594 aa23.91■■□□□ 1.42
NOP56-204ENST00000460258 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.89■■□□□ 1.42
NOP56-204ENST00000460258 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.88■■□□□ 1.41
NOP56-204ENST00000460258 SOCS7O14512 581 aa23.85■■□□□ 1.41
NOP56-204ENST00000460258 JPH4Q96JJ6 628 aa23.82■■□□□ 1.4
NOP56-204ENST00000460258 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.77■■□□□ 1.4
NOP56-204ENST00000460258 ILDR2Q71H61 639 aa23.77■■□□□ 1.4
NOP56-204ENST00000460258 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
NOP56-204ENST00000460258 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
NOP56-204ENST00000460258 TOP2BQ02880 1626 aa23.66■■□□□ 1.38
NOP56-204ENST00000460258 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.64■■□□□ 1.37
NOP56-204ENST00000460258 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.61■■□□□ 1.37
NOP56-204ENST00000460258 GLI2P10070 1586 aa23.61■■□□□ 1.37
NOP56-204ENST00000460258 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.57■■□□□ 1.36
NOP56-204ENST00000460258 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
NOP56-204ENST00000460258 ASXL2Q76L83 1435 aa23.52■■□□□ 1.36
NOP56-204ENST00000460258 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.5■■□□□ 1.35
NOP56-204ENST00000460258 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.47■■□□□ 1.35
NOP56-204ENST00000460258 ABCC2Q92887 1545 aa23.45■■□□□ 1.34
NOP56-204ENST00000460258 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa23.44■■□□□ 1.34
NOP56-204ENST00000460258 PTPRGP23470 1445 aa23.4■■□□□ 1.34
NOP56-204ENST00000460258 CUL7Q14999 1698 aa23.38■■□□□ 1.33
NOP56-204ENST00000460258 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NOP56-204ENST00000460258 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NOP56-204ENST00000460258 KIF21BO75037 1637 aa23.35■■□□□ 1.33
NOP56-204ENST00000460258 CERKQ8TCT0 537 aa23.34■■□□□ 1.33
NOP56-204ENST00000460258 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.33■■□□□ 1.33
NOP56-204ENST00000460258 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NOP56-204ENST00000460258 PTPRMP28827 1452 aa23.32■■□□□ 1.32
NOP56-204ENST00000460258 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.31■■□□□ 1.32
NOP56-204ENST00000460258 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.27■■□□□ 1.32
NOP56-204ENST00000460258 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.24■■□□□ 1.31
NOP56-204ENST00000460258 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.23■■□□□ 1.31
NOP56-204ENST00000460258 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.22■■□□□ 1.31
NOP56-204ENST00000460258 UACAQ9BZF9 1416 aa23.17■■□□□ 1.3
NOP56-204ENST00000460258 KDM5BQ9UGL1 1544 aa23.16■■□□□ 1.3
NOP56-204ENST00000460258 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.15■■□□□ 1.3
NOP56-204ENST00000460258 HSPA2P54652 639 aa23.13■■□□□ 1.29
NOP56-204ENST00000460258 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
NOP56-204ENST00000460258 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa23.1■■□□□ 1.29
NOP56-204ENST00000460258 CD109Q6YHK3 1445 aa23.08■■□□□ 1.28
NOP56-204ENST00000460258 MADDQ8WXG6 1647 aa23.06■■□□□ 1.28
NOP56-204ENST00000460258 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.05■■□□□ 1.28
NOP56-204ENST00000460258 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.04■■□□□ 1.28
NOP56-204ENST00000460258 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.03■■□□□ 1.28
NOP56-204ENST00000460258 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.97■■□□□ 1.27
NOP56-204ENST00000460258 IGF1RP08069 1367 aa22.95■■□□□ 1.26
NOP56-204ENST00000460258 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
NOP56-204ENST00000460258 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NOP56-204ENST00000460258 KCNH8Q96L42 1107 aa22.93■■□□□ 1.26
NOP56-204ENST00000460258 DISP1Q96F81 1524 aa22.92■■□□□ 1.26
NOP56-204ENST00000460258 IQGAP2Q13576 1575 aa22.92■■□□□ 1.26
NOP56-204ENST00000460258 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.88■■□□□ 1.25
NOP56-204ENST00000460258 RAPGEF3O95398 923 aa22.81■■□□□ 1.24
NOP56-204ENST00000460258 KIF27Q86VH2 1401 aa22.77■■□□□ 1.24
NOP56-204ENST00000460258 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.76■■□□□ 1.23
NOP56-204ENST00000460258 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.76■■□□□ 1.23
NOP56-204ENST00000460258 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.74■■□□□ 1.23
NOP56-204ENST00000460258 KIAA0556O60303 1618 aa22.73■■□□□ 1.23
NOP56-204ENST00000460258 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.73■■□□□ 1.23
NOP56-204ENST00000460258 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.72■■□□□ 1.23
NOP56-204ENST00000460258 STRCQ7RTU9 1775 aa22.71■■□□□ 1.23
NOP56-204ENST00000460258 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.7■■□□□ 1.22
NOP56-204ENST00000460258 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.67■■□□□ 1.22
NOP56-204ENST00000460258 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.64■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.64■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 NEO1Q92859 1461 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 ABCA8O94911 1581 aa22.62■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.61■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 FANCAO15360 1455 aa22.6■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.59■■□□□ 1.21
NOP56-204ENST00000460258 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.55■■□□□ 1.2
NOP56-204ENST00000460258 PTPRTO14522 1441 aa22.55■■□□□ 1.2
NOP56-204ENST00000460258 MLECQ14165 292 aa22.54■■□□□ 1.2
NOP56-204ENST00000460258 AKNAQ7Z591 1439 aa22.51■■□□□ 1.19
NOP56-204ENST00000460258 RICTORQ6R327 1708 aa22.5■■□□□ 1.19
NOP56-204ENST00000460258 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
NOP56-204ENST00000460258 ARID3CA6NKF2 412 aa22.48■■□□□ 1.19
NOP56-204ENST00000460258 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
NOP56-204ENST00000460258 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.46■■□□□ 1.19
NOP56-204ENST00000460258 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
NOP56-204ENST00000460258 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.46■■□□□ 1.19
NOP56-204ENST00000460258 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.42■■□□□ 1.18
NOP56-204ENST00000460258 ATP10BO94823 1461 aa22.42■■□□□ 1.18
NOP56-204ENST00000460258 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.42■■□□□ 1.18
NOP56-204ENST00000460258 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
NOP56-204ENST00000460258 GOLGA3Q08378 1498 aa22.41■■□□□ 1.18
NOP56-204ENST00000460258 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.4■■□□□ 1.18
NOP56-204ENST00000460258 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.4■■□□□ 1.18
NOP56-204ENST00000460258 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.39■■□□□ 1.17
NOP56-204ENST00000460258 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.39■■□□□ 1.17
NOP56-204ENST00000460258 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NOP56-204ENST00000460258 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms