RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454885.6

ARL6IP4-211, Transcript of ADP ribosylation factor like GTPase 6 interacting protein 4, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ARL6IP4, Length 1,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	43.38	■■■■■ 4.54
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		43.36	■■■■■ 4.53
ARL6IP4-211	ENST00000454885	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		43.34	■■■■■ 4.53
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		43.31	■■■■■ 4.52
ARL6IP4-211	ENST00000454885	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		43.02	■■■■■ 4.48
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		42.91	■■■■■ 4.46
ARL6IP4-211	ENST00000454885	IQGAP2	Q13576	1575 aa		42.91	■■■■■ 4.46
ARL6IP4-211	ENST00000454885	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	42.9	■■■■■ 4.46
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PTPRG	P23470	1445 aa		42.82	■■■■■ 4.45
ARL6IP4-211	ENST00000454885	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		42.78	■■■■■ 4.44
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		42.72	■■■■■ 4.43
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PRX	Q9BXM0	1461 aa		42.7	■■■■■ 4.43
ARL6IP4-211	ENST00000454885	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		42.68	■■■■■ 4.42
ARL6IP4-211	ENST00000454885	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	42.65	■■■■■ 4.42
ARL6IP4-211	ENST00000454885	DISP1	Q96F81	1524 aa		42.65	■■■■■ 4.42
ARL6IP4-211	ENST00000454885	MAPKBP1	O60336	1514 aa		42.64	■■■■■ 4.42
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		42.59	■■■■■ 4.41
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		42.55	■■■■■ 4.4
ARL6IP4-211	ENST00000454885	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		42.53	■■■■■ 4.4
ARL6IP4-211	ENST00000454885	EEA1	Q15075	1411 aa		42.51	■■■■■ 4.4
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		42.5	■■■■■ 4.39
ARL6IP4-211	ENST00000454885	UACA	Q9BZF9	1416 aa		42.49	■■■■■ 4.39
ARL6IP4-211	ENST00000454885	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		42.49	■■■■■ 4.39
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ABCC2	Q92887	1545 aa		42.48	■■■■■ 4.39
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KIAA0556	O60303	1618 aa		42.47	■■■■■ 4.39
ARL6IP4-211	ENST00000454885	GOLGA3	Q08378	1498 aa		42.45	■■■■■ 4.39
ARL6IP4-211	ENST00000454885	DIP2B	Q9P265	1576 aa		42.38	■■■■■ 4.37
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		42.3	■■■■■ 4.36
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ASXL2	Q76L83	1435 aa		42.27	■■■■■ 4.36
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		42.27	■■■■■ 4.36
ARL6IP4-211	ENST00000454885	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	42.26	■■■■■ 4.36
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		42.21	■■■■■ 4.35
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	42.09	■■■■■ 4.33
ARL6IP4-211	ENST00000454885	GLI2	P10070	1586 aa		42.09	■■■■■ 4.33
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ABCA8	O94911	1581 aa		42.07	■■■■■ 4.33
ARL6IP4-211	ENST00000454885	P3H3	Q8IVL6	736 aa		42.06	■■■■■ 4.32
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KIF21B	O75037	1637 aa		42.01	■■■■■ 4.32
ARL6IP4-211	ENST00000454885	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	42	■■■■■ 4.31
ARL6IP4-211	ENST00000454885	TSPOAP1	O95153	1857 aa		42	■■■■■ 4.31
ARL6IP4-211	ENST00000454885	SAMD9	Q5K651	1589 aa		41.98	■■■■■ 4.31
ARL6IP4-211	ENST00000454885	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		41.95	■■■■■ 4.31
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KDM6B	O15054	1643 aa		41.89	■■■■■ 4.3
ARL6IP4-211	ENST00000454885	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.29
ARL6IP4-211	ENST00000454885	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		41.82	■■■■■ 4.29
ARL6IP4-211	ENST00000454885	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	41.79	■■■■■ 4.28
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KCNH8	Q96L42	1107 aa		41.79	■■■■■ 4.28
ARL6IP4-211	ENST00000454885	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.78	■■■■■ 4.28
ARL6IP4-211	ENST00000454885	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		41.78	■■■■■ 4.28
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	41.78	■■■■■ 4.28
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ATP10B	O94823	1461 aa		41.77	■■■■■ 4.28
ARL6IP4-211	ENST00000454885	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		41.74	■■■■■ 4.27
ARL6IP4-211	ENST00000454885	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		41.72	■■■■■ 4.27
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ARID3C	A6NKF2	412 aa		41.71	■■■■■ 4.27
ARL6IP4-211	ENST00000454885	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		41.71	■■■■■ 4.27
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CD109	Q6YHK3	1445 aa		41.67	■■■■■ 4.26
ARL6IP4-211	ENST00000454885	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		41.67	■■■■■ 4.26
ARL6IP4-211	ENST00000454885	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	41.63	■■■■■ 4.25
ARL6IP4-211	ENST00000454885	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	41.63	■■■■■ 4.25
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		41.62	■■■■■ 4.25
ARL6IP4-211	ENST00000454885	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		41.61	■■■■■ 4.25
ARL6IP4-211	ENST00000454885	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	41.58	■■■■■ 4.25
ARL6IP4-211	ENST00000454885	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	41.52	■■■■■ 4.24
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		41.47	■■■■■ 4.23
ARL6IP4-211	ENST00000454885	FMN1	Q68DA7	1419 aa		41.43	■■■■■ 4.22
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		41.4	■■■■■ 4.22
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		41.4	■■■■■ 4.22
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		41.37	■■■■■ 4.21
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		41.27	■■■■■ 4.2
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		41.27	■■■■■ 4.2
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	41.27	■■■■■ 4.2
ARL6IP4-211	ENST00000454885	NEO1	Q92859	1461 aa		41.22	■■■■■ 4.19
ARL6IP4-211	ENST00000454885	HECW1	Q76N89	1606 aa		41.21	■■■■■ 4.19
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	41.2	■■■■■ 4.19
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	41.18	■■■■■ 4.18
ARL6IP4-211	ENST00000454885	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	41.1	■■■■■ 4.17	1e-6	■■■□□ 14.9
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ADGRL1	O94910	1474 aa		41.04	■■■■■ 4.16
ARL6IP4-211	ENST00000454885	RAPGEF3	O95398	923 aa		41.03	■■■■■ 4.16
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		41	■■■■■ 4.15
ARL6IP4-211	ENST00000454885	FANCA	O15360	1455 aa		41	■■■■■ 4.15
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CLIP1	P30622	1438 aa		40.99	■■■■■ 4.15
ARL6IP4-211	ENST00000454885	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		40.98	■■■■■ 4.15
ARL6IP4-211	ENST00000454885	AKNA	Q7Z591	1439 aa		40.97	■■■■■ 4.15
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		40.97	■■■■■ 4.15
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PLCH2	O75038	1416 aa		40.94	■■■■■ 4.14
ARL6IP4-211	ENST00000454885	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	40.93	■■■■■ 4.14
ARL6IP4-211	ENST00000454885	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	40.92	■■■■■ 4.14
ARL6IP4-211	ENST00000454885	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		40.91	■■■■■ 4.14
ARL6IP4-211	ENST00000454885	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
ARL6IP4-211	ENST00000454885	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		40.84	■■■■■ 4.13
ARL6IP4-211	ENST00000454885	EFCAB2	Q5VUJ9	269 aa		40.84	■■■■■ 4.13
ARL6IP4-211	ENST00000454885	KIF14	Q15058	1648 aa		40.84	■■■■■ 4.13
ARL6IP4-211	ENST00000454885	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		40.83	■■■■■ 4.13
ARL6IP4-211	ENST00000454885	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		40.83	■■■■■ 4.13
ARL6IP4-211	ENST00000454885	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		40.75	■■■■■ 4.11
ARL6IP4-211	ENST00000454885	RICTOR	Q6R327	1708 aa		40.75	■■■■■ 4.11
ARL6IP4-211	ENST00000454885	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		40.73	■■■■■ 4.11
ARL6IP4-211	ENST00000454885	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		40.67	■■■■■ 4.1
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		40.66	■■■■■ 4.1
ARL6IP4-211	ENST00000454885	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		40.64	■■■■■ 4.1

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