RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
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RABGEF1-205ENST00000450873 CUL7Q14999 1698 aa17.66■□□□□ 0.42
RABGEF1-205ENST00000450873 EEA1Q15075 1411 aa17.65■□□□□ 0.42
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RABGEF1-205ENST00000450873 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.6■□□□□ 0.41
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RABGEF1-205ENST00000450873 IQGAP2Q13576 1575 aa17.44■□□□□ 0.38
RABGEF1-205ENST00000450873 PTPRGP23470 1445 aa17.43■□□□□ 0.38
RABGEF1-205ENST00000450873 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa17.43■□□□□ 0.38
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RABGEF1-205ENST00000450873 ABCA8O94911 1581 aa17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1-205ENST00000450873 SAMD9Q5K651 1589 aa17.13■□□□□ 0.33
RABGEF1-205ENST00000450873 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.13■□□□□ 0.33
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RABGEF1-205ENST00000450873 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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RABGEF1-205ENST00000450873 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.69■□□□□ 0.26
RABGEF1-205ENST00000450873 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-205ENST00000450873 RICTORQ6R327 1708 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-205ENST00000450873 FANCAO15360 1455 aa16.68■□□□□ 0.26
RABGEF1-205ENST00000450873 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
RABGEF1-205ENST00000450873 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa16.66■□□□□ 0.26
RABGEF1-205ENST00000450873 BCORL1Q5H9F3 1711 aa16.65■□□□□ 0.26
RABGEF1-205ENST00000450873 APLP2Q06481 763 aa16.65■□□□□ 0.26
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