RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449938.6

USP36-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,647 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-202ENST00000449938 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP36-202ENST00000449938 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
USP36-202ENST00000449938 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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USP36-202ENST00000449938 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.44■□□□□ 0.86
USP36-202ENST00000449938 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.865e-7■■■■■ 31.2
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USP36-202ENST00000449938 ADAMTS12P58397 1594 aa20.41■□□□□ 0.86
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USP36-202ENST00000449938 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.29■□□□□ 0.84
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USP36-202ENST00000449938 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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USP36-202ENST00000449938 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
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USP36-202ENST00000449938 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
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USP36-202ENST00000449938 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa19.77■□□□□ 0.76
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USP36-202ENST00000449938 KIF14Q15058 1648 aa19.55■□□□□ 0.72
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USP36-202ENST00000449938 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
USP36-202ENST00000449938 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
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USP36-202ENST00000449938 DAPK1P53355 1430 aa19.52■□□□□ 0.71
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