RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448450.5

HTATSF1-203, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene HTATSF1, Length 1,014 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-203ENST00000448450 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.94■■■■■ 4.47
HTATSF1-203ENST00000448450 CUL7Q14999 1698 aa42.74■■■■■ 4.43
HTATSF1-203ENST00000448450 KIF27Q86VH2 1401 aa42.73■■■■■ 4.43
HTATSF1-203ENST00000448450 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.7■■■■■ 4.43
HTATSF1-203ENST00000448450 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.69■■■■■ 4.42
HTATSF1-203ENST00000448450 MAPKBP1O60336 1514 aa42.69■■■■■ 4.42
HTATSF1-203ENST00000448450 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.67■■■■■ 4.42
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.66■■■■■ 4.42
HTATSF1-203ENST00000448450 IGF1RP08069 1367 aa42.65■■■■■ 4.42
HTATSF1-203ENST00000448450 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.59■■■■■ 4.41
HTATSF1-203ENST00000448450 DIP2BQ9P265 1576 aa42.58■■■■■ 4.41
HTATSF1-203ENST00000448450 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.39■■■■■ 4.38
HTATSF1-203ENST00000448450 PTPRGP23470 1445 aa42.35■■■■■ 4.37
HTATSF1-203ENST00000448450 KDM6BO15054 1643 aa42.32■■■■■ 4.37
HTATSF1-203ENST00000448450 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.31■■■■■ 4.36
HTATSF1-203ENST00000448450 TSPOAP1O95153 1857 aa42.31■■■■■ 4.36
HTATSF1-203ENST00000448450 IQGAP2Q13576 1575 aa42.3■■■■■ 4.36
HTATSF1-203ENST00000448450 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.26■■■■■ 4.35
HTATSF1-203ENST00000448450 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCC2Q92887 1545 aa42.2■■■■■ 4.35
HTATSF1-203ENST00000448450 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.09■■■■■ 4.33
HTATSF1-203ENST00000448450 ASXL2Q76L83 1435 aa42.08■■■■■ 4.33
HTATSF1-203ENST00000448450 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.08■■■■■ 4.33
HTATSF1-203ENST00000448450 DISP1Q96F81 1524 aa42.05■■■■■ 4.32
HTATSF1-203ENST00000448450 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.05■■■■■ 4.32
HTATSF1-203ENST00000448450 CHIC1Q5VXU3 224 aa42.05■■■■■ 4.32
HTATSF1-203ENST00000448450 UACAQ9BZF9 1416 aa42.03■■■■■ 4.32
HTATSF1-203ENST00000448450 GLI2P10070 1586 aa42.02■■■■■ 4.32
HTATSF1-203ENST00000448450 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.97■■■■■ 4.31
HTATSF1-203ENST00000448450 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
HTATSF1-203ENST00000448450 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.91■■■■■ 4.3
HTATSF1-203ENST00000448450 KIAA0556O60303 1618 aa41.91■■■■■ 4.3
HTATSF1-203ENST00000448450 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.9■■■■■ 4.3
HTATSF1-203ENST00000448450 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.89■■■■■ 4.3
HTATSF1-203ENST00000448450 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
HTATSF1-203ENST00000448450 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
HTATSF1-203ENST00000448450 PRXQ9BXM0 1461 aa41.85■■■■■ 4.29
HTATSF1-203ENST00000448450 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.82■■■■■ 4.29
HTATSF1-203ENST00000448450 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.81■■■■■ 4.28
HTATSF1-203ENST00000448450 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.78■■■■■ 4.28
HTATSF1-203ENST00000448450 EEA1Q15075 1411 aa41.77■■■■■ 4.28
HTATSF1-203ENST00000448450 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.73■■■■■ 4.27
HTATSF1-203ENST00000448450 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.65■■■■■ 4.26
HTATSF1-203ENST00000448450 GOLGA3Q08378 1498 aa41.64■■■■■ 4.26
HTATSF1-203ENST00000448450 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.62■■■■■ 4.25
HTATSF1-203ENST00000448450 ADGRL1O94910 1474 aa41.6■■■■■ 4.25
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCA8O94911 1581 aa41.51■■■■■ 4.24
HTATSF1-203ENST00000448450 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.47■■■■■ 4.23
HTATSF1-203ENST00000448450 EHMT2Q96KQ7 1210 aa41.42■■■■■ 4.22
HTATSF1-203ENST00000448450 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.39■■■■■ 4.22
HTATSF1-203ENST00000448450 CD109Q6YHK3 1445 aa41.39■■■■■ 4.22
HTATSF1-203ENST00000448450 KIF21BO75037 1637 aa41.35■■■■■ 4.21
HTATSF1-203ENST00000448450 KCNH8Q96L42 1107 aa41.34■■■■■ 4.21
HTATSF1-203ENST00000448450 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
HTATSF1-203ENST00000448450 P3H3Q8IVL6 736 aa41.28■■■■■ 4.2
HTATSF1-203ENST00000448450 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
HTATSF1-203ENST00000448450 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.16■■■■■ 4.18
HTATSF1-203ENST00000448450 ATP10BO94823 1461 aa41.12■■■■■ 4.17
HTATSF1-203ENST00000448450 ARID3CA6NKF2 412 aa41.11■■■■■ 4.17
HTATSF1-203ENST00000448450 SAMD9Q5K651 1589 aa41.11■■■■■ 4.17
HTATSF1-203ENST00000448450 ARAP3Q8WWN8 1544 aa41.08■■■■■ 4.17
HTATSF1-203ENST00000448450 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.06■■■■■ 4.16
HTATSF1-203ENST00000448450 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.04■■■■■ 4.16
HTATSF1-203ENST00000448450 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.99■■■■■ 4.15
HTATSF1-203ENST00000448450 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.97■■■■■ 4.15
HTATSF1-203ENST00000448450 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.93■■■■■ 4.14
HTATSF1-203ENST00000448450 NEO1Q92859 1461 aa40.88■■■■■ 4.13
HTATSF1-203ENST00000448450 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.87■■■■■ 4.13
HTATSF1-203ENST00000448450 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.87■■■■■ 4.13
HTATSF1-203ENST00000448450 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.85■■■■■ 4.13
HTATSF1-203ENST00000448450 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
HTATSF1-203ENST00000448450 RAPGEF3O95398 923 aa40.76■■■■■ 4.12
HTATSF1-203ENST00000448450 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.74■■■■■ 4.11
HTATSF1-203ENST00000448450 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.74■■■■■ 4.11
HTATSF1-203ENST00000448450 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.7■■■■■ 4.11
HTATSF1-203ENST00000448450 PTPRMP28827 1452 aa40.67■■■■■ 4.1
HTATSF1-203ENST00000448450 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.64■■■■■ 4.1
HTATSF1-203ENST00000448450 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.63■■■■■ 4.09
HTATSF1-203ENST00000448450 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.62■■■■■ 4.09
HTATSF1-203ENST00000448450 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.59■■■■■ 4.09
HTATSF1-203ENST00000448450 RICTORQ6R327 1708 aa40.58■■■■■ 4.09
HTATSF1-203ENST00000448450 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 MADDQ8WXG6 1647 aa40.56■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 FANCAO15360 1455 aa40.55■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.54■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 FMN1Q68DA7 1419 aa40.52■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 AKNAQ7Z591 1439 aa40.52■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.52■■■■■ 4.08
HTATSF1-203ENST00000448450 CLIP1P30622 1438 aa40.44■■■■■ 4.06
HTATSF1-203ENST00000448450 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40.43■■■■■ 4.06
HTATSF1-203ENST00000448450 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.43■■■■■ 4.06
HTATSF1-203ENST00000448450 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
HTATSF1-203ENST00000448450 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
HTATSF1-203ENST00000448450 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
HTATSF1-203ENST00000448450 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.37■■■■■ 4.05
HTATSF1-203ENST00000448450 POGZQ7Z3K3 1410 aa40.34■■■■■ 4.05
HTATSF1-203ENST00000448450 LMTK3Q96Q04 1460 aa40.33■■■■■ 4.05
HTATSF1-203ENST00000448450 HECW1Q76N89 1606 aa40.32■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms