RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446817.1

HLA-V-202, Transcript of major histocompatibility complex, class I, V (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene HLA-V, Length 847 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-V-202ENST00000446817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.73■■■■■ 4.91
HLA-V-202ENST00000446817 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP45.56■■■■■ 4.88
HLA-V-202ENST00000446817 FAM69CQ0P6D2 419 aa45.47■■■■■ 4.87
HLA-V-202ENST00000446817 ABCC10Q5T3U5 1492 aa45.46■■■■■ 4.87
HLA-V-202ENST00000446817 ADCY10Q96PN6 1610 aa45.45■■■■■ 4.87
HLA-V-202ENST00000446817 MAPKBP1O60336 1514 aa45.45■■■■■ 4.87
HLA-V-202ENST00000446817 CUL7Q14999 1698 aa45.42■■■■■ 4.86
HLA-V-202ENST00000446817 DIP2BQ9P265 1576 aa45.4■■■■■ 4.86
HLA-V-202ENST00000446817 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa45.38■■■■■ 4.86
HLA-V-202ENST00000446817 KIF27Q86VH2 1401 aa45.34■■■■■ 4.85
HLA-V-202ENST00000446817 IGF1RP08069 1367 aa45.3■■■■■ 4.84
HLA-V-202ENST00000446817 TSPOAP1O95153 1857 aa45.29■■■■■ 4.84
HLA-V-202ENST00000446817 KDM6BO15054 1643 aa45.2■■■■■ 4.83
HLA-V-202ENST00000446817 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP45.09■■■■■ 4.81
HLA-V-202ENST00000446817 PTPRGP23470 1445 aa45.08■■■■■ 4.81
HLA-V-202ENST00000446817 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.05■■■■■ 4.8
HLA-V-202ENST00000446817 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa45.01■■■■■ 4.8
HLA-V-202ENST00000446817 IQGAP2Q13576 1575 aa44.96■■■■■ 4.79
HLA-V-202ENST00000446817 TNIKQ9UKE5 1360 aa44.94■■■■■ 4.79
HLA-V-202ENST00000446817 ABCC2Q92887 1545 aa44.91■■■■■ 4.78
HLA-V-202ENST00000446817 ASXL2Q76L83 1435 aa44.82■■■■■ 4.77
HLA-V-202ENST00000446817 PLB1Q6P1J6 1458 aa44.8■■■■■ 4.76
HLA-V-202ENST00000446817 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa44.8■■■■■ 4.76
HLA-V-202ENST00000446817 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP44.76■■■■■ 4.76
HLA-V-202ENST00000446817 GLI2P10070 1586 aa44.75■■■■■ 4.75
HLA-V-202ENST00000446817 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa44.74■■■■■ 4.75
HLA-V-202ENST00000446817 UACAQ9BZF9 1416 aa44.72■■■■■ 4.75
HLA-V-202ENST00000446817 DISP1Q96F81 1524 aa44.69■■■■■ 4.74
HLA-V-202ENST00000446817 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa44.6■■■■■ 4.73
HLA-V-202ENST00000446817 UGGT2Q9NYU1 1516 aa44.58■■■■■ 4.73
HLA-V-202ENST00000446817 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP44.57■■■■■ 4.73
HLA-V-202ENST00000446817 KDM5BQ9UGL1 1544 aa44.55■■■■■ 4.72
HLA-V-202ENST00000446817 KIAA0556O60303 1618 aa44.55■■■■■ 4.72
HLA-V-202ENST00000446817 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa44.54■■■■■ 4.72
HLA-V-202ENST00000446817 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
HLA-V-202ENST00000446817 TEX14Q8IWB6 1497 aa44.45■■■■■ 4.71
HLA-V-202ENST00000446817 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa44.45■■■■■ 4.71
HLA-V-202ENST00000446817 ADGRL1O94910 1474 aa44.43■■■■■ 4.7
HLA-V-202ENST00000446817 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP44.36■■■■■ 4.69
HLA-V-202ENST00000446817 WDR7Q9Y4E6 1490 aa44.3■■■■■ 4.68
HLA-V-202ENST00000446817 GOLGA3Q08378 1498 aa44.23■■■■■ 4.67
HLA-V-202ENST00000446817 CFAP43Q8NDM7 1665 aa44.19■■■■■ 4.66
HLA-V-202ENST00000446817 ABCA8O94911 1581 aa44.13■■■■■ 4.65
HLA-V-202ENST00000446817 KCNH8Q96L42 1107 aa44.09■■■■■ 4.65
HLA-V-202ENST00000446817 CD109Q6YHK3 1445 aa44.08■■■■■ 4.65
HLA-V-202ENST00000446817 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa44.05■■■■■ 4.64
HLA-V-202ENST00000446817 HECW2Q9P2P5 1572 aa44.01■■■■■ 4.64
HLA-V-202ENST00000446817 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP44.01■■■■■ 4.64
HLA-V-202ENST00000446817 PRXQ9BXM0 1461 aa43.95■■■■■ 4.63
HLA-V-202ENST00000446817 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
HLA-V-202ENST00000446817 KIF21BO75037 1637 aa43.86■■■■■ 4.61
HLA-V-202ENST00000446817 ARID3CA6NKF2 412 aa43.83■■■■■ 4.61
HLA-V-202ENST00000446817 P3H3Q8IVL6 736 aa43.79■■■■■ 4.6
HLA-V-202ENST00000446817 ATP10BO94823 1461 aa43.72■■■■■ 4.59
HLA-V-202ENST00000446817 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.72■■■■■ 4.59
HLA-V-202ENST00000446817 ABCA9Q8IUA7 1624 aa43.69■■■■■ 4.58
HLA-V-202ENST00000446817 SAMD9Q5K651 1589 aa43.64■■■■■ 4.58
HLA-V-202ENST00000446817 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa43.64■■■■■ 4.58
HLA-V-202ENST00000446817 PHLDB1Q86UU1 1377 aa43.57■■■■■ 4.57
HLA-V-202ENST00000446817 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
HLA-V-202ENST00000446817 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
HLA-V-202ENST00000446817 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.51■■■■■ 4.56
HLA-V-202ENST00000446817 NEO1Q92859 1461 aa43.48■■■■■ 4.55
HLA-V-202ENST00000446817 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.46■■■■■ 4.55
HLA-V-202ENST00000446817 RAPGEF3O95398 923 aa43.45■■■■■ 4.55
HLA-V-202ENST00000446817 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP43.4■■■■■ 4.54
HLA-V-202ENST00000446817 PTPRMP28827 1452 aa43.38■■■■■ 4.54
HLA-V-202ENST00000446817 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
HLA-V-202ENST00000446817 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa43.37■■■■■ 4.53
HLA-V-202ENST00000446817 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.36■■■■■ 4.53
HLA-V-202ENST00000446817 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.33■■■■■ 4.53
HLA-V-202ENST00000446817 FHOD3Q2V2M9 1422 aa43.31■■■■■ 4.52
HLA-V-202ENST00000446817 MADDQ8WXG6 1647 aa43.29■■■■■ 4.52
HLA-V-202ENST00000446817 EEA1Q15075 1411 aa43.26■■■■■ 4.52
HLA-V-202ENST00000446817 PLEKHD1A6NEE1 506 aa43.23■■■■■ 4.51
HLA-V-202ENST00000446817 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.23■■■■■ 4.51
HLA-V-202ENST00000446817 RICTORQ6R327 1708 aa43.22■■■■■ 4.51
HLA-V-202ENST00000446817 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43.21■■■■■ 4.51
HLA-V-202ENST00000446817 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
HLA-V-202ENST00000446817 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP43.17■■■■■ 4.5
HLA-V-202ENST00000446817 AKNAQ7Z591 1439 aa43.14■■■■■ 4.5
HLA-V-202ENST00000446817 FANCAO15360 1455 aa43.13■■■■■ 4.49
HLA-V-202ENST00000446817 EFCAB5A4FU69 1503 aa43.12■■■■■ 4.49
HLA-V-202ENST00000446817 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP43.12■■■■■ 4.49
HLA-V-202ENST00000446817 FBXO41Q8TF61 875 aa43.11■■■■■ 4.49
HLA-V-202ENST00000446817 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP43.11■■■■■ 4.49
HLA-V-202ENST00000446817 TTC37Q6PGP7 1564 aa43.09■■■■■ 4.49
HLA-V-202ENST00000446817 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.01■■■■■ 4.48
HLA-V-202ENST00000446817 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.99■■■■■ 4.47
HLA-V-202ENST00000446817 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.98■■■■■ 4.47
HLA-V-202ENST00000446817 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.98■■■■■ 4.47
HLA-V-202ENST00000446817 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
HLA-V-202ENST00000446817 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.94■■■■■ 4.46
HLA-V-202ENST00000446817 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.91■■■■■ 4.46
HLA-V-202ENST00000446817 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.88■■■■■ 4.46
HLA-V-202ENST00000446817 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.88■■■■■ 4.46
HLA-V-202ENST00000446817 HECW1Q76N89 1606 aa42.88■■■■■ 4.45
HLA-V-202ENST00000446817 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.87■■■■■ 4.45
HLA-V-202ENST00000446817 MYO5CQ9NQX4 1742 aa42.83■■■■■ 4.45
HLA-V-202ENST00000446817 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP42.82■■■■■ 4.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms