RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445180.2

LINC01648-201, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1648, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC01648, Length 1,519 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01648-201ENST00000445180 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.94■■□□□ 1.26
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LINC01648-201ENST00000445180 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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LINC01648-201ENST00000445180 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.85■■□□□ 1.25
LINC01648-201ENST00000445180 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
LINC01648-201ENST00000445180 GRIN2AQ12879 1464 aa22.84■■□□□ 1.25
LINC01648-201ENST00000445180 APLP2Q06481 763 aa22.84■■□□□ 1.25
LINC01648-201ENST00000445180 P3H3Q8IVL6 736 aa22.81■■□□□ 1.24
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LINC01648-201ENST00000445180 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.75■■□□□ 1.23
LINC01648-201ENST00000445180 SAMD9Q5K651 1589 aa22.75■■□□□ 1.23
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LINC01648-201ENST00000445180 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.7■■□□□ 1.23
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LINC01648-201ENST00000445180 CEP170Q5SW79 1584 aa22.67■■□□□ 1.22
LINC01648-201ENST00000445180 MAP3K1Q13233 1512 aa22.65■■□□□ 1.22
LINC01648-201ENST00000445180 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.64■■□□□ 1.22
LINC01648-201ENST00000445180 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
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LINC01648-201ENST00000445180 TIAM1Q13009 1591 aa22.55■■□□□ 1.2
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LINC01648-201ENST00000445180 CHD1O14646 1710 aa22.51■■□□□ 1.19
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LINC01648-201ENST00000445180 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.48■■□□□ 1.19
LINC01648-201ENST00000445180 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.45■■□□□ 1.18
LINC01648-201ENST00000445180 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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LINC01648-201ENST00000445180 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.38■■□□□ 1.17
LINC01648-201ENST00000445180 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
LINC01648-201ENST00000445180 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
LINC01648-201ENST00000445180 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.35■■□□□ 1.17
LINC01648-201ENST00000445180 SHROOM2Q13796 1616 aa22.34■■□□□ 1.17
LINC01648-201ENST00000445180 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.34■■□□□ 1.17
LINC01648-201ENST00000445180 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.31■■□□□ 1.16
LINC01648-201ENST00000445180 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.31■■□□□ 1.16
LINC01648-201ENST00000445180 HRCP23327 699 aa22.31■■□□□ 1.16
LINC01648-201ENST00000445180 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.3■■□□□ 1.16
LINC01648-201ENST00000445180 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
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LINC01648-201ENST00000445180 PTPRGP23470 1445 aa22.28■■□□□ 1.16
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LINC01648-201ENST00000445180 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.25■■□□□ 1.15
LINC01648-201ENST00000445180 ABCA8O94911 1581 aa22.23■■□□□ 1.15
LINC01648-201ENST00000445180 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LINC01648-201ENST00000445180 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.23■■□□□ 1.15
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LINC01648-201ENST00000445180 ATP10BO94823 1461 aa22.14■■□□□ 1.13
LINC01648-201ENST00000445180 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.14■■□□□ 1.13
LINC01648-201ENST00000445180 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.13■■□□□ 1.13
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LINC01648-201ENST00000445180 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
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LINC01648-201ENST00000445180 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
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LINC01648-201ENST00000445180 PTPRKQ15262 1439 aa21.89■■□□□ 1.09
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LINC01648-201ENST00000445180 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.85■■□□□ 1.09
LINC01648-201ENST00000445180 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.84■■□□□ 1.09
LINC01648-201ENST00000445180 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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LINC01648-201ENST00000445180 HFM1A2PYH4 1435 aa21.8■■□□□ 1.08
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LINC01648-201ENST00000445180 KCNH8Q96L42 1107 aa21.77■■□□□ 1.08
LINC01648-201ENST00000445180 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
LINC01648-201ENST00000445180 ABCC5O15440 1437 aa21.77■■□□□ 1.08
LINC01648-201ENST00000445180 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.77■■□□□ 1.08
LINC01648-201ENST00000445180 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.76■■□□□ 1.07
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