RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442396.6

ZNF839-202, Transcript of zinc finger protein 839, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene ZNF839, Length 2,987 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839-202ENST00000442396 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.29■■□□□ 1.8
ZNF839-202ENST00000442396 TOP2BQ02880 1626 aa26.27■■□□□ 1.8
ZNF839-202ENST00000442396 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.26■■□□□ 1.79
ZNF839-202ENST00000442396 CCER2I3L3R5 266 aa26.26■■□□□ 1.79
ZNF839-202ENST00000442396 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.22■■□□□ 1.79
ZNF839-202ENST00000442396 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.21■■□□□ 1.79
ZNF839-202ENST00000442396 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.21■■□□□ 1.79
ZNF839-202ENST00000442396 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
ZNF839-202ENST00000442396 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
ZNF839-202ENST00000442396 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
ZNF839-202ENST00000442396 FANCIQ9NVI1 1328 aa26.12■■□□□ 1.77
ZNF839-202ENST00000442396 KIF27Q86VH2 1401 aa26.1■■□□□ 1.77
ZNF839-202ENST00000442396 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.1■■□□□ 1.77
ZNF839-202ENST00000442396 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.06■■□□□ 1.76
ZNF839-202ENST00000442396 P3H3Q8IVL6 736 aa26.04■■□□□ 1.76
ZNF839-202ENST00000442396 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa26.01■■□□□ 1.76
ZNF839-202ENST00000442396 TONSLQ96HA7 1378 aa26.01■■□□□ 1.75
ZNF839-202ENST00000442396 TIAM1Q13009 1591 aa26■■□□□ 1.75
ZNF839-202ENST00000442396 CUX1P39880 1505 aa25.97■■□□□ 1.75
ZNF839-202ENST00000442396 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.97■■□□□ 1.75
ZNF839-202ENST00000442396 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
ZNF839-202ENST00000442396 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.91■■□□□ 1.74
ZNF839-202ENST00000442396 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.87■■□□□ 1.73
ZNF839-202ENST00000442396 NBR1Q14596 966 aa25.87■■□□□ 1.73
ZNF839-202ENST00000442396 CCDC184Q52MB2 194 aa25.82■■□□□ 1.72
ZNF839-202ENST00000442396 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.81■■□□□ 1.72
ZNF839-202ENST00000442396 MAP3K1Q13233 1512 aa25.79■■□□□ 1.72
ZNF839-202ENST00000442396 IGF1RP08069 1367 aa25.78■■□□□ 1.72
ZNF839-202ENST00000442396 WASHC2AQ641Q2 1341 aa25.74■■□□□ 1.71
ZNF839-202ENST00000442396 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.74■■□□□ 1.71
ZNF839-202ENST00000442396 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.74■■□□□ 1.71
ZNF839-202ENST00000442396 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
ZNF839-202ENST00000442396 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
ZNF839-202ENST00000442396 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ZNF839-202ENST00000442396 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.71■■□□□ 1.71
ZNF839-202ENST00000442396 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.7■■□□□ 1.7
ZNF839-202ENST00000442396 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.7■■□□□ 1.7
ZNF839-202ENST00000442396 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
ZNF839-202ENST00000442396 FHOD3Q2V2M9 1422 aa25.67■■□□□ 1.7
ZNF839-202ENST00000442396 MRS2Q9HD23 443 aa25.66■■□□□ 1.7
ZNF839-202ENST00000442396 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
ZNF839-202ENST00000442396 UACAQ9BZF9 1416 aa25.6■■□□□ 1.69
ZNF839-202ENST00000442396 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
ZNF839-202ENST00000442396 CFAP43Q8NDM7 1665 aa25.59■■□□□ 1.69
ZNF839-202ENST00000442396 PTPRKQ15262 1439 aa25.59■■□□□ 1.69
ZNF839-202ENST00000442396 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.58■■□□□ 1.69
ZNF839-202ENST00000442396 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.58■■□□□ 1.69
ZNF839-202ENST00000442396 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.57■■□□□ 1.68
ZNF839-202ENST00000442396 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
ZNF839-202ENST00000442396 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.681e-6■■□□□ 13.1
ZNF839-202ENST00000442396 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
ZNF839-202ENST00000442396 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.53■■□□□ 1.68
ZNF839-202ENST00000442396 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.53■■□□□ 1.68
ZNF839-202ENST00000442396 CFTRP13569 1480 aa25.52■■□□□ 1.68
ZNF839-202ENST00000442396 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.52■■□□□ 1.68
ZNF839-202ENST00000442396 HFM1A2PYH4 1435 aa25.52■■□□□ 1.68
ZNF839-202ENST00000442396 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.51■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.51■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.49■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.48■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.47■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 NAIPQ13075 1403 aa25.47■■□□□ 1.67
ZNF839-202ENST00000442396 AKNAQ7Z591 1439 aa25.45■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.45■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 FOXD1Q16676 465 aa25.44■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.43■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.43■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 NCAPD3P42695 1498 aa25.41■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.41■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 FMN1Q68DA7 1419 aa25.4■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 CCDC7Q96M83 1385 aa25.4■■□□□ 1.66
ZNF839-202ENST00000442396 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.39■■□□□ 1.65
ZNF839-202ENST00000442396 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.39■■□□□ 1.65
ZNF839-202ENST00000442396 NCOA2Q15596 1464 aa25.39■■□□□ 1.65
ZNF839-202ENST00000442396 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ZNF839-202ENST00000442396 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ZNF839-202ENST00000442396 HMGXB3Q12766 1538 aa25.37■■□□□ 1.65
ZNF839-202ENST00000442396 IL27Q8NEV9 243 aa25.34■■□□□ 1.65
ZNF839-202ENST00000442396 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ZNF839-202ENST00000442396 NCOA1Q15788 1441 aa25.3■■□□□ 1.64
ZNF839-202ENST00000442396 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.29■■□□□ 1.64
ZNF839-202ENST00000442396 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.29■■□□□ 1.64
ZNF839-202ENST00000442396 NUDCQ9Y266 331 aa25.29■■□□□ 1.64
ZNF839-202ENST00000442396 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.29■■□□□ 1.64
ZNF839-202ENST00000442396 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.28■■□□□ 1.64
ZNF839-202ENST00000442396 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
ZNF839-202ENST00000442396 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ZNF839-202ENST00000442396 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
ZNF839-202ENST00000442396 EFCAB5A4FU69 1503 aa25.23■■□□□ 1.63
ZNF839-202ENST00000442396 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.22■■□□□ 1.63
ZNF839-202ENST00000442396 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.2■■□□□ 1.62
ZNF839-202ENST00000442396 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.17■■□□□ 1.62
ZNF839-202ENST00000442396 ARID3CA6NKF2 412 aa25.17■■□□□ 1.62
ZNF839-202ENST00000442396 NEFMP07197 916 aa25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms