RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.89■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.86■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.85■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 NEFMP07197 916 aa21.84■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.82■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.81■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 TMC1Q8TDI8 760 aa21.8■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 MRS2Q9HD23 443 aa21.77■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.77■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.76■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 SMARCA4P51532 1647 aa21.75■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 KCNH8Q96L42 1107 aa21.73■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.73■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.73■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.7■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.69■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.68■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.67■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.66■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
C9orf172-201ENST00000436881 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
C9orf172-201ENST00000436881 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
C9orf172-201ENST00000436881 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
C9orf172-201ENST00000436881 RGL3Q3MIN7 710 aa21.58■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.57■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.56■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 FMN1Q68DA7 1419 aa21.55■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.55■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.54■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.53■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 SLC24A1O60721 1099 aa21.51■■□□□ 1.03
C9orf172-201ENST00000436881 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
C9orf172-201ENST00000436881 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.5■■□□□ 1.03
C9orf172-201ENST00000436881 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
C9orf172-201ENST00000436881 CDCA8Q53HL2 280 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 BCL11AQ9H165 835 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
C9orf172-201ENST00000436881 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf172-201ENST00000436881 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.34■■□□□ 1.01
C9orf172-201ENST00000436881 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.33■■□□□ 1.01
C9orf172-201ENST00000436881 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.29■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 NCAPD3P42695 1498 aa21.29■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 CCER2I3L3R5 266 aa21.29■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.28■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 PKD2Q13563 968 aa21.27■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.27■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 OSCARQ8IYS5 282 aa21.25■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 IGF1RP08069 1367 aa21.24■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 NBR1Q14596 966 aa21.23■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 KIF21BO75037 1637 aa21.22■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 CFAP53Q96M91 514 aa21.22■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 FOXD1Q16676 465 aa21.2■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.2■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 TMF1P82094 1093 aa21.18■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 KANK1Q14678 1352 aa21.18■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 JPH4Q96JJ6 628 aa21.18■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.17■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.17■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.17■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 NUP155O75694 1391 aa21.16■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.15■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.13■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.13■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 SYNJ1O43426 1573 aa21.11■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.1■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.1■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.07■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.07■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 POGKQ9P215 609 aa21.06■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.06■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 NUDCQ9Y266 331 aa21.04■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.03■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 CFTRP13569 1480 aa21.02■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.02■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 GGT6Q6P531 493 aa21■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 ARAP1Q96P48 1450 aa21■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 NEUROD2Q15784 382 aa20.99■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms