RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.89■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.86■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.85■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 NEFMP07197 916 aa21.84■■□□□ 1.09
C9orf172-201ENST00000436881 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.82■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.81■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 TMC1Q8TDI8 760 aa21.8■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 MRS2Q9HD23 443 aa21.77■■□□□ 1.08
C9orf172-201ENST00000436881 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.77■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.76■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 SMARCA4P51532 1647 aa21.75■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 KCNH8Q96L42 1107 aa21.73■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.73■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.73■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
C9orf172-201ENST00000436881 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.7■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.69■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.68■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.67■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.66■■□□□ 1.06
C9orf172-201ENST00000436881 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
C9orf172-201ENST00000436881 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
C9orf172-201ENST00000436881 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
C9orf172-201ENST00000436881 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
C9orf172-201ENST00000436881 RGL3Q3MIN7 710 aa21.58■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.57■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.56■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 FMN1Q68DA7 1419 aa21.55■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.55■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.54■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.53■■□□□ 1.04
C9orf172-201ENST00000436881 SLC24A1O60721 1099 aa21.51■■□□□ 1.03
C9orf172-201ENST00000436881 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
C9orf172-201ENST00000436881 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.5■■□□□ 1.03
C9orf172-201ENST00000436881 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
C9orf172-201ENST00000436881 CDCA8Q53HL2 280 aa21.44■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.43■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 BCL11AQ9H165 835 aa21.42■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.41■■□□□ 1.02
C9orf172-201ENST00000436881 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
C9orf172-201ENST00000436881 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.36■■□□□ 1.01
C9orf172-201ENST00000436881 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.34■■□□□ 1.01
C9orf172-201ENST00000436881 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.33■■□□□ 1.01
C9orf172-201ENST00000436881 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.29■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 NCAPD3P42695 1498 aa21.29■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 CCER2I3L3R5 266 aa21.29■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.28■■□□□ 1
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C9orf172-201ENST00000436881 PKD2Q13563 968 aa21.27■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.27■■□□□ 1
C9orf172-201ENST00000436881 OSCARQ8IYS5 282 aa21.25■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 IGF1RP08069 1367 aa21.24■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 NBR1Q14596 966 aa21.23■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 KIF21BO75037 1637 aa21.22■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 CFAP53Q96M91 514 aa21.22■□□□□ 0.99
C9orf172-201ENST00000436881 FOXD1Q16676 465 aa21.2■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.2■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 TMF1P82094 1093 aa21.18■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 KANK1Q14678 1352 aa21.18■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 JPH4Q96JJ6 628 aa21.18■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.17■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.17■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.17■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 NUP155O75694 1391 aa21.16■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.15■□□□□ 0.98
C9orf172-201ENST00000436881 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.13■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.13■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 SYNJ1O43426 1573 aa21.11■□□□□ 0.97
C9orf172-201ENST00000436881 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.1■□□□□ 0.97
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C9orf172-201ENST00000436881 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.07■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.07■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 POGKQ9P215 609 aa21.06■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.06■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 NUDCQ9Y266 331 aa21.04■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.03■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.02■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 CFTRP13569 1480 aa21.02■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.02■□□□□ 0.96
C9orf172-201ENST00000436881 GGT6Q6P531 493 aa21■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 ARAP1Q96P48 1450 aa21■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 NEUROD2Q15784 382 aa20.99■□□□□ 0.95
C9orf172-201ENST00000436881 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
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