RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435576.2

TRABD2B-201, Transcript of TraB domain containing 2B, humanhuman

TSL 3

Gene TRABD2B, Length 619 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2B-201ENST00000435576 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.15■■□□□ 1.3
TRABD2B-201ENST00000435576 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.13■■□□□ 1.29
TRABD2B-201ENST00000435576 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.11■■□□□ 1.29
TRABD2B-201ENST00000435576 PRXQ9BXM0 1461 aa23.1■■□□□ 1.29
TRABD2B-201ENST00000435576 JPH4Q96JJ6 628 aa23.09■■□□□ 1.29
TRABD2B-201ENST00000435576 EEA1Q15075 1411 aa23.06■■□□□ 1.28
TRABD2B-201ENST00000435576 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TRABD2B-201ENST00000435576 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.04■■□□□ 1.28
TRABD2B-201ENST00000435576 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
TRABD2B-201ENST00000435576 IQGAP2Q13576 1575 aa23.01■■□□□ 1.27
TRABD2B-201ENST00000435576 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TRABD2B-201ENST00000435576 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa22.99■■□□□ 1.27
TRABD2B-201ENST00000435576 UGGT2Q9NYU1 1516 aa22.89■■□□□ 1.26
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TRABD2B-201ENST00000435576 DISP1Q96F81 1524 aa22.87■■□□□ 1.25
TRABD2B-201ENST00000435576 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.83■■□□□ 1.25
TRABD2B-201ENST00000435576 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TRABD2B-201ENST00000435576 KIAA0556O60303 1618 aa22.82■■□□□ 1.24
TRABD2B-201ENST00000435576 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.79■■□□□ 1.24
TRABD2B-201ENST00000435576 PTPRGP23470 1445 aa22.76■■□□□ 1.23
TRABD2B-201ENST00000435576 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.76■■□□□ 1.23
TRABD2B-201ENST00000435576 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TRABD2B-201ENST00000435576 GOLGA3Q08378 1498 aa22.72■■□□□ 1.23
TRABD2B-201ENST00000435576 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.71■■□□□ 1.23
TRABD2B-201ENST00000435576 SAMD9Q5K651 1589 aa22.68■■□□□ 1.22
TRABD2B-201ENST00000435576 UACAQ9BZF9 1416 aa22.63■■□□□ 1.21
TRABD2B-201ENST00000435576 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.62■■□□□ 1.21
TRABD2B-201ENST00000435576 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TRABD2B-201ENST00000435576 P3H3Q8IVL6 736 aa22.61■■□□□ 1.21
TRABD2B-201ENST00000435576 ABCC2Q92887 1545 aa22.61■■□□□ 1.21
TRABD2B-201ENST00000435576 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
TRABD2B-201ENST00000435576 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.58■■□□□ 1.2
TRABD2B-201ENST00000435576 MAPKBP1O60336 1514 aa22.57■■□□□ 1.2
TRABD2B-201ENST00000435576 ABCA8O94911 1581 aa22.57■■□□□ 1.2
TRABD2B-201ENST00000435576 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
TRABD2B-201ENST00000435576 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.54■■□□□ 1.2
TRABD2B-201ENST00000435576 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.53■■□□□ 1.2
TRABD2B-201ENST00000435576 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.52■■□□□ 1.2
TRABD2B-201ENST00000435576 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.52■■□□□ 1.19
TRABD2B-201ENST00000435576 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
TRABD2B-201ENST00000435576 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.47■■□□□ 1.19
TRABD2B-201ENST00000435576 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.46■■□□□ 1.19
TRABD2B-201ENST00000435576 DIP2BQ9P265 1576 aa22.46■■□□□ 1.19
TRABD2B-201ENST00000435576 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.46■■□□□ 1.19
TRABD2B-201ENST00000435576 ASXL2Q76L83 1435 aa22.44■■□□□ 1.18
TRABD2B-201ENST00000435576 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.38■■□□□ 1.17
TRABD2B-201ENST00000435576 ATP10BO94823 1461 aa22.37■■□□□ 1.17
TRABD2B-201ENST00000435576 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
TRABD2B-201ENST00000435576 ARID3CA6NKF2 412 aa22.35■■□□□ 1.17
TRABD2B-201ENST00000435576 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.33■■□□□ 1.16
TRABD2B-201ENST00000435576 GLI2P10070 1586 aa22.32■■□□□ 1.16
TRABD2B-201ENST00000435576 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRABD2B-201ENST00000435576 FMN1Q68DA7 1419 aa22.31■■□□□ 1.16
TRABD2B-201ENST00000435576 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.3■■□□□ 1.16
TRABD2B-201ENST00000435576 TSPOAP1O95153 1857 aa22.3■■□□□ 1.16
TRABD2B-201ENST00000435576 CLIP1P30622 1438 aa22.3■■□□□ 1.16
TRABD2B-201ENST00000435576 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.24■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 HECW1Q76N89 1606 aa22.24■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.23■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 CEP162Q5TB80 1403 aa22.22■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 KCNH8Q96L42 1107 aa22.21■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
TRABD2B-201ENST00000435576 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
TRABD2B-201ENST00000435576 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.17■■□□□ 1.14
TRABD2B-201ENST00000435576 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.16■■□□□ 1.14
TRABD2B-201ENST00000435576 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.13■■□□□ 1.13
TRABD2B-201ENST00000435576 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.11■■□□□ 1.13
TRABD2B-201ENST00000435576 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.11■■□□□ 1.13
TRABD2B-201ENST00000435576 CD109Q6YHK3 1445 aa22.11■■□□□ 1.13
TRABD2B-201ENST00000435576 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.07■■□□□ 1.12
TRABD2B-201ENST00000435576 KDM6BO15054 1643 aa22.07■■□□□ 1.12
TRABD2B-201ENST00000435576 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.07■■□□□ 1.12
TRABD2B-201ENST00000435576 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.06■■□□□ 1.12
TRABD2B-201ENST00000435576 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
TRABD2B-201ENST00000435576 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.03■■□□□ 1.12
TRABD2B-201ENST00000435576 KIF14Q15058 1648 aa22.01■■□□□ 1.11
TRABD2B-201ENST00000435576 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRABD2B-201ENST00000435576 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRABD2B-201ENST00000435576 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
TRABD2B-201ENST00000435576 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.95■■□□□ 1.1
TRABD2B-201ENST00000435576 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.92■■□□□ 1.1
TRABD2B-201ENST00000435576 NEO1Q92859 1461 aa21.9■■□□□ 1.1
TRABD2B-201ENST00000435576 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.89■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 PLCH2O75038 1416 aa21.88■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 FANCAO15360 1455 aa21.87■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.87■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.86■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.84■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 TIAM1Q13009 1591 aa21.84■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.84■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 AKNAQ7Z591 1439 aa21.83■■□□□ 1.09
TRABD2B-201ENST00000435576 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.83■■□□□ 1.08
TRABD2B-201ENST00000435576 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.82■■□□□ 1.08
TRABD2B-201ENST00000435576 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.81■■□□□ 1.08
TRABD2B-201ENST00000435576 PREX2Q70Z35 1606 aa21.81■■□□□ 1.08
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