RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 IGF1RP08069 1367 aa28.2■■■□□ 2.1
ACTB-205ENST00000432588 CUL7Q14999 1698 aa28.16■■■□□ 2.1
ACTB-205ENST00000432588 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.11■■■□□ 2.09
ACTB-205ENST00000432588 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.03■■■□□ 2.08
ACTB-205ENST00000432588 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.02■■■□□ 2.08
ACTB-205ENST00000432588 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-205ENST00000432588 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.91■■■□□ 2.06
ACTB-205ENST00000432588 MAPKBP1O60336 1514 aa27.9■■■□□ 2.06
ACTB-205ENST00000432588 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa27.87■■■□□ 2.05
ACTB-205ENST00000432588 ABCC10Q5T3U5 1492 aa27.87■■■□□ 2.05
ACTB-205ENST00000432588 FAM69CQ0P6D2 419 aa27.86■■■□□ 2.05
ACTB-205ENST00000432588 PTPRGP23470 1445 aa27.85■■■□□ 2.05
ACTB-205ENST00000432588 IQGAP2Q13576 1575 aa27.84■■■□□ 2.05
ACTB-205ENST00000432588 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
ACTB-205ENST00000432588 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.81■■■□□ 2.04
ACTB-205ENST00000432588 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.78■■■□□ 2.04
ACTB-205ENST00000432588 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
ACTB-205ENST00000432588 DIP2BQ9P265 1576 aa27.77■■■□□ 2.04
ACTB-205ENST00000432588 ABCC2Q92887 1545 aa27.69■■■□□ 2.02
ACTB-205ENST00000432588 DISP1Q96F81 1524 aa27.67■■■□□ 2.02
ACTB-205ENST00000432588 UGGT2Q9NYU1 1516 aa27.66■■■□□ 2.02
ACTB-205ENST00000432588 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa27.64■■■□□ 2.01
ACTB-205ENST00000432588 UACAQ9BZF9 1416 aa27.63■■■□□ 2.01
ACTB-205ENST00000432588 PLB1Q6P1J6 1458 aa27.6■■■□□ 2.01
ACTB-205ENST00000432588 ASXL2Q76L83 1435 aa27.58■■■□□ 2.01
ACTB-205ENST00000432588 KIAA0556O60303 1618 aa27.56■■■□□ 2
ACTB-205ENST00000432588 TSPOAP1O95153 1857 aa27.55■■■□□ 2
ACTB-205ENST00000432588 KDM6BO15054 1643 aa27.55■■■□□ 2
ACTB-205ENST00000432588 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.52■■■□□ 2
ACTB-205ENST00000432588 KDM5BQ9UGL1 1544 aa27.51■■□□□ 1.99
ACTB-205ENST00000432588 GLI2P10070 1586 aa27.49■■□□□ 1.99
ACTB-205ENST00000432588 GOLGA3Q08378 1498 aa27.49■■□□□ 1.99
ACTB-205ENST00000432588 PRXQ9BXM0 1461 aa27.49■■□□□ 1.99
ACTB-205ENST00000432588 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
ACTB-205ENST00000432588 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ACTB-205ENST00000432588 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ACTB-205ENST00000432588 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ACTB-205ENST00000432588 WDR7Q9Y4E6 1490 aa27.33■■□□□ 1.97
ACTB-205ENST00000432588 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.32■■□□□ 1.96
ACTB-205ENST00000432588 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.32■■□□□ 1.96
ACTB-205ENST00000432588 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-205ENST00000432588 ABCA8O94911 1581 aa27.31■■□□□ 1.96
ACTB-205ENST00000432588 EEA1Q15075 1411 aa27.24■■□□□ 1.95
ACTB-205ENST00000432588 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa27.23■■□□□ 1.95
ACTB-205ENST00000432588 P3H3Q8IVL6 736 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-205ENST00000432588 KCNH8Q96L42 1107 aa27.2■■□□□ 1.94
ACTB-205ENST00000432588 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
ACTB-205ENST00000432588 CD109Q6YHK3 1445 aa27.16■■□□□ 1.94
ACTB-205ENST00000432588 CFAP43Q8NDM7 1665 aa27.15■■□□□ 1.94
ACTB-205ENST00000432588 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa27.14■■□□□ 1.94
ACTB-205ENST00000432588 SAMD9Q5K651 1589 aa27.13■■□□□ 1.93
ACTB-205ENST00000432588 ARID3CA6NKF2 412 aa27.1■■□□□ 1.93
ACTB-205ENST00000432588 ATP10BO94823 1461 aa27.09■■□□□ 1.93
ACTB-205ENST00000432588 ADGRL1O94910 1474 aa27.05■■□□□ 1.92
ACTB-205ENST00000432588 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa27.04■■□□□ 1.92
ACTB-205ENST00000432588 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
ACTB-205ENST00000432588 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
ACTB-205ENST00000432588 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
ACTB-205ENST00000432588 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-205ENST00000432588 KIF21BO75037 1637 aa26.97■■□□□ 1.91
ACTB-205ENST00000432588 ABCA9Q8IUA7 1624 aa26.95■■□□□ 1.91
ACTB-205ENST00000432588 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
ACTB-205ENST00000432588 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.93■■□□□ 1.9
ACTB-205ENST00000432588 EFCAB5A4FU69 1503 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-205ENST00000432588 ARAP3Q8WWN8 1544 aa26.92■■□□□ 1.9
ACTB-205ENST00000432588 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.85■■□□□ 1.89
ACTB-205ENST00000432588 NEO1Q92859 1461 aa26.84■■□□□ 1.89
ACTB-205ENST00000432588 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
ACTB-205ENST00000432588 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.81■■□□□ 1.88
ACTB-205ENST00000432588 RAPGEF3O95398 923 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-205ENST00000432588 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.76■■□□□ 1.87
ACTB-205ENST00000432588 FMN1Q68DA7 1419 aa26.7■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.862e-34■■■■□ 20.9
ACTB-205ENST00000432588 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 FANCAO15360 1455 aa26.67■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.66■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 AKNAQ7Z591 1439 aa26.65■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.64■■□□□ 1.86
ACTB-205ENST00000432588 HECW1Q76N89 1606 aa26.63■■□□□ 1.85
ACTB-205ENST00000432588 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.63■■□□□ 1.85
ACTB-205ENST00000432588 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
ACTB-205ENST00000432588 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ACTB-205ENST00000432588 RICTORQ6R327 1708 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTB-205ENST00000432588 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-205ENST00000432588 ADAMTSL3P82987 1691 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTB-205ENST00000432588 PLCH2O75038 1416 aa26.54■■□□□ 1.84
ACTB-205ENST00000432588 PTPRMP28827 1452 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTB-205ENST00000432588 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTB-205ENST00000432588 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.5■■□□□ 1.83
ACTB-205ENST00000432588 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-205ENST00000432588 CLIP1P30622 1438 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTB-205ENST00000432588 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-205ENST00000432588 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
ACTB-205ENST00000432588 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-205ENST00000432588 KIF14Q15058 1648 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTB-205ENST00000432588 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.46■■□□□ 1.83
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