RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432328.2

PCED1B-201, Transcript of PC-esterase domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene PCED1B, Length 1,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1B-201ENST00000432328 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
PCED1B-201ENST00000432328 GRIN2AQ12879 1464 aa23.69■■□□□ 1.38
PCED1B-201ENST00000432328 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.68■■□□□ 1.38
PCED1B-201ENST00000432328 ARAP1Q96P48 1450 aa23.68■■□□□ 1.38
PCED1B-201ENST00000432328 FBLN2P98095 1184 aa23.66■■□□□ 1.38
PCED1B-201ENST00000432328 EFCAB5A4FU69 1503 aa23.59■■□□□ 1.37
PCED1B-201ENST00000432328 IQGAP2Q13576 1575 aa23.58■■□□□ 1.37
PCED1B-201ENST00000432328 P3H3Q8IVL6 736 aa23.58■■□□□ 1.36
PCED1B-201ENST00000432328 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa23.57■■□□□ 1.36
PCED1B-201ENST00000432328 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
PCED1B-201ENST00000432328 CEP170Q5SW79 1584 aa23.53■■□□□ 1.36
PCED1B-201ENST00000432328 NUP160Q12769 1436 aa23.52■■□□□ 1.35
PCED1B-201ENST00000432328 SAMD9Q5K651 1589 aa23.51■■□□□ 1.35
PCED1B-201ENST00000432328 FHOD3Q2V2M9 1422 aa23.51■■□□□ 1.35
PCED1B-201ENST00000432328 APLP2Q06481 763 aa23.51■■□□□ 1.35
PCED1B-201ENST00000432328 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.47■■□□□ 1.35
PCED1B-201ENST00000432328 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PCED1B-201ENST00000432328 CHD1O14646 1710 aa23.46■■□□□ 1.35
PCED1B-201ENST00000432328 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.43■■□□□ 1.34
PCED1B-201ENST00000432328 FMN1Q68DA7 1419 aa23.41■■□□□ 1.34
PCED1B-201ENST00000432328 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
PCED1B-201ENST00000432328 JPH4Q96JJ6 628 aa23.39■■□□□ 1.33
PCED1B-201ENST00000432328 DISP1Q96F81 1524 aa23.36■■□□□ 1.33
PCED1B-201ENST00000432328 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PCED1B-201ENST00000432328 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa23.34■■□□□ 1.33
PCED1B-201ENST00000432328 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PCED1B-201ENST00000432328 KIAA0556O60303 1618 aa23.34■■□□□ 1.33
PCED1B-201ENST00000432328 FYCO1Q9BQS8 1478 aa23.32■■□□□ 1.32
PCED1B-201ENST00000432328 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.3■■□□□ 1.32
PCED1B-201ENST00000432328 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PCED1B-201ENST00000432328 MAP3K1Q13233 1512 aa23.28■■□□□ 1.32
PCED1B-201ENST00000432328 TIAM1Q13009 1591 aa23.25■■□□□ 1.31
PCED1B-201ENST00000432328 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PCED1B-201ENST00000432328 SHROOM2Q13796 1616 aa23.19■■□□□ 1.3
PCED1B-201ENST00000432328 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.18■■□□□ 1.3
PCED1B-201ENST00000432328 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.18■■□□□ 1.3
PCED1B-201ENST00000432328 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.16■■□□□ 1.3
PCED1B-201ENST00000432328 HECW1Q76N89 1606 aa23.16■■□□□ 1.3
PCED1B-201ENST00000432328 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa23.13■■□□□ 1.29
PCED1B-201ENST00000432328 CCDC18Q5T9S5 1454 aa23.11■■□□□ 1.29
PCED1B-201ENST00000432328 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.1■■□□□ 1.29
PCED1B-201ENST00000432328 OSCARQ8IYS5 282 aa23.09■■□□□ 1.29
PCED1B-201ENST00000432328 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
PCED1B-201ENST00000432328 PTPRGP23470 1445 aa23.08■■□□□ 1.28
PCED1B-201ENST00000432328 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.07■■□□□ 1.28
PCED1B-201ENST00000432328 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.05■■□□□ 1.28
PCED1B-201ENST00000432328 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PCED1B-201ENST00000432328 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.04■■□□□ 1.28
PCED1B-201ENST00000432328 ARID3CA6NKF2 412 aa23.04■■□□□ 1.28
PCED1B-201ENST00000432328 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
PCED1B-201ENST00000432328 ABCA8O94911 1581 aa23■■□□□ 1.27
PCED1B-201ENST00000432328 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PCED1B-201ENST00000432328 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
PCED1B-201ENST00000432328 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.97■■□□□ 1.27
PCED1B-201ENST00000432328 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.96■■□□□ 1.27
PCED1B-201ENST00000432328 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.95■■□□□ 1.26
PCED1B-201ENST00000432328 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
PCED1B-201ENST00000432328 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PCED1B-201ENST00000432328 UACAQ9BZF9 1416 aa22.93■■□□□ 1.26
PCED1B-201ENST00000432328 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PCED1B-201ENST00000432328 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.9■■□□□ 1.26
PCED1B-201ENST00000432328 NCOA2Q15596 1464 aa22.89■■□□□ 1.26
PCED1B-201ENST00000432328 ATP10BO94823 1461 aa22.88■■□□□ 1.25
PCED1B-201ENST00000432328 ABCC2Q92887 1545 aa22.84■■□□□ 1.25
PCED1B-201ENST00000432328 ARHGEF11O15085 1522 aa22.83■■□□□ 1.25
PCED1B-201ENST00000432328 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.83■■□□□ 1.24
PCED1B-201ENST00000432328 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PCED1B-201ENST00000432328 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.8■■□□□ 1.24
PCED1B-201ENST00000432328 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.79■■□□□ 1.24
PCED1B-201ENST00000432328 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.79■■□□□ 1.24
PCED1B-201ENST00000432328 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PCED1B-201ENST00000432328 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
PCED1B-201ENST00000432328 ITGAEP38570 1179 aa22.73■■□□□ 1.23
PCED1B-201ENST00000432328 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.72■■□□□ 1.23
PCED1B-201ENST00000432328 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.71■■□□□ 1.23
PCED1B-201ENST00000432328 KIF14Q15058 1648 aa22.7■■□□□ 1.22
PCED1B-201ENST00000432328 MIA2Q96PC5 1412 aa22.68■■□□□ 1.22
PCED1B-201ENST00000432328 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
PCED1B-201ENST00000432328 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.67■■□□□ 1.22
PCED1B-201ENST00000432328 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PCED1B-201ENST00000432328 HRCP23327 699 aa22.62■■□□□ 1.21
PCED1B-201ENST00000432328 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.62■■□□□ 1.21
PCED1B-201ENST00000432328 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PCED1B-201ENST00000432328 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PCED1B-201ENST00000432328 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.6■■□□□ 1.21
PCED1B-201ENST00000432328 KCNH8Q96L42 1107 aa22.58■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.55■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.54■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 PTPRKQ15262 1439 aa22.52■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
PCED1B-201ENST00000432328 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.51■■□□□ 1.19
PCED1B-201ENST00000432328 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.5■■□□□ 1.19
PCED1B-201ENST00000432328 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.5■■□□□ 1.19
PCED1B-201ENST00000432328 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.49■■□□□ 1.19
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